Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

CERS6-AS1:13

Sequence Length

715 nt

GC Content

0.4042

AGCUUCCAAUAUAGUUGAAAGGACUAUACAAUAUGACGCCAAAAAGAGGGAAGAUAGAGAUGAAAACUACAGGAGGAAAAACUAGAUCUGUAAGAAAAAUUAACGGAGGUAGAUUAAAAAAAAAAGCCAAUGGAGAAUUUGAAAUGCAGUAGAAAUCUUGGCAGCCCACAUCUUCAGAAACAAAUGCAAACACUGGAAUCUGUGUAAUGAACCAGAAUGAGUACGUGGUCUCGCUCUGUGCCCAAGCUGGAGUGCAGUGGUGUAAUCACACCUCACUGCAGCCUUGACCUCCCAGGCUCAAGCAAUCCUCCCAUCUCAGCCUCCCAAGUAACUAGGACUACAGAGAUGCUCAAGCACUGAAUUGUCUUAAGAAAACAAGUAAGGUUUUGUCACCUAUCCUAUUUCUCACUGCAAGUUGAAAAAAAUCAAAUCCAAACACCACCACCCCUUCUAUGACAACAAACGGCUGUGGAGGUAAUCUUAUUUUCCUAAGGGUAGUUUCAUGAUGACAGUGUCAAAAAAUUACUGUGGAUAAAGAAAAAAUUGUCUCAAUGAAAUAGAAUUUUUCACUGAACACAGAAACCAUCUCAAUAGUUGCUGCUCCCUGGUUUCCAGGCCACGCAACAGACAUCAAACCAGGAAGCCAAACUUUCAUGGACCUGUGUUAAGAAAAACACACAUACAUGGGCAUACUACUUUUUCCAGAAAAACGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-160.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -173.46

Frequency: 0.0000

Diversity: 155.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((..(((((((.....)))))))...................(((((((((((((((.........((((((....(((..(((((((......)).)))))..)))..................((((((...((...(((...((....))..)))...))..)))))).............((((........))))......((((..((.(((((.(((...))).))))).))..))))..(((((((((((....)))))..))))))((.(((((((...))).))))))..)))))))))))).((((((..(((...((((((.....((.(((....))))).....))))))(((((....(((.(((......))))))....))))).........((((......))))....................................)))..)))))).....)))))))))..((((.(((((.((.((.(((((...(((((((.((((((((((........)))))).......))))))))))))))))..))))))))).)))).....(((((((...(((((...))))).)).))))).............))))))......((((((....((((((......))))))....))))))...........((((........))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((..(((((((.....)))))))...................((((,(.{.((((((.........((((((....(((..(((((((......)),}))))..))).............{{{,.,((({,.,,((...{{{,,.,{...,))}}))}...||.,}}||||.............{(((.,......)))}......((((..((.(((((.(((...))).))))).))..))))..(((((((((((....))))).,))))))(,{(((((((...))).)))))}..)))))))))))).,,|}}}}.......((((((.....((.(((....))))).....)))))),{,,,....,..,(((,,,,,,}}}},,....|||}}.,.,....,{{{{......}}},........{((.({{(.{{................))..)))),)))...,,|,,},|||,.,|((({((((,.(({({.{{{{|,,,..||||}}|||||||{{|,,,.....}|||}|{{.{{{{|,,,..,,))))),))}.}}}}||,,,.,}},.....(((((((...(((((...))))).)).))))).},,,..,,,,,.))))))......,(((((....((((((......))))))....)))))}...........{(((........))),