Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

DISC1FP1:1

Sequence Length

774 nt

GC Content

0.4147

AGAAGUGCUUAUUUCCCCUUCGCUUUCCACCACGAAUAUUUUUCCUGAGGCCUCCCAGUCAUGCUUCCUGUUUUGCCUGCAGAACUGCAUUUAUGAAGUAGGGACCUGGAAUUGAAGAGACUCCUAAAGGAGAGACAGAAGUUUGAAAGAGCAAGAAGAGUGGAUGUGGAUCCAGACAGAAAAAGAGAACAGCAAAUAUUUGAAAGAGCUUAAGACGUACUCCUCAAGGGGUUUCUCCUUUUGCGUCUUUCUCAUUUCUUUUGCUGCCACCGUGUAAGAAGUGCCUUUUGCCUCCUGCCAUGAUUCUGAGGCCUCCCCAGUCAUGUGGAACUGUACCACAGAUAGAAGCCUUGAGAAGCUUACUUUGGUCAGAAAUUUUGCCUUUGUCUGCAGGCUUCUACCAGUUCGAUUCCAUCUGUGGGUCUUAGGUUUCAGUUACCUGAAGUCAAAUGUGGUCCAAUACACAGACUGGAAUAAGAGACAUUGGAGACUCCAAAAGAAUAUUUUCUGGUAGACUGAUAUAUUUCUCCUAAAAAAUUUGGAAAAAUUUUGUGAUGAAGAAGCUACCUGGGCCUGAAGAUAUCUUUUCUGGACAAAGUAAAUGAAUGAUUGAAGACCUGCAAACUGUGUUUGUAACGACUUUCUAAGAUUGAUAGCCUCCGUGUUUCAAUGCUCAUGGAGCAGAUGGAUAUGACUGACACUGCCCUUAAUACUACAGCAUGAUCCAAAGCAUCACCAAAGUCUUCAAAGAGAAAGUAAAAAAAAAAAAAUGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-191.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -205.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 146.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.(((((((...(((((.((.((((((.((((((((.((((((((..(((((((((((((((((((..((((....))))....)))))))))))...(((.((.....)).)))...(((((.(.((((((...((((((((((((.((((((((....)))))................(((..............)))........(((((....)))))..))).)))))).)))))).((((((((.(((.......))).)))))))).))))))))))))).)))))))..)))))))).((((((.((((....((.(((((((.(((((((((......((..((...((.((((...))))))...))..))))))))))).).....(((.(((....))))))((((((.......)))))).......)))))).))...))))))))))...........(((((...))))).((((....))))((.(((..........)))))..........)))))))))))))).))..))))).....)))((.(((((....))))).)).................((((((((.(((((((...)))))))....((.((.......)).)).(((((((..........)))))))....((((((((.(((..................)))))).))))).............)))))))).)))))))))................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((.(((((((...(((((.((.((((((.((((((((.((((((((..((((((((((((((((((,..((((....)))).....))))))))))...(((.{{.....}}.)))...(((((.(.((((((...({{{{{((({{{.(,,(((((....)))))..,.......,.,..,,{({{.....,|,,,,,{},.,,,..,.(((((....)))))..))),)))))).)))))).{((((({{.|{{,,.....}}}.}))))))).))))))))))))},}))))))..)))))))).((((((.((((....((.(((((({.(((((((((..,,..((..((...((.((({...})))))...)),,}}))))))))).}.....(({{(({....}))))){{,((({{{{{..,,))))}},}...)))))).))...)))))))))).....,,,,..{{(((,.,||||,.{(({....))})||.||,,,........))))}..........)))))))))))))).))..))))).....)))((.(((((....))))).)).................((((((((.(((((((...)))))))..,.{{.,,...,..,}|..{{(((((((..........)))))))}...((((((((.(((..................)))))),})))).............)))))))).)))))))))................