Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
DISC1FP1:3
Sequence Length
796 nt
GC Content
0.3869
GCCUUCCACCAUUAUUGUGAGACUUUCCCAGCCACGUGGAACUGCAUUUAUGAAGUAGGGACCUGGAAUUGAAGAGACUCCUAAAGGAGAGACAGAAGUUUGAAAGAGCAAGAAGAGUGGAUGUGGAUCCAGACAGAAAAAGAGAACAGCAAAUAUUUGAAAGAGCUUAAGACGUACUCCUCAAGGUACCACAGAUAGAAGCCUUGAGAAGCUUACUUUGGUCAGAAAUUUUGCCUUUGUCUGCAGGCUUCUACCAGUUCGAUUCCAUCUGUGGGUCUUAGGUUUCAGUUACCUGAAGUCAAAUGUGGUCCAAUACACAGACUGGAAUAAGAGACAUUGGAGACUCCAAAAGGUGGGCAGAAUAUUUUCUGGUAGACUGAUAUAUUUCUCCUAAAAAAUUUGGAAAAAUUUUGUGAUGAAGAAGCUACCUGGGCCUGAAGAUAUCUUUUCUGAAGAUGGCCAUCUACAAAGUACACAGAGGAUACCCACCUGUCACCGGAUCUGCCAGCACCUUGAUUGUGGACUUUCUUGUCUCCAGAAUCGUGAGACUUGUUUCUGAUCUGCGUGGGAAAGAAUUCAGUAUUUCUCCAUUUAAUAUGACAUUAGCUAUAGAUUUUUUAUAUGAUAUUAGCUAUAGAUUUUUUAUAGAUGCCUUGCAUUAAAGUGAAGAAGCUUCAUUUUCUUCCUAAUAUUCUGAUUUUUUUAUCAUAGAUAUGUUUUAUCUAAUUUAUUGAAAAAAUAAUUUCAAAAAUGUGUGGCCAGGCACGAUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-196.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -211.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 240.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((.....(((.((.....)).)))....))))))..))......(((((.((((...(((((((((..(.((((....))))....(((((((((..(((..(((..(..(((((....)))))..)..............(((((..(((((.((((..((((.....((.((((((((..(.......)..)))))))).))))))))))..)))))...))))))))..))).)))))))))..)..)))))))))(((((((((((((((((.......))))))((((...((((........)))))))).......((((((..(((((.((((.((((((((((((......((((((.(((........((((((((((...)))))....(((((((((((.....((((.((......((((....)))).....)).)))))))).))))))).....))))).........)))))))))))))))..)))))).....)))).)))))))))))((((.(((.((((....))))))))))).((((((((..........)))).)))).......))).....)))))))).........(((((((((((((((...)))))))((((...)))).(((((((((...)))))))))....)))))))).((((......))))((((((.....))))))((((.((((((......))))))))))(((((((((.......)))).)))))......))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{{((((.....,{{,({{.{{{{{{||,..,{|||||,{{{{......,,,||}|((({(((((((((((..{.((((....))))....(((((((((..{{{.,{{{..(..(((((....)))))..}......,,......(((((,.(((((.{(((,,({((.....{{.((((((((..{.......}..)))))))),})))}}}})}..))))).,.)))))}}),,))).)))))))))..}..)))))))))}..,,,}))))|{{{((,,{,,..,})))}{(((...((((........)))))))),,.....((((((..(((((.((((.((((((((((((......((((((.(((.,......,||(((,,,....,},))}...(((((((((((.....((({.{{.{{,..{{((....}}}}.},..)).)))))))).))))))).....}|||....,,.,},)))))))))))))))..))))))...,.)))).))))}))))))((({{,({.,,,...}},))))),))))}||||||||}....,,...,}}},,|||.....}}}....{{{(((,{,{,,........|}}..}}})))|||,...,}}}}}|((((...))))},{(({((((,,.}}}}}})))}}}}}},,,,,..{(((......)))}((((((.....)))))),,{{.((((((......)))))),}}}(((((((((.......)))).))))).,,...,,,}.}},,...
Back