Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
DNAJC27-AS1:12
Sequence Length
255 nt
GC Content
0.5569
UCCCCUGACGGGAAGGCGGCGUUGGGGGGCGGCUGGGUUUACCCUUCGAGAUCUCUGAUGGAUUUGUUGACUCCUCUGUGGGAGAAAGGCUUGGUCUACUGCAGGUGUUAACGCUAAGCCAGGCUGGAGCUGUGGACGUCAGUUUCCUCAGCUCCCCGCUGUUCGCUUCGAACGUGACCUCGACGUCUGCUCUCCCCUUCCCUUUAGCUGACAAUGUGACAGUGCUUGAAUAAAAGUCAGUCUGACAGGAACGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-90.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -96.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 53.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((.((((((((((((((((((..(((....))).((((.(..(((...)))..).))))(((((....)))))...((((((((.....((....))....)))))))).....(((((((.(((........))).))))))))))))(((((...)))))....)))))))).))))).)))).((((..(((((((((.......................))))).))))..))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,.....{(({.((((((((((((({((((..(((....))).||{{,{(((({.,,|||,,,.,,,,{{{{|,,,,})))),..((((((((.,...{{.,,,,....}))}}})))}}})}(((((((.(((........))).)))))))))))}(((((...))))),...)))))))).))))).)))}.((((..(((((((((..,,{..,,....,)}.,},...))))).))))..)))).}}.
Back