Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
DNAJC27-AS1:24
Sequence Length
798 nt
GC Content
0.5301
GACGUCAUCUGCAGGCCCUGGAGACGCGACUGCAGUUACCGAGUUUCUAAGGCCUCGUCCCCUGACGGGAAGGCGGCGUUGGGGGGCGGCUGGGUUUACCCUUCGAGGAGUUAGAAAACACCAGGAAAAGGGUUGUUCCCACCUGGAAGAGAAAUGCUAGAGCAACACACCAUCUUCCUCAACAUUAUCAUCUGUCUCUGGAUGACAAUGAAAUUCACAGGACACUGAUUGUCUUUUUAUCCCAUUGGACAUCGUGAUAGUCUACAAUACUGAUAACACCAUGAUGAUAGGAUCUGAAGACCUGGAAGUACCAGAGGCAGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUGGACGCAAGCAAUCCUCCUGCCUUGACCUGCCAAAGAGCUGGGAUUACUGGCAUCAGCAGGAAGAAGAGAUGGAAGCAACGCCAUGGACCUUCACGUCCUUCAGAGUGUGGGUGGGCUUGGGCUUUGCAGUGAGAGCAAGUAUCACCCAGGAUGGAGAUGGGAGGUAAUGGGUGGCCCCGACAGGUGCCUCCUACUGCUGGCAGCAAGGAGAGAGUGAAGAGGCAGAAUUUCCUUGGUCUAGACUAGAGUCUGGGUCAUGGGCAUGGCAGUGCUUGAGCUUUUGACCAGAAGCAAGUGGACAUGGAUUUGAGCUUCGGGUAAGAAGGGAGACUUCUCUCCAGGGACCAUAGGGGCUGGCAGCUGAAGAAGGUGACUUGGCCCCUCUCUAGAGGGUGAACGCAGGAUCAAUUCAAGGCCAUGAAGUGGAUGCAGCUGGGAGAGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-282.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -297.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(.((((((((((((.(((((((.((...........)).))))))).)))))((((((((((((.........)))))))))))).(((.((((((((((.((((.(((((......(((((....(((.....))).)))))........(((....)))...((((.(((((..............((((((((((....(((((..((....((((((.....))))))...))..)))))..(((((((...(((.........))).....))))))).((((.((....))))))......))))))))))(((...)))..((((((.((.((((((((..........((((((...((((((((((((((((((...(((((((.....))))).))(((((.........((((........))))..((((((.((((.((((.....((((((((((((..(((......)))..))))).)))))))...))))))))))))))..((((.(((.((....)).))).))))))))))))))((((((((...((......))...))))))))..((((((....)))))))))).))))).)).))))))))..(((((.(((.(((((((((........))))..))))).))).)))))(((((....))))).))))))....)).)))))))).))))).))))..))))).))))....)))))))))).)))......((((......)))))))))))).(((.....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,((,(((((((((.(((((((.((...........)).))))))).))))}((((((((((((.........)))))))))))).(((.((((((((((.,,((,(,,....}}|.||..,....(((.....))).(((((,,(((({.(((....))).....,,,{{{{,,{|..{{{{.(((((({,,.,|||}}}}.}}}}.......(((....)))...((((((..((((.{{{{..((({(((.,.(((.........)))..,,,})))}))}).))))..)))))){{{{.....))))||||||((,,,,.,{.{{((((((((,{(({,,,|}..}}|}.|}||||||...,||||||||{{,(((((,...{{(((((.....))))).)},||||}..,,.,,}||||,,{{,..{||||,.((((((.((({{((((...,.(((((({(((((..(((......)))..))))).})))))).,.))))))))))))))..((((.(((.((....)).))).))))|||}|}}}}}((((((((...({......))...)))))))),|((((((....)))))))))).})}))}))}.,)))))..,(((({.{((.(((((,{{{........))))..))))).))).)))))||||}.}))))))))))......(((((((((((.((.....)).)).)},)))))))})),.)))))))))).)))...,..{(({......}))}})))})))}|,|},...,,,.
Back