Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
DNAJC27-AS1:4
Sequence Length
4672 nt
GC Content
0.5077
AGCGCGGGGCUGCUGACGUCAUCUGCAGGCCCUGGAGACGCGACUGCAGUUACCGAGUUUCUAAGGCCUCGUCCCCUGACGGGAAGGCGGCGUUGGGGGGCGGCUGGGUUUACCCUUCGAGAGUCCGUGUGAGAACCGGGACACCUGUCCUGUUGAAAAGGGGGACGCAAAAGCUGAAAAUGCCCGGAAGGAUAUGGCUUCCUUGAACUGCGGGACGUGUAGCUGCAGCUGUGGGGUGGACCAUGGAAACAGAUCAGCAGGAAGAAGAGAUGGAAGCAACGCCAUGGACCUUCACGUCCUUCAGAGUGUGGGUGGGCUUGGGCUUUGCAGUGAGAGCAAGUAUCACCCAGGAUGGAGAUGGGAGGUAAUGGGUGGCCCCGACAGGUGCCUCCUACUGCUGGCAGCAAGGAGAGAGUGAAGAGGCAGAAUUUCCUUGGUCUAGACUAGAGUCUGGGUCAUGGGCAUGGCAGUGCUUGAGCUUUUGACCAGAAGCAAGUGGACAUGGAUUUGAGCUUCGGGUAAGAAGGGAGACUUCUCUCCAGGGACCAUAGGGGCUGGCAGCUGAAGAAGGUGACUUGGCCCCUCUCUAGAGGGUGAACGCAGGAUCAAUUCAAGGCCAUGAAGUGGAUGCAGCUGGGAGAGCCUGCUUGGUGCUUUUAAACCUCAACAUGUCAACCGCAAAUACCUCAAACACUGCUCACACCGUGGUAAAAUCUAGUUGCGAAACCUGUCCCGCGGCAGCCUUCUCCAUCCCAGGUGCCCAGGCCCCAUCUCCUGGGAGCAGGCAGCUCUCCCCACCCCGAUUCAUGUCCCUCCUACAGCCCAAGGCAACUCCCUGCCACCUUGGUGAAUGAAGCACAUCAUGCUGCCCAGGCUUCUGAGCUGUUUGCCGUGUUGCGGAGAUGCAGCCUUCAGCCUUGGAUACCCACCCACUCCUCUACUUGGGCAUUGUUUUCACAGGCUGCUCUUCCCUGUAGCUUCAGAGAAGUAGGUCAAGUAGGUUAACUCGCUUUAAGGGAGAAGUGCCAGGGGUUCAAGUCACCCAGCCUGGAGGCAGGAAUCCUGGGUUCUAUUUUUGGCUUCACAGCUAAUCCGCUGUGUGACAGUCGUUAGGAGCUCAUUCUCCCCUCUGGGUCUCCCUGAGCCCUUCUCUAGGUCCCACAAUUUUUUUUUUUUUCCCUGAAGCUAUAUUCCCUGGACUGUCAUAUUCUUCCCUCUUCCCUCCCUCUGGGAGGUGCUUUAAAGCCGUUGGCUGCUCAAGGCUGGCGCCCUAGGCAAGAGGGGCUGCAGUUGUUGUAGCUGAUGAGGAGGAGAUAAGAGGCUUUUCUGUAGACACAGUUGAGCUGAUGGGCUGUGUGAGGCUGGAGUGCCAGGAAACCAGACUCCUGUAACUACAGGACAGGCCCUGGUGAUGUGAUGAUGGGGAUGUGACGGGGAUGCUGAAGCCUGGAAUGCGAGUGGGGGUUCCUGCGUUUUAUGCAAUGGCUGUAGAUUUCCUCCCACUUCUAAGCCUCCCUUUCUGUGACACGCAGGGAAAUUCAGUCUCUAGUUCAUAUGGAAACUUGGGACCUCACUGUGCUGCUUGCUCUUGGCAGAGGAUAUCAUUUGAGCUGUCAUAGCAGAGGACCACAUUUACCAGGGUGCACUUUGGCCAAAGAAUAGUAACCUUUCUAAGGCUUAGUUCCUCUGGCCUGACCAAACCAGUCCCAGGAGGCCCCUGGGUUCCAGUCAAGGUCAUGGGAGAGGCCCACCAUGGAUGAGGCCUGGGGGAGCAGGGUGGAAAUUAAGUGCCCAGGUAUGUUAUGGAUAGCCUGCAGCCCUCUCCAAUCCCUACCCUCCAAACCCAGUGAAGGGGGACAUGAAACAGGUGAGGCAGAGGAGCAAAUGCGGGUCAAGAAUUCCGAACUAUACUUGACUUACAGUGCAGCUGUGAUGUGCACAUUGGUGUGUGCCACGAGACAGCAUAGUGUGGUGGAAAGAAAAUGGGUUUUGAACAGAGUGUCCUGGGUUUGAAUCUCUGCUUGCCCAUGUACUAGAGAGUAGUCGAACCUCUCUGGGCCUCAAUUUCCCAGAUGUAAAAUGGGAAUAGUAGUACUUACCUUGCACGGGUGCUGAGAGAAUUCCAUGAGACGACACAACCCGUGUAAAGUGCCUGGCAUAGGCAUAUCACAUUAGGGCACUCAGUAAAUGUGAUGUCUUUUCUACUUGCCUUCCUGUCAUACCGGUCCCCAUGUUUUGGAUUUCUGCAGCUAAAGUUAAGAAGCUUUUUAAGAUAGGAAUCCCAAUUCUCACUUUGCCUCCUUUUCAUAGCUCACCUAAAUGGCUGACUUCUGUUCAGCACCUCUUCAUGGGUGCACUAUUCUGGAGAGGGAGAUCCUAGAGUUCCCACCUUCUGUUUGUUUGUUUUUGUUUGUUUGUUUGUUUUUUUGUUUGGUUUGUUUUUGUUUUUGAGACAGAGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUGGAUUGCAGUGGCGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGUUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGCUGAGACUACAGGUGCCUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUAUUCACCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUUGUGAUCUACCCACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCAUACCUGGCCAGCCCUUCUGUUCUAGACUGUGAGCCCGAAGACUGCAUUCUCUCCCAGGCUCAGUUUCCUUAUAUACAUAAUGCCACCGUGGUCAACCUCUACAGCAUCAUUUCCUGCACAUAUUUUGUCUAAACACCUUGACUGCACCUCAGAGAAGCUGGGUAUGGGCCGGAUUCCUUUGCCAUUUAAUGCAUACAGCCCGCAGAACAAUGUUGUCUGCUGAGCCCCUGGGGGACAGCAGAGAAUUGGAGCCUCUUUUCAUGGUUCUCACAGGCCAUGUGACACACAGAUGGGAGAAGCUGGCAUCUGCAGGGCCAAAGGCCUCUGGCCAAGGCACCCAUACCAAAGGGGACAGACUGGCCAAAGCAGCCUUAUCCCUAUCUCCUUAGGAACCACAUUCUAGUGGGAUCUGUUUGGUGAUACAGGUUGGGAGCAUGGGUGGGGAAGCCUACCCCAGGCCUGAUUCAGUCAUGAGGAUCCAGGAGCACCCUCCAAUGGCUGUUGCUAACUACAGUUGCCAGAUAAAACUUAGGUGGAAUCUGAGUUUCAGAAAACAAACAAAAAAUGUUUUUAGUAUGUCUCACCUACUGCCUGGGGCGUACAUUACAAAUCAGUCCUUAUAUAUUUGAAACUCAAAUUACAUUGGGCAUCUUGUAUUUUUAUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACACUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGUCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGGGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCUGCCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUAGGGUUUUGCCAUGUUGGCUAAGCUCGUCUGCUAACCCUAGAGCUGACAGGAAGGCUUUUGGGUUGGGCGGUUUUACGGGGAAAAUACUCUGUAACAGCGUUUUUCCUUUACUCUCACAUCACAACAAUCAACGCAGAAGAGUUAUGACCAAAUGUCGGGGUGGGGGGGGGGCGUUUCCCCACACACCAAGCAGCUGGGUGUCCUCUAAUGCAGUCUGACACUGAAAAGUAGUGUCAGAUCCCACAUUGGAGGGCUCAGUCCCCAAGACUGUUCCCCCAACACCAGUUGUAAGUCCAGACCUCCAGAACUUCUGACCAACUGGCUUCAAGUUGGGGUUCCCGUGACUCCCUCUUCGGGUUCAAUUAAUUUGCUGAAGUUGUUCAGAGGGACUGAAAUUUACAAAGGUCAGAGAUGGUAGAGGAAAGAGUAUGGUAAGUGUGGUGUGCAAGCCCAUCUAGUGGGAGCACAGUUGAGGAGGGAACAGGAGGUGGAAGCCAGGUGGGAAAGGAAGUCUGGGGCCCUGUUGGAAGGACCUUGAAUGCUGUGUUGUUAUGAUAGACAGUUUUCCUCCAUGAUUCCUGGCUCAUAACUCCCAUAGCCCUUGUUACAGUCUUUUGUUGUAAUAUUGAGUGUGUUAGGCCACAGGAAACAGACUCUCUCCUUCUCCUGCCCUCCUUUCACCUGCCCCCAGGCAGGACUCUAAUCUUUCCUGGACUUUCCAAUGGUUGUUCUUAAGACCAUUCCCAGAGAGGUUCCCACCCUAUACCCCGGGGGAAGGAAUGCUGACGUUAUAAAGCUUUCAUAAAAACCCAAGCGGACAGGGUUCAGGGAGCUUUGGGAUAACUGAACACAUCGAGGUUCCUGGAGGGUGGUGCCUGGGGGAGGGCUUGGAAGCCCUGUGCCCCUCCUCCCACACCUGAAUUGUUUUUUCUUUUUCCCUUCAUGAAACUCUUCCCUGCUCCUUGUAUGUGCCUCCAUAGUCAUUAUAAGAUUUUAUGAUAAUUUUUACAUGUCUCCCCGCUCCUAAGUACCUUCCACAGUGUCUAGCAUGUCAUAGGGAGUGAUUGGUAAAUAGCUGAUAGAAAGAACAAAUUAAACUAUCAGCCUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1692.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1776.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 1272.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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