Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
DNAJC27-AS1:5
Sequence Length
4674 nt
GC Content
0.5075
AGCGCGGGGCUGCUGACGUCAUCUGCAGGCCCUGGAGACGCGACUGCAGUUACCGAGUUUCUAAGGCCUCGUCCCCUGACGGGAAGGCGGCGUUGGGGGGCGGCUGGGUUUACCCUUCGAGAGUCCGUGUGAGAACCGGGACACCUGUCCUGUUGAAAAGGGGGACGCAAAAGCUGAAAAUGCCCGGAAGGAUAUGGCUUCCUUGAACUGCGGGACGUGUAGCUGCAGCUGUGGGGUGGACCAUGGAAACAGAUCAGCAGGAAGAAGAGAUGGAAGCAACGCCAUGGACCUUCACGUCCUUCAGAGUGUGGGUGGGCUUGGGCUUUGCAGUGAGAGCAAGUAUCACCCAGGAUGGAGAUGGGAGGUAAUGGGUGGCCCCGACAGGUGCCUCCUACUGCUGGCAGCAAGGAGAGAGUGAAGAGGCAGAAUUUCCUUGGUCUAGACUAGAGUCUGGGUCAUGGGCAUGGCAGUGCUUGAGCUUUUGACCAGAAGCAAGUGGACAUGGAUUUGAGCUUCGGGUAAGAAGGGAGACUUCUCUCCAGGGACCAUAGGGGCUGGCAGCUGAAGAAGGUGACUUGGCCCCUCUCUAGAGGGUGAACGCAGGAUCAAUUCAAGGCCAUGAAGUGGAUGCAGCUGGGAGAGCCUGCUUGGUGCUUUUAAACCUCAACAUGUCAACCGCAAAUACCUCAAACACUGCUCACACCGUGGUAAAAUCUAGUUGCGAAACCUGUCCCGCGGCAGCCUUCUCCAUCCCAGGUGCCCAGGCCCCAUCUCCUGGGAGCAGGCAGCUCUCCCCACCCCGAUUCAUGUCCCUCCUACAGCCCAAGGCAACUCCCUGCCACCUUGGUGAAUGAAGCACAUCAUGCUGCCCAGGCUUCUGAGCUGUUUGCCGUGUUGCGGAGAUGCAGCCUUCAGCCUUGGAUACCCACCCACUCCUCUACUUGGGCAUUGUUUUCACAGGCUGCUCUUCCCUGUAGCUUCAGAGAAGUAGGUCAAGUAGGUUAACUCGCUUUAAGGGAGAAGUGCCAGGGGUUCAAGUCACCCAGCCUGGAGGCAGGAAUCCUGGGUUCUAUUUUUGGCUUCACAGCUAAUCCGCUGUGUGACAGUCGUUAGGAGCUCAUUCUCCCCUCUGGGUCUCCCUGAGCCCUUCUCUAGGUCCCACAAUUUUUUUUUUUUUCCCUGAAGCUAUAUUCCCUGGACUGUCAUAUUCUUCCCUCUUCCCUCCCUCUGGGAGGUGCUUUAAAGCCGUUGGCUGCUCAAGGCUGGCGCCCUAGGCAAGAGGGGCUGCAGUUGUUGUAGCUGAUGAGGAGGAGAUAAGAGGCUUUUCUGUAGACACAGUUGAGCUGAUGGGCUGUGUGAGGCUGGAGUGCCAGGAAACCAGACUCCUGUAACUACAGGACAGGCCCUGGUGAUGUGAUGAUGGGGAUGUGACGGGGAUGCUGAAGCCUGGAAUGCGAGUGGGGGUUCCUGCGUUUUAUGCAAUGGCUGUAGAUUUCCUCCCACUUCUAAGCCUCCCUUUCUGUGACACGCAGGGAAAUUCAGUCUCUAGUUCAUAUGGAAACUUGGGACCUCACUGUGCUGCUUGCUCUUGGCAGAGGAUAUCAUUUGAGCUGUCAUAGCAGAGGACCACAUUUACCAGGGUGCACUUUGGCCAAAGAAUAGUAACCUUUCUAAGGCUUAGUUCCUCUGGCCUGACCAAACCAGUCCCAGGAGGCCCCUGGGUUCCAGUCAAGGUCAUGGGAGAGGCCCACCAUGGAUGAGGCCUGGGGGAGCAGGGUGGAAAUUAAGUGCCCAGGUAUGUUAUGGAUAGCCUGCAGCCCUCUCCAAUCCCUACCCUCCAAACCCAGUGAAGGGGGACAUGAAACAGGUGAGGCAGAGGAGCAAAUGCGGGUCAAGAAUUCCGAACUAUACUUGACUUACAGUGCAGCUGUGAUGUGCACAUUGGUGUGUGCCACGAGACAGCAUAGUGUGGUGGAAAGAAAAUGGGUUUUGAACAGAGUGUCCUGGGUUUGAAUCUCUGCUUGCCCAUGUACUAGAGAGUAGUCGAACCUCUCUGGGCCUCAAUUUCCCAGAUGUAAAAUGGGAAUAGUAGUACUUACCUUGCACGGGUGCUGAGAGAAUUCCAUGAGACGACACAACCCGUGUAAAGUGCCUGGCAUAGGCAUAUCACAUUAGGGCACUCAGUAAAUGUGAUGUCUUUUCUACUUGCCUUCCUGUCAUACCGGUCCCCAUGUUUUGGAUUUCUGCAGCUAAAGUUAAGAAGCUUUUUAAGAUAGGAAUCCCAAUUCUCACUUUGCCUCCUUUUCAUAGCUCACCUAAAUGGCUGACUUCUGUUCAGCACCUCUUCAUGGGUGCACUAUUCUGGAGAGGGAGAUCCUAGAGUUCCCACCUUCUGUUUGUUUGUUUUUGUUUGUUUGUUUGUUUUUUUGUUUGGUUUGUUUUUGUUUUUGAGACAGAGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUGGAUUGCAGUGGCGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGUUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGCUGAGACUACAGGUGCCUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUAUUCACCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUUGUGAUCUACCCACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCAUACCUGGCCAGCCCUUCUGUUCUAGACUGUGAGCCCGAAGACUGCAUUCUCUCCCAGGCUCAGUUUCCUUAUAUACAUAAUGCCACCGUGGUCAACCUCUACAGCAUCAUUUCCUGCACAUAUUUUGUCUAAACACCUUGACUGCACCUCAGAGAAGCUGGGUAUGGGCCGGAUUCCUUUGCCAUUUAAUGCAUACAGCCCGCAGAACAAUGUUGUCUGCUGAGCCCCUGGGGGACAGCAGAGAAUUGGAGCCUCUUUUCAUGGUUCUCACAGGCCAUGUGACACACAGAUGGGAGAAGCUGGCAUCUGCAGGGCCAAAGGCCUCUGGCCAAGGCACCCAUACCAAAGGGGACAGACUGGCCAAAGCAGCCUUAUCCCUAUCUCCUUAGGAACCACAUUCUAGUGGGAUCUGUUUGGUGAUACAGGUUGGGAGCAUGGGUGGGGAAGCCUACCCCAGGCCUGAUUCAGUCAUGAGGAUCCAGGAGCACCCUCCAAUGGCUGUUGCUAACUACAGUUGCCAGAUAAAACUUAGGUGGAAUCUGAGUUUCAGAAAACAAACAAAAAAUGUUUUUAGUAUGUCUCACCUACUGCCUGGGGCGUACAUUACAAAUCAGUCCUUAUAUAUUUGAAACUCAAAUUACAUUGGGCAUCUUGUAUUUUUAUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACACUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGUCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGGGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCUGCCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUAGGGUUUUGCCAUGUUGGCUAAGCUCGUCUGCUAACCCUAGAGCUGACAGGAAGGCUUUUGGGUUGGGCGGUUUUACGGGGAAAAUACUCUGUAACAGCGUUUUUCCUUUACUCUCACAUCACAACAAUCAACGCAGAAGAGUUAUGACCAAAUGUCGGGGUGGGGGGGGGGCGUUUCCCCACACACCAAGCAGCUGGGUGUCCUCUAAUGCAGUCUGACACUGAAAAGUAGUGUCAGAUCCCACAUUGGAGGGCUCAGUCCCCAAGACUGUUCCCCCAACACCAGUUGUAAGUCCAGACCUCCAGAACUUCUGACCAACUGGCUUCAAGUUGGGGUUCCCGUGACUCCCUCUUCGGGUUCAAUUAAUUUGCUGAAGUUGUUCAGAGGGACUGAAAUUUACAAAGGUCAGAGAUGGUAGAGGAAAGAGUAUGGUAAGUGUGGUGUGCAAGCCCAUCUAGUGGGAGCACAGUUGAGGAGGGAACAGGAGGUGGAAGCCAGGUGGGAAAGGAAGUCUGGGGCCCUGUUGGAAGGACCUUGAAUGCUGUGUUGUUAUGAUAGACAGUUUUCCUCCAUGAUUCCUGGCUCAUAACUCCCAUAGCCCUUGUUACAGUCUUUUGUUGUAAUAUUGAGUGUGUUAGGCCACAGGAAACAGACUCUCUCCUUCUCCUGCCCUCCUUUCACCUGCCCCCAGGCAGGACUCUAAUCUUUCCUGGACUUUCCAAUGGUUGUUCUUAAGACCAUUCCCAGAGAGGUUCCCACCCUAUACCCCGGGGGAAGGAAUGCUGACGUUAUAAAGCUUUCAUAAAAACCCAAGCGGACAGGGUUCAGGGAGCUUUGGGAUAACUGAACACAUCGAGGUUCCUGGAGGGUGGUGCCUGGGGGAGGGCUUGGAAGCCCUGUGCCCCUCCUCCCACACCUGAAUUGUUUUUUCUUUUUCCCUUCAUGAAACUCUUCCCUGCUCCUUGUAUGUGCCUCCAUAGUCAUUAUAAGAUUUUAUGAUAAUUUUUACAUGUCUCCCCGCUCCUAAGUACCUUCCACAGUGUCUAGCAUGUCAUAGGGAGUGAUUGGUAAAUAGCUGAUAGAAAGAACAAAUUAAACUAUCAGCCUUGUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1694 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1776.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 1351.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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