Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

GAS5-AS1:1

Sequence Length

853 nt

GC Content

0.3751

AGCGCUUACAUUCUUGUGGGGGAAGUAAGAACAAAACACAUAAUAGGUCAUGGUGGUCACAUGAAAAGUAAAGGGUAACCGAUUGGGGUAGGUGGUGGUAGUUUUGUGUGUGUGUUUUUUUUUGAGACCAAGUCUCGCCUGGGCAACAGGAUUCAGUCUCAAAAAAAGGAAAAUUCAGAGAGUAACUGAAGUUUUAUCAUUAAUGGGACUAAAGUGCUUUAGCCCAGAAACAGAUUUGUAAAACCAUUACUGCUAACAAAGACAUCAUUAUAAGCACAGCUGUACUGACACUGAAAUUAAAAUUUGACCCAUCUUGGAAUUUUGGCCCCUUGGUCCUGUUUCCCUGGGACAGAUUGCCUUAAACCAGUUGUGCCCUUUAUACCCACUUUUGGCAUCCCUAAACACUUAGUGCUUGCCAAAAACCUAUCACCAUGGCUAUGGAUUGUAGAUUUUCCCAAUUCCAUUAAUGCCUAUCACUAGUUGGGCAUUUCUAUAGUAUUUUCUAUAACUUAUUUUCCCAGCCUCAGACUCAACAUGACUUUCUCCAAGUAGCUCCAUCAAUACUUUAAGCUCAAAACCAAUUAGCACAGGGGCCUAUGAAACCUGACAAUUUGCUCAUAUGGAGAAUUAGGAAAUAUUGCACUUUAAUGCAUAAGACACCUUGUAAAAUACCCAUAAAAUUUUAACUGGCUGCAGUGUUAAUGAAGCAAAUACCAUGGAGUUAUAAUAGCUUUUGAAUGUGAUUUAUGCUUACAGCUAAUGAACAGAUGAAAAGCACUGUCCUUUUUUAAGUAAACACUACACACUCCAGAUGGAUUGCAAAAAUUUAUUAAAAUUGGAGACACUGUUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-206.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -224.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 160.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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