Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

GAS5:40

Sequence Length

643 nt

GC Content

0.3857

GAUACAAUGAUGAUAACAUAGUUCAGCAGACUAACGCUGAUGAGCAAUAUUAAGUCUUUCGCUCCUAUCUGAUGUAUCUGGCGGUAACAUUCUAGUUUAUGCCCCGAAAAGGGGAAUAUAGCCAUUCUAUAAUGUUUGGAGAUUUUGGAUUACUCCUAAUUGUAUGCAAGUUGUCUUACUGUGUAUUGUCCCUUAAUUUCAGGACUCAGAAUUCAUGAUUGAAGAAAUGCAGGUUAGUUUAAACUUUGAAGGAAAUUUUUAAGGUGGCAAAAGGUUUUGGUGGCAUAUACACCUUAAUCUGUAGAUGGGAGUGAUUAGCUGUUUAAAAGUUAAAAUGUGACUGAGAAGGAAAUUGAGUAGGGCAAAUUUUAAAUGGGUAUUAUUUUUCAUCUUCAAACAGGCAGACCUGUUAUCCUAAACUAGGGUUUUUAAUGACCACAACAAGCAAGCAUGCAGCUUACUGCUUGAAAGGGUCUUGCCUCACCCAAGCUAGAGUGCAGUGGCCUUUGAAGCUUACUACAGCCUCAAACUUCUGGGCUCAAGUGAUCCUCAGCCUCCCAGUGGUCUUUGUAGACUGCCUGAUGGAGUCUCAUGGCACAAGAAGAUUAAAACAGUGUCUCCAAUUUUAAUAAAUUUUUGCAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-162.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -174.3

Frequency: 0.0000

Diversity: 153.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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