Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

GAS5:64

Sequence Length

1456 nt

GC Content

0.4753

CUUUUCGAGGUAGGAGUCGACUCCUGUGAGGUAUGUUUUAUCUUUGCGAAUGUUGCGGGUUUUGGGGCGCUCCAGCCUUUGUCUGCUAAGGUCACCCUGAAUUGACUGGGACUUCUAAGCCAGUCGCGCGCCUUUGCAGGGCCUACAAGUUGAGGAUGGUGGGGGAUUGCACAUAUGGUGCAUGCGUGACCUAAGCUGCGACUAUGUUAGAGUAGAACUGCGGAGAAGCCUCGGCUCUCGUGCCCUGCCUCUGAUGAAGCCUGUGUUGGUAGGGACAUCUGAGAGUAAUGAUGAAUGCCAACCGCUCUGAUGGUGGCACAUGCCGAGUCACCCGAGUAAGCUAUUGUUAAGGGCCGUGACCCGAGCCUCCAUCAGCCGUCCGCUCUCAUGAAAGGCUGUCGGUGGUAGUCCACGUGCUUAAGUGCCUGCAUUCCGCAGUGUCACCAAUAUUUCCAUUAGUGUUUCUUUUUUCUUUUUUGAGACCGAGCCUCGUUCUGUCACCCAGGCUGGAAUGCAGUGGCUCGACAUCGGUUAAUGGCAACCUCCGCGUCCCGAGUUAAGCAGUUCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAACUGGGACUACAGGCGCGCGCCACCAUGCUAGGCUUUUAUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCGAGACUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCAGCCGUGGUCCCCCAACAUACUGGGAUUACAAGCCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAUCGGUGGUUCUUAACUGCGGGUGCAGUGCUUCUUUGUAACAUUAAGUGUAUCCUUUACCUGUCGCUAGAUAAUGAAUGGUAUGUUACCUGCAUCAUUGGUUUAAAAAGACGAACCGUUUUUUUAAAGAACACUCUUUAAAAAAAAGAACCGUGGAACAAUGAAUUAAAAUCUGUACCUGAUCUCUUUAGGUAUGGUGCUGGGUGCAGAUGCAGUGUGGCUCUGGAUAGCACCUUAUGGACAGUUGUGUCCCCAAGGAAGGAUGAGAAUAGCUACUGAAGUCCUAAAGAGCAAGCCUAACUCAAGCCAUUGGCACACAGGCAUUAGACAGAAAGCUGGAAGUUGAAAUGGUGGAGUCCAACUUGCCUGGACCAGCUUAAUGGUUCUGCUCCUGGUAACGUUUUUAUCCAUGGAUGACUUGCUUGGGUAUGGAGAGUCGGCUUGACUACACUGUGUGGAGCAAGUUUUAAAGAAGCAAAGGACUCAGAAUUCAUGAUUGAAGAAAUGCAGGUUAGUUUAAACUUUGAAGGAAAUUUUUAAGGUGGCAAAAGGUUUUGGUGGCAUAUACACCUUAAUCUGUAGAUGGGAGUGAUUAGCUGUUUAAAAGUUAAAAUGUGACUGAGAAGGAAAUUGAGUAGGGCAAAUUUUAAAUGGGUAUUAUUUUUCAUCUUCAAACAGGCAGACCUGUUAUCCUAAACUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-461.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -488.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 339.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......(((((((((....)))))).((((((.....))))))((((.....(((((((....((((((..(((((((((((.(((.(((((((........((((((..........))))))(((((((..(((((..(((((..(((...))).)))))...))))).....)))))..))))))))).)))...)))((((..(((((.((.(((.((((..((.((((.((.((.(((((((.((....)).))..(.(((((((....((((..........))))..))))))))((((((((..((((....)))).))))...)))).(((....))).))))))).)).))))))))))..)))...)).)))))))))))))))))...((((....))))))))))....)))))))...)))).(((((((((.((((((.(((((((((((((..((..(((((((.(((((((.(.((((((.((((((((.(((...((((((((...((((((((......))))...((((((.((((((.((.(((((((((((((.(((((......))))).....((((((.(((((.......(((((...((.((((((((.....((((....(((((((((((((((....)))))..(.((((....)))).).....)))).)))))))))).....)))))))).)).)))))))).))...)))))).(((((((...)))))))......((((((((..(((((((.((((.......((.(((.....)))))........)))).))..)))))..))))))))((((((.((((((((((((...))))))))))))...((((((((.....)))))...)))...))))))........((((((((((.....)))))))))).)))))).))))).)).)).)))))).)))).)).((((..(((((....)))))..))))...)))).....))))))))...)))...((.(((((....((((..(((((((((...(((...............)))...)))..)))))).))))....)))))))((((((......))))))...(((((((((.....))).))).)))......)))))))))))))).)..)))))..(((((...))))).....(((((...)))))...)).))))))).....))..))))))))))(((((......)))))))).)))))).))...)))))))..(((((..((((.......))))..)))))(.(((((((((....((.((((((((((...........(((.((.......)).)))........)))))))))).))....))))))))).).((((((....))))))..))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.......(((((((((....)))))).((((((.....))))))((((.....(((((((.,,.((((((..(((((((({{{.(((.(((((((.......,((((((..........))))))|,(((((..(((((..(((((..,{,...,,}.)))))...))))).....)))))..},))))))).))).,,}}|((({..{{{||,|,.{|||{(((..({,{{{|}||,|(,((((((({,{....|,.,|..,.,,,||||}}}.|||{,|||{|{...||||..}|||,}|,||,({({{{{|(((....,,|{.||||{{{},,}.{{{....))}.,)))}}),)),}))})))})),,))).,})).)))))))}}))))))))...((((....)))))))))).,,.))))))).,.)))).((((((({{.((((((.{{{((((((((((,.{(,{(((((((,(((((((.(.((((((.((((((((.(((...((((((((,..((((((((......))))...((((((.((((((.((.(((((((((((((.(((((.,,...}||||,,,{.((({{{.((({{,.,,...(((({...,,.,{,{{{{|{{{,,{{(({{{{,(({,,.|||.|}}|}|,|||},{..|.{{{{....}})),|.,,,,))}))})))))}))}.....)))))))),||,|}}}}},|{||,{{||||||,{((((((...))))))},.....{{|||||||.||||||{,||||,..,...{(,({{.....}}}}|,{{....,))}},)}..}))}},.})))}))}|{{{{({(((.....,,,|}}})}|{((((((((({....}))))))))))),},..|}}}...}})}),........((((((((((.....)))))))))).)))))).))))).)).)).)))))).)))).)).((((..(((((....)))))..))))...)))).,...))))))))...)))...((.(((((....((((..((((((,{{,,.{,({(.,,......,,.)))}...)),..)))))).))))....)))))))((((((......))))))...(((((({{{.....}}}.))).)))......)))))))))))))).)..)))))}.(((({...})))).....|||||,,,)))),,,,)}.}}}}}}}.,,,.}}.,)))))))))){((({......))))}}}}.)))))).,}...)))))))..(((((..((((.......))))..))))){.((((((((((((,{(.((((((((((,{{....{,(.{((.{........}).))),..}},,,)))))))))).)))))}))))))))).).((((((....))))))..))).......