Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
GAS5:65
Sequence Length
632 nt
GC Content
0.4778
CUUUUCGAGGUAGGAGUCGACUCCUGUGAGGUAUGGUGCUGGGUGCAGAUGCAGUGUGGCUCUGGAUAGCACCUUAUGGACAGUUGUGUCCCCAAGGAAGGAUGAGAAUAGCUACUGAAGUCCUAAAGAGCAAGCCUAACUCAAGCCAUUGGCACACAGGCAUUAGACAGAAAGCUGGAAGUUGAAAUGGUGGAGUCCAACUUGCCUGGACCAGCUUAAUGGUUCUGCUCCUGGUAACGUUUUUAUCCAUGGAUGACUUGCUUGGGUAAGGACAUGAAGACAGUUCCUGUCAUACCUUUUAAAGGUAUGGAGAGUCGGCUUGACUACACUGUGUGGAGCAAGUUUUAAAGAAGCAAAGGUAUAGCAGUUCCAAGUAUUUUUUUUUUUUUUUUAGACAAGAGUCUAGCUCUUGCCCAGAAUGGAGUGCAGCGGCACUAUCAGUUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGGAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGUGACACCAUGCCUGGCUAAUUUUGUACAGCUAUGUUGUCCAGGCUGGUCUCGAACUCUUGACCUCAAGUGAUACUGCCCGCACUGACCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-206.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -218.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((((((..((.((.(((((((((((((((.((((((((((((..((((((.((((..((((..(((((....)))))..)))).(((((.((........))...)))))....((((((((..((((..(((...)))((.((((.(.((((((..(((((((.((.(((..(((......)))..))).))...)))))))..))..)))).)))))))...(((((((((((.(.(.....).).))))))))))).....(((((...)))))(((((((...)))))))...)))).)))))).))...)))).))))))....((((((((((.(((((....((........))....))))).))))))))))(((((((...))))))).(((...)))(((((....))))).......)))))))...)))))..))))).....((((....))))..((((((..(....)..)))))).(((((....))))))))))))))).))....((((.(((((...))))).))))..))..))).)))))).))))).............(((.(((...(((((......)))))...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((((((((..((.,{{(((({{((,{(((((.((((((((((((.,((((((,{{{{..((((..(((((....)))))..)))).(((({.{{,.......||,..})))}..,{,(((((,,..((((..((({{{|||,,.(((({..,...,,..|,||||,..|||,.,}}}}}.}}}}.,,.))))))){{{|||,,,...))))))||{|||}},,...(((((((((((.(.(.....).).))))))))))).....,((((...}))}|(((((((...)))))))},.)|||,}}}}}),)).,.)))).)))))),.,,{({(((((({.(((((,{{.,|........))}}}}))}))}))))}}}}}}(((((((...))))))).|||,,.|||(((((....))))).,},,},)))))))...)))))..)))))...,.((((....))))}}|||((({{,....|{{||||||{((((({{{{||,,.,,,)))))))},,,}}}}}.,..||||}}},,,,,..))))}))..))),,))))),}))))..,..........(((.(((...(((((......)))))...)))))).
Back