Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
GAS5:79
Sequence Length
5294 nt
GC Content
0.4220
CCAUGGAUGACUUGCUUGGGUAUGGAGAGUCGGCUUGACUACACUGUGUGGAGCAAGUUUUAAAGAAGCAAAGGACUCAGAAUUCAUGAUUGAAGAAAUGCAGACCUGUUAUCCUAAACUAGGUGAGUCAGCUUUUGGUACAUGUGAUGAUUUUCAGUGUAACCAAUGAUGUAAUGAUUCUGCCAAAUGAAAUAUAAUGAUAUCACUGUAAAACCGUUCCAUUUUGAUUCUGAGGUUACUCUACUAACAAGCAUCACACAUUUGUAUUUUGCCCUGAUUAAUAUGUUGGCUUCGCUUUCAGGGUUUUUAAUGACCACAACAAGCAAGCAUGCAGCUUACUGCUUGAAAGGUGAGGAUUGGAAAUGUUGGGACUAUUAUAAUUGCAGAAUACAUGAUGAUCUCAAUCCAACUUGAACUCUCUCACUGAUUACUUGAUGACAAUAAAAUAUCUGAUAUUCUGCAUUCCCAUGUAGCAUUUUAAUUGAAGUCUGUAAAUGUGGCUAAAAGUCUUGUCUUAUUUUUUGAGACAGGGUCUUGCCUCACCCAAGCUAGAGUGCAGUGGCCUUUGAAGCUUACUACAGCCUCAAACUUCUGGGCUCAAGUGAUCCUCAGCCUCCCAGUGGUCUUUGUAGACUGCCUGAUGGAGUCUCAUGGCACAAGAAGAUUAAAACAGUGUCUCCAAUUUUAAUAAAUUUUUGCAAUCCAUCUGGAGUGUGUAGUGUUUACUUAAAAAAGGACAGUGCUUUUCAUCUGUUCAUUAGCUGUAAGCAUAAAUCACAUUCAAAAGCUAUUAUAACUCCAUGGUAUUUGCUUCAUUAACACUGCAGCCAGUUAAAAUUUUAUGGGUAUUUUACAAGGUGUCUUAUGCAUUAAAGUGCAAUAUUUCCUAAUUCUCCAUAUGAGCAAAUUGUCAGGUUUCAUAGGCCCCUGUGCUAAUUGGUUUUGAGCUUAAAGUAUUGAUGGAGCUACUUGGAGAAAGUCAUGUUGAGUCUGAGGCUGGGAAAAUAAGUUAUAGAAAAUACUAUAGAAAUGCCCAACUAGUGAUAGGCAUUAAUGGAAUUGGGAAAAUCUACAAUCCAUAGCCAUGGUGAUAGGUUUUUGGCAAGCACUAAGUGUUUAGGGAUGCCAAAAGUGGGUAUAAAGGGCACAACUGGUUUAAGGCAAUCUGUCCCAGGGAAACAGGACCAAGGGGCCAAAAUUCCAAGAUGGGUCAAAUUUUAAUUUCAGUGUCAGUACAGCUGUGCUUAUAAUGAUGUCUUUGUUAGCAGUAAUGGUUUUACAAAUCUGUUUCUGGGCUAAAGCACUUUAGUCCCAUUAAUGAUAAAACUUCAGUUACUCUCUGAAUUUUCCUUUUUUUGAGACUGAAUCCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCAUGAUCUCAACCGCUGCUCACUGCAACCUCUACCUCCCGGGUUCAAGCGAUUCUCUUCAGCCUCUUGUAGCUAGGACUAUAGGCACCUACCAUCACAACCAACUCAUUUUGGUAUUUUUAGUAGAGACGAAACCCCAUCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUUCACAGGCCUGAGCCGCAGUGCCCGGCCUCCCAGGCCUUUUAUGCUUGAUGUUUUUUUCAGGGCCCUUCCCAUUGUCAUUUCACAAUCUCAUUGAAAUGUCAGCUUAUGCACUAAAUGCGUGUAAGUUGGGAAUGCCCAAUUUUGUCUAAGAAAAAAGGCCUCCCCCUCCCCCAAAUAAGCACAUUCUUUCAUUUCCUGGGGCUCACCCGAAUGUCUCACACAGGCUGUAAAACAACUACCACCACCUGGCUGGGUGCUGAGGUGGGCAGAUUACCUGAGGUCAGGAUUUCAAGACCAACCUGGCCAAUAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUCUAGCCGGGUGUAGUGGUGGGCUAUUGUAGUCCCAGCUAUUCGGGAGGCUGAGGCAGGGGAACUGAACCUGGGAGGCUGAGGUUGCAGUGACCCGUGAUCCUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGCCAGGGUGAGACUUUCUCAAAGGAAAAAAGAAGGCUGGGCGUGGUGGUUCAUGCCUGUAAUCCCACCACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGUGGAUCACACGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGACCAACAUAGUGAAACCCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAGUUAGCCAGGUGUGGCGUGCACCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCUAGGAAGUGGAGGUUGCAGUGAACUGAGAUCAUGCCACCGCACUCCAGCCUGGGCAACGGCGAGACUUGGUCUCAAAAAAAAACACACACACAAAACUACCACCACCUACCCCAAUCGGUUACCCUUUACUUUUCAUGUGACCACCAUGACCUAUUAUGUGUUUUGUUCUUACUUCCCCCACAAGAAUGUAAGCGCUUCAAGUUUAUUCCUUAAUGUUGGAAAAAUGAAUGAAACUGCAAAUGUAGUAGAUCAGUUUUUGGGGAGGUACCAAAGACAAGUUGGUAAAAUACCUUGAUUUUGAAGUGAAAAACGAUGUUACAUUUCAAAGUAUCUUUUCGCCAGGUUAUGGCUCAGGCUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGCAAAACCCGGUCUCUACUGAAAAAAAGCGAAAAUUAGCCGGGUGUGGUAGUGUGGGCCUGUAGUCCCAGCUACUCUGAACCCUGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAACCAAGAUCGUGCCACCUCACUCCAGCCUGGGCCUCCUAGGCUCAAGUGAUUGUUGUGCCUCAACUACCUGAGUAGCUGGGAUGACAGGUGUGUGCCACCACUCCCAGCUAAUUUUUUUUUCUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGAGUUUCACCAUGUCAGCCAGGCUAGUCUUGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCCAACUGCCCUGCCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCAUCCAGCCAAGUUCUAUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUCGCUCGUGUUGCCCAGGCUGGAAUGUAGCGGCGCAAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCGUGGGCCACCAUGCCUGGCUAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAGGGGGUUUCACCACGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCGUGAUCUGCCCACCUAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCAUCCAGCUUCUUGUUCUCUCUUUUAUAUAUAAGUGCCAUUUGCUGAAUCAGAAAACUUUUUGACAAGCAUAUUAAAAGAUUUCAGUUGUAUGUAGUAGCUCAUGCCUGUAAUCCCAACACUUUGGGAAACCAAGGUGGGGGGAUUGCUUGAGUCCAGGAGUUCAAGACCGGCCUGGGCAACAUAGUGAGACCCUGUGUCUACAAUUAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGUGAGCCGGGCAUGAUGGUGCAUGCCUGUAGUCCCAACCACUCAUGAGACUGAGGUGGGACGAUCGCUUGAGCCCAGGAGGUUGAGGAUGCAGUGAGCUGUGUCACACCACUGGAUUCCAGCCUGGGUGACAGGGUGAGAUGUUGUCUCAAAUAAAAUAUUAAAAAUUGGAUCACCUUAUUCAGCAUUCUGUUGUUUAGCAGUUUUGGAAUUUUAGUUGUUAGUAAAUCUUGACCUUGAGUACACGUUAUUUUGAUAUUCUGUGUGACAAAAUGGGAAGUAUGCAUGAAGCACAUCUGCCAUAAAGUAUGGAUGUCUAGAUUUUUUUUUCCCUAGAAAAAGUAGUUACAAUUGUUUGAGAUACAAGCUGAACUAGCUGCUUGUUUUCACAGAACAUUUUUAGUUUGAAAAAACCUGACAAAUUGAUUAUUCAUAUUUUAGGGGUAAUUUUGGCAGAGAUUUGCUCAAAAAAGAACAAGUCAGCUUGGAAAAAACUGAUGGCAUUUGUUGCCAAUGAUAAAACUCAAGCUUCCAAAUGAAACCUAAAAUUUUGGAAGGCUUGUAUACACUUCUGUGCCCUUAUAGCUUCCUCAGACUUAGACUUUUGUAAUGGGAUUGGUGGUAAUAUUAAUUAAUGGUAUUUUGUUUUAGAUAUUGUAUAUCAAAAUGUGUCAACAUUUGGAAGAUUUGCAUAACUCAGUGAACCAAUAUUUUCCAAAUGAUCAAUCACUGGACUGGUGUUACAAAUAUCACACAUAGGUAAAAGUUCUAUUUAAAUACAAGGUACACCAAUGGACUUUAGAAAAGCUCAUCAAUACGAUUUCAGAAUCCACAUUGCAACUAGCCUUUAAGGAACUCUACUACUUGUCAUAUUUUGGUGUGGUAUCAAAGAGAGUAUCCAUAAUUAUCAGACAAAGCUAUUAAAAUACUCCUCCCUUUUCCAACUUUAUAUAUGAGUGGGGUCAGAUUUUCUUCACAGACUUCAACCAAAACAGCAUAUAACAACAGAUAGGAUACAGAAGCAGAUAUCAGAAUCUAGUGUCUUCUAUUAAGCCAGAAAUAAAAAAUAUUUGCAGAAAUAUAAAACAAUGUUACUCUUCUAUUUUUUUUUUGAAAAUAAUUAUUUUUAAAAUAAAAACAUGGCUGAGUGUGGUGGCUCACGCCUUUGUAAUCCCAGAACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGCGGAUCACCUGAGGCCAGGAGCUUGAGACCAGCCUGGUCAACAUGGCAAAACCUCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAACCAGGUGUGGUGGAGGGCACCUGUGGUCCCAACUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAAAACUGCCUGAACCCGGGAGGUGGAGGAUGAAGUGAGCCAAGAUCGCACCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAGUGAGACUCUGUCUCAAAAUAAAAUAAAAUAAAAACAUGCUAUUUGUGUUAACAUGUAAUGGGUUAUUUUAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2048.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2139.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 1007.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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