Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

GAS5:81

Sequence Length

639 nt

GC Content

0.3865

CAAUGAUGAUAACAUAGUUCAGCAGACUAACGCUGAUGAGCAAUAUUAAGUCUUUCGCUCCUAUCUGAUGUAUCUGGCGGUAACAUUCUAGUUUAUGCCCCGAAAAGGGGAAUAUAGCCAUUCUAUAAUGUUUGGAGAUUUUGGAUUACUCCUAAUUGUAUGCAAGUUGUCUUACUGUGUAUUGUCCCUUAAUUUCAGGACUCAGAAUUCAUGAUUGAAGAAAUGCAGGUUAGUUUAAACUUUGAAGGAAAUUUUUAAGGUGGCAAAAGGUUUUGGUGGCAUAUACACCUUAAUCUGUAGAUGGGAGUGAUUAGCUGUUUAAAAGUUAAAAUGUGACUGAGAAGGAAAUUGAGUAGGGCAAAUUUUAAAUGGGUAUUAUUUUUCAUCUUCAAACAGGCAGACCUGUUAUCCUAAACUAGGGUUUUUAAUGACCACAACAAGCAAGCAUGCAGCUUACUGCUUGAAAGGGUCUUGCCUCACCCAAGCUAGAGUGCAGUGGCCUUUGAAGCUUACUACAGCCUCAAACUUCUGGGCUCAAGUGAUCCUCAGCCUCCCAGUGGUCUUUGUAGACUGCCUGAUGGAGUCUCAUGGCACAAGAAGAUUAAAACAGUGUCUCCAAUUUUAAUAAAUUUUUGCAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-160.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -173.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 160.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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