Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
H19:18
Sequence Length
444 nt
GC Content
0.5698
CUUUGUUUCUGAGCUUUCCUGUCUUUCCUUUUUUCUGAGAGAUUCAAAGCCUCCACGACUCUGUUUCCCCCGUCCCUUCUGAAUUUAAUUUGCACUAAGUCAUUUGCACUGGUUGGAGUUGUGGAGACGGCCUUGAGUCUCAGUACGAGUGUGCGUGAGUGUGAGCCACCUUGGCAAGUGCCUGUGCAGGGCCCGGCCGCCCUCCAUCUGGGCCGGGUGACUGGGCGCCGGCUGUGUGCCCGAGGCCUCACCCUGCCCUCGCCUAGUCUGGAAGCUCCGACCGACAUCACGGAGCAGCCUUCAAGCAUUCCAUUACGCCCCAUCUCGCUCUGUGCCCCUCCCCACCAGGGCUUCAGCAGGAGCCCUGGACUCAUCAUCAAUAAACACUGUUACAGCAAUUUGUCUCGAGGACUCUGGAAUCCGGGCUGUGGGCAUGAUGUGGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.1
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((.(((((................(((((((((.(((((((((((((((...((...((.(....(((.((((........)))))))...).)).)).))))))))))))...))).))))))))).((((....))))(((.((....)))))...(((....)))...)))))((((((((............))))))))(((((((((..(((.(((.(((...)))..)))...)))..))))))))).((..((((((..........))))))..))...))))...........(((((((..((((...((((....(((((((((((((....))))))))))...................(((....)))....((((...))))..))).....))))...))))..)))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,,.{{.(((((({(({({..............,.(((((((((.((((((((((((((,...{{...((......((,,((((........)))))))...}.)}.)).,)))))))))))...))).))))))))).((((....}}}}{{(,(,,,,.}}))),,,(((....))}.,.)))))((((((((............))))))))(((((((((..(((.(((.(((...)))..)))...)))..))))))))).||}}||||,|,,,.||{,{,||||||.,},.....||..........}|,,,,,,|,|}}},|{(((({..(((.((((((((((....))))))))))...................{{{.,{{||....,||,{,.,|||,.||,|,..}}))),.).))))))))}))})),
Back