Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
H19:2
Sequence Length
736 nt
GC Content
0.5856
CAUCAGAGGACCAUGGCCCCGUAUCACCUGGGUCAGGCACUGAAGCUGGGACAGGAGAGCAGAGACUUCCAAAAUGAGGGAUCCCUGUGUUCUGAGGUGAUCAUGACUGGGACCCAAGGACUCAAGCGCAUGCUCCAGAGGGAAUCGUUUCCCACAAGGCCUUUGGCAGGAACAGGGAUCCUGGGAGCCUGCCAAGCAGAGCGCACAGUGUUCCUGGAGUCUCGCUGCCCAGAUGCCACGGAAUCAGUUGAAGCCAGGUCUCCAGCUGGGGUGGACGUGCCCACCAGCUGCCGAAGGCCAAGACGCCAGGUCCGGUGGACGUGACAAGCAGGACAUGACAUGGUCCGGUGUGACGGCGAGGACAGAGGAGGCGCGUCCGGCCUUCCUGAACACCUUAGGCUGGUGGGGCUGCGGCAAGAAGCGGGUCUGUUUCUUUACUUCCUCCACGGAGUCGGCACACUAUGGCUGCCCUCUGGGCUCCCAGAACCCACAACAUGAAAGAAAUGGUGCUACCCAGCUCAAGCCUGGGCCUUUGAAUCCGGACACAAAACCCUCUAGCUUGGAAAUGAAUAUGCUGCACUUUACAACCACUGCACUACCUGACUCAGGAAUCGGCUCUGGAAGGUGAAGCUAGAGGAACCAGACCUCAUCAGCCCAACAUCAAAGACACCAUCGGAACAGCAGCGCCCGCAGCACCCACCCCGCACCGGCGACUCCAUCUUCAUGGCCACCCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-262.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -276.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 197.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.((((((((.......))))...((((((((..(((((.((((..(((.((((((.(((......(((.((((...(((.(((.....))).))).)))))))..((((....((((.((((.....(((((....)))))..........(((((((..((((...))))....)))))))))))..)))).....)))).))))))))))))..))...)))).)))..)))))....))).(((((((((((((((.(......))).)))))))..).))))).....)))))))))(((((.(((((..((..(((.......(.(.((((((((..(((((((.(((.((((((.......)))))))))....))))..)))(((((((((((((......(((...(((((((...(((((......))))).(((((......).)))).(((((....)))))..................((((((((.....((....)).(((((...(((.((.((.........((((((((((................((((((....(((..((....((((...)))).....))..)))))))))))))))))))..)).))..)))...))))).......)).)))))).)))))))...)))))))))).)))))).))))))))).).)))..))))))).)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......(((((.((((((((.......})))...((((((((..(((((.({((..(((.((((({(((,......(((.((((.,,(((,(((.....})).})).))))))).,(({{.,..((({.{((|,,.,.(((((....))))).....|...,(((((((..((((...))))....))))))))))}..))))...}.)))))))))))))))))..))...}})).)))..)))))....))).((((({((((((((({(,....,})).)))))))..}.,)))).....)))))))))(((((.(((((..{(..(((..,,...|,{.((((((((..(((((((.{{{.((((({,,.....)))))))))....))))..)))(((((((((((((......(((,{,(((((((,,,((((({....,|||||,((({,....,||.}|||,,{{||,,..)))}}..................|{{({(,..{{((({....}|,}|||.,(((({....{{.........{{{{{{{{{{|,...........,,,(({{{{....{{{..||....((((...))))....,)),,))}}}))}))))})))))),,..,|},}},.,,.,,}}....,,,,}}.}}}}}}.))}}}}),..)))))))))).)))))).))))))))).,.)))..))))))).)))))....
Back