Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
H19:26
Sequence Length
592 nt
GC Content
0.5963
ACAACCAACACGUUCUCCCCACACGACUCUCUCGUUCUCCCCACAGCCAGGUCUCCAGCUGGGGUGGACGUGCCCACCAGCUGCCGAAGGCCAAGACGCCAGGUCCGGUGGACGUGACAAGCAGGACAUGACAUGGUCCGGUGUGACGGCGAGGACAGAGGAGGCGCGUCCGGCCUUCCUGAACACCUUAGGCUGGUGGGGCUGCGGCAAGAAGCGGGUCUGUUUCUUUACUUCCUCCACGGAGUCGGCACACUAUGGCUGCCCUCUGGGCUCCCAGAACCCACAACAUGAAAGAAAUGGUGCUACCCAGCUCAAGCCUGGGCCUUUGAAUCCGGACACAAAACCCUCUAGCUUGGAAAUGAAUAUGCUGCACUUUACAACCACUGCACUACCUGACUCAGGAAUCGGCUCUGGAAGGUGAAGCUAGAGGAACCAGACCUCAUCAGCCCAACAUCAAAGACACCAUCGGAACAGCAGCGCCCGCAGCACCCACCCCGCACCGGCGACUCCAUCUUCAUGGCCACCCCCUGCGGCGGACGGUUGACCACCAGCCACCACAUCAUCCCAGAGCUGAGCUCCUCCAGCGGGAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-200.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 122.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((.(((((.......((((.....))))........(((((((((...(((..(((.((((((((((..((..(((((....(((...(((((.((.(((.((..((((.(......).)))).))))).)))))))...)))..)).))).)).)))))))))).)))..)))...))))..)))))((((((((((((......(((...(((((((...(((((......))))).(((((......).)))).(((((....)))))..................((((((((.....((....)).(((((...(((.((.((.........((((((((((................((((((....(((..((....((((...)))).....))..)))))))))))))))))))..)).))..)))...))))).......)).)))))).)))))))...)))))))))).))))).(((((..((.(...((((....))))...)))..))))).)))))))))................(((((((...((((........)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((.(((((.......((((.....))))........{((((((((.,.(((..(((.((((((((((..((..(((((....(((...(((((.((.(({{((..((((.{.....,}.)))).))))).)))))))...)))..)).))).)).)))))))))).)))..)))...))))..))))|((((((((((((......(((,{,(((((((,,,((((({....,|||||,((({,....,||.}|||,,{{||,,..)))}}..................|{{({(,..{{((({....}|,}|||.,(((({....{{.........{{{{{{{{{{|,...........,,,(({{{{....{{{..||....((((...))))....,)),,))}}}))}))))})))))),,..,|},}},.,,.,,}}....,,,,}}.}}}}}}.))}}}}),..)))))))))).))))),(((((..((.(...((((....))))...}))..))))).)))))))))................(((((((...((((,,...,,.)))))))))))
Back