Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
H19:8
Sequence Length
1481 nt
GC Content
0.6293
GGGGGUAACGGGGGAAACUGGGGAAGUGGGGAACCGAGGGGCAACCAGGGGAAGAUGGGGUGCUGGAGGAGAGCUUGUGGGAGCCAAGGAGCACCUUGGACAUCUGGAGUCUGGCAGGAUUGCAGCAGGACGUCACCAGGAGGGCGAAGCGGCCACGGGAGGGGGGCCCCGGGACAUUGCGCAGCAAGGAGGCUGCAGGGGCUCGGCCUGCGGGCGCCGGUCCCACGAGGCACUGCGGCCCAGGGUCUGGUGCGGAGAGGGCCCACAGUGGACUUGGUGACGCUGUAUGCCCUCACCGCUCAGCCCCUGGGGCUGGCUUGGCAGACAGUACAGCAUCCAGGGGAGUCAAGGGCAUGGGGCGAGACCAGACUAGGCGAGGCGGGCGGGGCGGAGUGAAUGAGCUCUCAGGAGGGAGGAUGGUGCAGGCAGGGGUGAGGAGCGCAGCGGGCGGCGAGCGGGAGGCACUGGCCUCCAGAGCCCGUGGCCAAGGCGGGCCUCGCGGGCGGCGACGGAGCCGGGAUCGGUGCCUCAGCGUUCGGGCUGGAGACGAGGCCAGGUCUCCAGCUGGGGUGGACGUGCCCACCAGCUGCCGAAGGCCAAGACGCCAGGUCCGGUGGACGUGACAAGCAGGACAUGACAUGGUCCGGUGUGACGGCGAGGACAGAGGAGGCGCGUCCGGCCUUCCUGAACACCUUAGGCUGGUGGGGCUGCGGCAAGAAGCGGGUCUGUUUCUUUACUUCCUCCACGGAGUCGGCACACUAUGGCUGCCCUCUGGGCUCCCAGAACCCACAACAUGAAAGAAAUGGUGCUACCCAGCUCAAGCCUGGGCCUUUGAAUCCGGACACAAAACCCUCUAGCUUGGAAAUGAAUAUGCUGCACUUUACAACCACUGCACUACCUGACUCAGGAAUCGGCUCUGGAAGGUGAAGCUAGAGGAACCAGACCUCAUCAGCCCAACAUCAAAGACACCAUCGGAACAGCAGCGCCCGCAGCACCCACCCCGCACCGGCGACUCCAUCUUCAUGGCCACCCCCUGCGGCGGACGGUUGACCACCAGCCACCACAUCAUCCCAGAGCUGAGCUCCUCCAGCGGGAUGACGCCGUCCCCACCACCUCCCUCUUCUUCUUUUUCAUCCUUCUGUCUCUUUGUUUCUGAGCUUUCCUGUCUUUCCUUUUUUCUGAGAGAUUCAAAGCCUCCACGACUCUGUUUCCCCCGUCCCUUCUGAAUUUAAUUUGCACUAAGUCAUUUGCACUGGUUGGAGUUGUGGAGACGGCCUUGAGUCUCAGUACGAGUGUGCGUGAGUGUGAGCCACCUUGGCAAGUGCCUGUGCAGGGCCCGGCCGCCCUCCAUCUGGGCCGGGUGACUGGGCGCCGGCUGUGUGCCCGAGGCCUCACCCUGCCCUCGCCUAGUCUGGAAGCUCCGACCGACAUCACGGAGCAGCCUUCAAGCAUUCCAUUACGCCCCAUCUCGCUCUGUGCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-660.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -685.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 262.7
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((.....(((.....)))......)))..(((((..(((((..((((((((((.(((.((((.(((((.(((..((((((....)))))).....(((.((((.((.(.....).)).)))).)))(((((.((((((.(.(((...(((...((((((.((((.(...(((((((..((..(((.(((..((((((((((.(((((((((((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.((((((..((((((..........))))))..)))))).)))))))).)))).))))))((((.(((.((.((((......((((((((..(((((((.(((..(((..((((...(((((((.((((((((.(((.((((.(((.....((((((((((.(((((...(((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((((......))))..))))))(((......)))))).))))))))))..))))))((((((((((........))))))))))(((.((((((((((..((..(((((....(((...(((((.((.(((.((..((((.(......).)))).))))).)))))))...)))..)).))).)).)))))))))).))).(((((.....)))))..(((((((((((((......(((...(((((((...(((((......))))).(((((......).)))).(((((....)))))..................((((((((.....((....)).(((((...(((.((.((.........((((((((((................((((((....(((..((....((((...)))).....))..)))))))))))))))))))..)).))..)))...))))).......)).)))))).)))))))...)))))))))).)))))))))).)))))).))))....))).......)))))))((((...(((((.....)))))......(((((((...((((........))))))))))))))).....)))))))))))))))...))).))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))...)))))))).(((((((((.(((((((((((((((...((...((.(....(((.((((........)))))))...).)).)).))))))))))))...))).))))))))).))))..)).)))..))))....((((...)))).))))))))))..))).)))).))))).).....)))))))))..)))))).)).)))))))))))).)))))).))).))))))))))..)))))..((((((..........))))))..))).))))).)))).)))))))))))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
........({(.....,||.,...,,},,....))}..(((((..(((((..((((((((((.(((.((((.(((((.(((.,((((((....)))))).,...(((.((((.((.{.....).)).)))).))}(((((.((((({,(.(((...(((...((((((.((((.(...(((((((..((..(((.(((..((((((((((.(((((((((((((((.(((((((,({{(((((((.((((.((((.((((((..((((((..........))))))..)))))).)))))))).)))))))|}|{(((({{({.,(|{({(|,,...((((((((..(((((((.((({.(((..((((...(((((((.((((((((.(((.((((.(((.....((((((((((.(((((..,(((((((((.(((((((..(((((((((((((.(((((((((({(({....((((((((((......))))..))))))(((......)))))).))))))))))..))))))((((((((((........))))))))))(((.((((((((((..((..(((((....(((...(((((.((.(({{((..((((.{.....,}.)))).))))).)))))))...)))..)).))).)).)))))))))).))).(((((.....)))))..(((((((((((((......(((,{,(((((((,,,((((({....,|||||,((({,....,||.}|||,,{{||,,..)))}}..................|{{({(,..{{((({....}|,}|||.,(((({....{{.........{{{{{{{{{{|,...........,,,(({{{{....{{{..||....((((...))))....,)),,))}}}))}))))})))))),,..,|},}},.,,.,,}}....,,,,}}.}}}}}}.))}}}}),..)))))))))).)))))))))).)))))).)))).,{.....},.))))))))))(((((.,(((((.....)))))......(((((((...((((,,...,,.))))))))))),))))}),.)))))))))))))))...))).))))))))))))))))))))))))))..)))}))))))))}...)))))))).(((((((((.(((((((((((((({...{{,,.({.,....{(,,{{{{........}))})}}...}.}}.)).})))))))))))...))).))))))))).}},},,))}))).}}}}),,,,|||},..}})).))))))))))..))),)))),,)))).).....)))))))))..)))))).)).)))))))))))).)))))).))),))))))))))..)))))..((((((..........))))))..))).))))).)))).)))))))))))))..))))))))))
Back