Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

HOTAIR:11

Sequence Length

685 nt

GC Content

0.4934

CGGGGAGCGGAGCCAGAGAGAGAAAAAGAGAGAAAAGUUUCCCGGAGUCUUCAUUAGUUGAUUUCCCUGUCCGCCGCUUUCCCCGGCCGGCUCACCCCCGGUAAAGGAAGGAGGGGCGUCUUUAUUUUUUUAAGGCCCCAAAGAGUCUGAUGUUUACAAGACCAGAAAUGCCACGGCCGCGUCCUGGCAGAGAAAAGGCUGAAAUGGAGGACCGGCGCCUUCCUUAUAAGCUCGUUGGGGCCUAAGCCAGUACCGACCUGGUAGAAAAAGCAACCACGAAGCUAGAGAGAGAGCCAGAGGAGGGAAGAGAGCGCCAGACGAAGGUGAAAGCGAACCACGCAGAGAAAUGCAGGCAAGGGAGCAAGGCGGCAGUUCCCGGAACAAACGUGGCAGAGGGCAAGACGGGCACUCACAGACAGAGGAGUGAUUAUGCAGUGGGACCCUGCUGCAAACGGGACUUUGCACUCUAAAUAUAGACCCCAGCUUGGGACAAAAGUUGCAGUAGAAAAAUAGACAUAGGAGAACACUUAAAUAAGUGAUGCAUGUAGACACAGAAGGGGUAUUUAAAAGACAGAAAUAAUAGAAGUACAGAAGAACAGAAAAAAAAUCAGCAGAUGGAGAUUACCAUUCCCAAUGCCUGAACUUCCUCCUGCUAUUAAGAUUGCUAGAGAAUUGUGUCUUAAAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-186.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -198.7

Frequency: 0.0000

Diversity: 164.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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