Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HOXA-AS3:10
Sequence Length
583 nt
GC Content
0.5763
AGUCGGUAAAUGUGCAAAUCUCUAGUUGCGCUUUAGCUGCUCUGAGGAGUUUCCCAAUCGAGCUAGGAUGGGAAUUCCACCCACGCACCUAUUCCCCCUCCCAGCGCUUCAGACACCUCUCUCAUCGAAAAACCGGGCGAAGGGAAGCCGGCAACGAGCGGAGAACUCUGGCUGAAUUAACGGUGGCUCCCAGAAGCUCCUGCCCCUCUGACAGCUGUCGCUUGGGCAGCCCGAGAGAAGAAUUGUCCUCUUUCCUGGUGCCAGAGGACGCAGGAAAUUAGCCAGGUUGCGAGUUGCAAAGCUGCUGCCGCGGCGCCGGGAACGGAGCGCGCCCAAUCUCCAGCGGGAGCCGCCAGGCCUGGCCUGGCCGGGGCUUCCCUUCGCUCGCCAUCUCCGGACAAAGCACAGCCGAGCCCGGCUGGAAGGCAGAGCUCCGAAGCAGGCAGGACGGAGCGGAGCAAAAGAAUGCGGCUCUAUUCUCGCAAGGGAAAUUAUAAAAAAGUUCAUGUUCACGGUUCUCAUCCACAUGACCGACAGCGGCCAAUGGAAGGGCCGAACAACUCAUAAAGUUGUAUUGCAAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-220.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -229.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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