Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HOXA-AS3:2
Sequence Length
687 nt
GC Content
0.5459
AAAACCCUAUUCAUUUGGCACCCAAAUGUCAUAUAGCCGGAACUGGGGCUUAUAAAGUUUACUGUUUUAUAACUUUUAAAAGGAAAGACGGCAUCAGUGUAAGCAGUCGGUAAAUGUGCAAAUCUCUAGUUGCGCUUUAGCUGCUCUGAGGAGUUUCCCAAUCGAGCUAGGAUGGGAAUUCCACCCACGCACCUAUUCCCCCUCCCAGCGCUUCAGACACCUCUCUCAUCGAAAAACCGGGCGAAGGGAAGCCGGCAACGAGCGGAGAACUCUGGCUGAAUUAACGGUGGCUCCCAGAAGCUCCUGCCCCUCUGACAGCUGUCGCUUGGGCAGCCCGAGAGAAGAAUUGUCCUCUUUCCUGGUGCCAGAGGACGCAGGAAAUUAGCCAGGUUGCGAGUUGCAAAGCUGCUGCCGCGGCGCCGGGAACGGAGCGCGCCCAAUCUCCAGCGGGAGCCGCCAGGCCUGGCCUGGCCGGGGCUUCCCUUCGCUCGCCAUCUCCGGACAAAGCACAGCCGAGCCCGGCUGGAAGGCAGAGCUCCGAAGCAGGCAGGACGGAGCGGAGCAAAAGAAUGCGGCUCUAUUCUCGCAAGGGAAAUUAUAAAAAAGUUCAUGUUCACGGUUCUCAUCCACAUGACCGACAGCGGCCAAUGGAAGGGCCGAACAACUCAUAAAGUUGUAUUGCAAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-246.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -256.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 151.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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