Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00423:1
Sequence Length
1356 nt
GC Content
0.4771
AGUUCUGCCCAUGGGCACAGGCAAUUGGUCUCAACUGCGCAUGGUUUGCCCUGUAAUGCCCUCCAAAUGACCAGCUGAAAAGAUUGAUAGUCUAGAGCAGAGGACCUGCGGCACCUGAUCCACAGACCAGACAGUUAGGAGGCUUCUUUGUCCUCCCAGAAGUGCAGGCAAAGUUUUGGUGUUCAUCAAAUGAGUGAUCAAUGACAGGUUAUCACACCUACUGCAAAAAUAUAUGGCACUUCCCUCUCCACCUCCACAGUGGGCUGUGAAAAUUAAUUGAGUUCAGGCUGUGAAAAACUUAAGCUGCUACAUGAAAUGCAAAAUCAUUAAGCUUCAGAGAUUGUAACAUUCUGCUUGUGGCCUUGGGACUGAAACACCAGAUGUCAUGCCCAAUAAUGACUUCACUUUUCAUCCAACUUCAACAACUCAAGAUUGAGCGCAUUUUGGGUUUUGACCUUGCACUGCUAUACUGAGAUUCAGCAGAAGUUAACUACCCGCAAGACUCCCUCCAGAGAACUGAGGCCUCAGGAUCAUCUUCAACACCUUCACCCAGAGUACGGAGACAAAACCCUUGCCACAUAGACCUGCCACACCACAAUACCAGGUGGAGAUGCACCGUUGCUUGAGUUGGUCCACCAAGAAAGUUGCCAUAGAAGCCUGAAGUUACGACAGCUUAUAAGGAAGUGGUUAUCGAUUAUGACGGAUGGAGAAAAUGGCAAACGUGGCUGAAAGUGGACAUUUUUGCCUUGACAACUCCAUCUGCUCCUCCUCUAUGAAAGCUCCAUCCAGGGCCAGGCGCGGUGGCUCGUGCCUGUAAUCAACACUUUGGGAGGCCAAGAGAUGCCCAGGUCCCAAAUGUAAUAAUUCCAUGGUAUGAUGGGUUGCUGCUGCACCUGUCUGAUUUGAGAUGUUUCCCAGUAUGGUCUUGAAUUCCUCAGCUCAAGCGACCCUCCUGCCACAGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUACAGGCAUGACCCACCAUGCCUGGCUACCUUGAGGACCUUAAAAGAGGGAGCAUAUCCUGAAUUAUCCAGGUGGACCCAAUGUAAUCUGAAGGGUCCCCAUAUGAGGGAGGUAGAGGAGGAUUUGACUACAGAACAGAAGGCAAUGUGACAACUGAAGCAAAAUGCUACAUGCUGGCUUGGAGGAUGGAGGAAGGAGCCAUAAGCCAAGGAAUGCCAGCAGUCACUGGGAGCUGAAAAAGGUGAAGAAAUGGACUCUCCCCGAGCCUGUAGAGCAAGUAUGGCCCUAUUGACCCUUGAUCUCAGCCAAGAGAAAUUGAUUUCAGACUUCUGACCCCCAGAACUGUACGGCAAUAAAUGUGUGCUGUUUUAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-413.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -441.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....((((((((((((.(.(((........).)).).))).)))))...))))............(((((...((((((..(((....(((((((((((.((((..(((.((....)).)))...))).).))).)))))))).(((((((.(.(((.((((...(((((((..((((...))))(((((.(((.....))))))))................((((((.(((((...((((((((((.(((.(((((((........(((((((((.....)))...))))))..(((..........)))....((((..(((((((...(((((((.(((.((((((((((((((((((((((.....((.(((((........))))).))...)))))...........((((((((((.((.(.(((((((((((((((..(((((.(((((............)))))..((.....))..))))).....((((......(((.((....(((.............)))...))))).....)))).))))))))...................((((.........))))))))))).))).).))))))))))))..)))))......))))))..)))..))))))))))..((((........(((((((..........(((((((((.....((((((.(((.((......)).))).)))))).......))))))))).(((((((((((......(((.((.(((((((((((.(((((.((((((((((((((...((((((((((((...(.(((......))).)................(((((.((.((((((((...((...((...((((((((((.............))))))))))...))))...)))))))))).)))))..)))))))))))).....)))))))))))))).))))).))))))))..))).)))))((((....))))........((((.......))))..(((((.............)))))(((......)))..)))))))))))..)))))))........))))..........)))))))..)))).)))).))).))))))))).)))))))))..)))))).)))))))..)))).))).)..)))))))((.....))..........((.(((.....))))).((((.((.......)).)))).)))..)))))))))))(((......)))...((((....))))....)))))))..((((((.........)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....((((((((((({.{,({{.,...,}.},}},}.}}}},,}),..,))}}.......,....((({,..{((({{{..|||,...(((({{{,{||,||{{..(((.{{....)}.)))...))}.)}}}),)}|||}}}|(((((((.{.(((.((((...(((((((..((((,...|}}{||||,|,|,..{({|......}}}}............((((((.(((((..,((((((((((.(((.(((((((........,((({(((({{{,.||,...,}}}}}||{{{....,,....}},....|||{..(((((((...{(((,(({(({{{{((((((({((((({,((({{.....{{.(((((........))))),||...||}}},,|,,,,,...(((((((((,.,{.(.(((((({((((((((..(((((.(((((.....,.....,))))).,||.....,,..))))).,,,,{({{.{,,..{{||||..,}|||....,{{{,....,||,.....,),},..)))).))))))))..,...........||...{{((.........))))))))))).)},.,.)))))))))},},.,,,}).,.}}})}}}},,,))},})))|))}|{{,,{({{........||||||,,|,.....|.(((((((((.....((((((.(((.((......)).))).)))))).,.....))))))))).(((((((((((....{((((.((,(((((((((((.(((((.((((((((((((((...((((((((((((...{.(((......))).,...,............(((((.((.((((((((...(,..,((...((((((((((.............))))))))))...)))}...)))))))))).)))))..)))))))))))).....)))))))))))))).))))).))))))))..})).},|}|{(((....}}})}},}...,(((,.....,.,,||.((((((.............))))))|}......}))}.)))))))))))..}}}))}),,..,,,.,}}},,))).}}}})))))))..}})).)))).))).))))))))).)))))))))..)))))).)))))))..)))).))).}..))))))),,,,...|||,...,....((.{((,....}}))),({((.{(.......)).))}}.}}).,)))}))))))){{{,,,...}}}...{(((....)))}....))))))),,((((({.,.....},)))})}.....,,..
Back