Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00632:3
Sequence Length
749 nt
GC Content
0.3445
AGUGCGACAGACAGCCUCAGAGCUGGUGGGGAGACAGCAUGCCACUGGAAAAAUUCGUAGACAUGGAAUUCCUGGAUCAAAUGGUAUGAAACAAUUUAAGGUUUCUUCCCCCCAACACCUAUCACCUAAUUUAUUUAUUAUAUGUGGUAUAAACAUUAUUUUCCAGCCAUUGUUUUCCUAUUAAUUUUUACCAUUUAUGGUGGUGAUUUUUUGAUAUUUUACAGUUUUACAUGUUAGAUUUCCAUAUCUGACCAUUUUAAGUGUUGUGAUUUUUUUCUUUCCUUUGAUUAGUGUAUUCACCUGUAUUUUUUUCUAGUUAUUUAAUUGCUUCAUUUUUUACAAUUAACUCCUUAAUCCACCUAGAAUUCAUUUUGAUAUAUGGUAUACAGUAGGAUUUAAUUUUUUUUCCCCCUAAUAGGUCACCGAUUGUUUCAGCAUCACUUAUUGAAUAAUCCAACGCAACAACUGUUCUUCCAUUAGAUAGGGUGUAGCUUUCCACAGGUCGGCCAUUUUCUCUUUACCCAAGAUGGUUACAUUUUGCAAUGGUACUCCUACCUUCCUGCAGCUUCUGACAGCAUACUAGAGCACCAUGUUUGUGCUUGUGCGUUUCAAAAAUCCUAGGCACAUGCAGAUUAGGGCAGUAUUUUAAACAGGAUUUUUUUUUUCAUUUUAAAUAUGUUAAGUUUGUCACAUUCUUGUUGCAAAUUAAAAUUAAGGAAUCCAAAUAUAUGAAACCACGGUUUCAGGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.9
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((((.(((..(((.(..((((((((((..((..(((..(((((((((((.........)))))..((((((((.((((.((((((((((...(((..(((.....((((((.((((((.((((......))))...))))))...................(((((.....((((((...((((((((...))))))))....))))))....))))).......(((((((......)))))))........)))))).((......))...........((.(((((..(((((((((...((((((....(((((((............))))))).............))))))........)))))).)))))))).))(((............))).......)))..)))))))))))))..))))....))))....))))..((.(((.((..(((......)))..)).))).))))))))..)))..)).....))))..(((((((((((....)))))))....))))..))))))..))))..)))))))...)))).......((((((((((((((.(((((.(............).))))).)))......((((....((((((..(((........)))..))))))..)))).(((((((.(((....))).)))))))..............))))))).((((((....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((((.(((..(((.(..((((((((((.,((..(({,,(((((({{,,.,,,,{,{,{(|,,..{((((,,{({{((,..(((((.......,}}}}}...,...,,,,,,.((((((.((((......))))...)))))).....,......}}}}},}|||||,,...{(((((...(((((((,...})))))))....}))))}....|||||,.....,(((((((......))))))).,....,,}}})}},||......||...,....}},{{.(({{{.,{{{{(({{{...{{{{((,...{((({{{............}))}}}|....,......,.|}}}}}........)))})).)))}))}}.})|||...,,.......}}}.,.,,,.,|||||||((((({{{{{{.,.....,.))))))))))....((.(((.((..(((......)))..)).))).)),}}}}}..))).})),....}}}}..{{{{(((((((....)))))))....)))}..))))))..})))..)))))))...))))..,...{(,((.{{,,(,(((.(((((.{............}.))))).))).}.,,}))}.,|,.,,......(((((((({..{,,,,,,,,...,,,,,.{((((((.(((....))).))))))),,}}..)))))))))...,,,.((((((....)))))),})}
Back