Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00632:6
Sequence Length
648 nt
GC Content
0.3534
AGACAGCCUCAGAGCUGGUGGGGAGACAGCAUGCCACUGGAAAAAUUCGUAGACAUGGAAUUCCUGGAUCAAAUGGUAUGAAACAAUUUAAGGUUUCUUCCCCCCAACACCUAUCACCUAAUUUAUUUAUUAUAUGUGGUAUAAACAUUAUUUUCCAGCCAUUGUUUUCCUAUUAAUUUUUACCAUUUAUGGUGGUGAUUUUUUGAUAUUUUACAGUUUUACAUGUUAGAUUUCCAUAUCUGACCAUUUUAAGUGUUGUGAUUUUUUUCUUUCCUUUGAUUAGUGUAUUCACCUGUAUUUUUUUCUAGUUAUUUAAUUGCUUCAUUUUUUACAAUUAACUCCUUAAUCCACCUAGAAUUCAUUUUGAUAUAUGGUAUACAGUAGGAUUUAAUUUUUUUUCCCCCUAAUAGGUCACCGAUUGUUUCAGCAUCACUUAUUGAAUAAUCCAACGCAACAACUGUUCUUCCAUUAGAUAGGGUGUAGCUUUCCACAGGUCGGCCAUUUUCUCUUUACCCAAGAUGGUUACAUUUUGCAAUGGUACUCCUACCUUCCUGCAGCUUCUGACAGCAUACUAGAGCACCAUGUUUGUGCUUGUGCGUUUCAAAAAUCCUAGGCACAUGCAGAUUAGGGCAGUAUUUUAAACAGGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-128 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.((((.......((((((((((..((..(((..(((((((((((.........)))))..((((((((.((((.((((((((((...(((..(((.....((((((.((((((.((((......))))...))))))...................(((((.....((((((...((((((((...))))))))....))))))....))))).......(((((((......)))))))........)))))).((......))...........((.(((((..(((((((((...((((((....(((((((............))))))).............))))))........)))))).)))))))).))(((............))).......)))..)))))))))))))..))))....))))....))))..((.(((.((..(((......)))..)).))).))))))))..)))..)).....))))))))))(((((((....)))))))..(((((.(((........((((((...))).))).......))).)))))...(.(((.(((((.(............).))))).))).)...)))).))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((.((((((((((((((((({.{({,,({{,{(((((({{...,,,,{{{,{(|,,.,{{(((,,{({,((...(((((.......,}}}}}...,...,,,,,,.((((((.((((......))))...))))))............}},}},,|||||,,...{(((((...(((((((,...})))))))....}))))}....|||||,.....,(((((((......))))))).,....,,}}))}},||......||...,,,,,}},|{,{{{{|.,{{{|{{{{{.,,||||||,...{((((((............))))}}|.,..,......,.|}}}}}.,,.....))}}}}.)))}}}}}.})|||...,,.......,,}.,.,,,.,||{{||{((((({{{{({.,.....,.))))))))))....((.(((.((..(((......)))..)).))).)),,,,,,..))).}))}....,,,,,,}}}|(((((((....)))))))...,||||.,,,}},),,,|||}))),,)))}..)}{{{{{...{{.{{.|{,.(,(((.(((((.{............}.))))).))).}.,,))))}))},............
Back