Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:17
Sequence Length
605 nt
GC Content
0.5488
CUCACUCCCUCUAUUGCCUCUCCAGACCCAGACUUCACCCUCAGGUCACCCUCACCUGGACUUUGGGGUGCCCCACACCCCGCCCCAGGCCCUGGCCUCUGGAAUAUUUGGAAACUUGAACUGGGCCAGAGGCUUAAGCUCACAUCUGUCUGGAGCCUCAACUUUCUCCUCUGUAAAAUGGGCUAACACUGAAAGAACCUUGCAGAAUCUCAGCAACGUCACAGAGGACAUUGUUAGCACAGCCAGCGGGCUCCUGCUGGGCUGAGUUUGUGGGUAAUCCAAGCCUCGGCAGGUACAGUUCCUCCCUCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -222.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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