Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC00963:18

Sequence Length

910 nt

GC Content

0.5582

CUCACUCCCUCUAUUGCCUCUCCAGACCCAGACUUCACCCUCAGGUCACCCUCACCUGGACUUUGGGGUGCCCCACACCCCGCCCCAGGCCCUGGCCUCUGGAAUAUUUGGAAACUUGAACUGGGCCAGAGGCUUAAGCUCACAUCUGUCUGGAGCCUCAACUUUCUCCUCUGUAAAAUGGGCUAACACUGAAAGAACCUUGCAGAAUCUCAGCAACGUCACAGAGGACAUUGUUAGCACAGCCAGCGGGCUCCUGCUGGGCUGAGUUUGUGGGUAAUCCAAGCCUCGGCAGGUACAGUUCCUCCCUCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUACAGACAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGCAGCUGGGACUGCAGACACGCACCACAGAGCCCAGCCUGAGUCAUUUUGAUUCUGUAACUGGCUUCCUCUCGGCGGGCAGGCUCACACCCUCCACCCCCAGCUGGAGAUGGAAGGAGGAUGCUCACCGCCCAUUCCUCAUGCAGGCCAUCGAUGGAAAUGUCAGACAGUGCGAGUCCACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-320.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -337.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 264.7

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...............((((((...(.(((((..((((.((..((((((......(((((....(((((((.....)))))))..)))))...))))))..))..............)))))))))).))))))....((((.((.((((((((....((..........((((((.(((((((((((((.(..(((.((((((..(((((((((.((.....((((((((...(((((....(((((((....))))))))))))...)))((((.......)))).((((((....(((....(((..((((..(((...((((((((.....((((.((.....))))))(((((((((((((((((..((((((....))).))).)))..))))..)))).))))))((((((((..(((...)))...))))))))....(((.(((((((((((((((....(((((.....)))))...((((((((...))))))))..)))))))).)).))))).))).......))))))))...)))..))))...)))....)))......))))))....)))))...)).)))))))))........)))))))))..).)))))).((((((((((((((((((((((....((....))....)))).)))))))..)))...(((.((((((((.((((.....)))))).))..)))))))))))))))..(((......))).....(((((.((.(.((((((...)))))).)...)))))))......((.(((((..(((...(((((((........)))))..))...)))..))))).))))))))).....)))))).........))....)))))))))).)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........,,,...((((((...(.(((((..,{{,.{{..(((({{......(((((....(((((((.....)))))))..)))))...}})))),,))......,{,.....}))}}))))},))))))....((((.({.{(((((({.((,,.(((..{.((((((((...(((.(((....(((.,((...))}.)))......)))..))).)))))))).}..))}.||.{{{(((((((....)))))))||||,{|{,{,((,...,))}}}}}}}||}{((.....,,|||,|,...}||||||||||{(,||,(((,...,.,,,..,,,.,|}}}},}|}}}})}||.....{{{{{{((((((((..((..(((((.......((((((((....{{((.....)},}).)))))))).{((..(((((.....)))))..))}((((((.,..,....}...))))))..((((((((...))))))))..((((((((.((.{.((((((((.....(((.(((((((..((((({{..,,{(({.{{(((((....(((((((((((..(....)..))))))...........))},))..))))).})..}})}})),,)))))))))))))}........{,.,,......})...(((((((((,{..{(,(((((((.({((((.....)))}})}))..)))))})..,,.))).))))))...)))))))).}.))))))))))}))))...))..))))),,))))))|,,,,,,((((({.{{{{,,...,{|{{{{.|}|,.,,}))}),,))},))})}},))},.)}))}||{|{|||,||.,}}}}}}.)}.))},.,}}))))))))).)))).....