Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC00963:19

Sequence Length

566 nt

GC Content

0.5530

UAAAAUGGGCUAACACUGAAAGAACCUUGCAGAAUCUCAGCAACGUCACAGAGGACAUUGUUAGCACAGCCAGCGGGCUCCUGCUGGGCUGAGUUUGUGGGUAAUCCAAGCCUCGGCAGGUACAGUUCCUCCCUCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGCAGCUGGGACUGCAGACACGCACCACAGAGCCCAGCCUGAGUCAUUUUGAUUCUGUAACUGGCUUCCUCUCGGCGGGCAGGCUCACACCCUCCACCCCCAGCUGGAGAUGGAAGGAGGAUGCUCACCGCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-197.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -207.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 216.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((...........(((((((((((((((..(((((.(((......))).))))).((.......)).(((((..(((((((((((((((.((((..((((.((((.((.(((.......))).))...))))((((((((((((((((................((((..(((.(.((((....))))))))..)))).(((.((((..........((((((((....((((.....).))).)))))))).(((..(((((.....)))))..)))((((((.............)))))))))).)))..).))))))))))...))))).)))).(((((((((((....((....))....)))).))))))))))))))))))(((((((((.((((.....)))))).))..))))).....(((((..(((......))))).)))))))))))..))))).....))))))))))..)).))).....((.(((((..(((...(((((((........)))))..))...)))..))))).)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....{(((({{{{{(.(..(({{((((((,,..,{,,{((((.(({...,,,|||.}}||}.{{,{{{{{(((((,,.,|||||||{({|,{{{{{{(({,..|}}}}||||,||}{({,...,.,|||{|{...))),.,||||((((((,(((...............}||||}}||({({((((..,,||||,,|{({{(||.,||},|||.,,...,,,.,,||||{|,},,||||.}}},)),}),)))}}}}}.(((..(((((.....)))))..)))||||||}}},,}}},)},})))))},,,,.)))}))))),,),)))))}.{|||{{({((((((((((((((....((....))....)))).)))))))..)))...{{||((({{{.((((((.....)))}})}}}..})))),}}|||||||..{({......))}....,|{{|||{{,,.(((((,...,))))).}...}}))})},.,.,.((.((({(,.{{{...{{{{{{{.,,,..},)))))..)).,,)))..))))).)}))))}