Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC00963:30

Sequence Length

612 nt

GC Content

0.5229

GGGCUCCCGAGUGUGGGGAGGGCGGCUCAGCAGGAGCUGCUGCUUCCCAGAAAGUUGAUUAUUUUUAACCCAGGAAGAAGAAAGGAAGGAGGCGAGGGAGAAGGACUCAGAGAAAAGAGGAGAGGAAAAGAGAGGAGAGGAGAGGAAAGAAACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUACAGACGUGUGUCACCAUGCCCUGUUAAUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUCGUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCCCCGAUCUCGGCUCACCGCAAGCUCCGCCUCGCGGGUUCAUGCCAUUCUCCGGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCAUCCGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCCCCUGACCUUGUGAUCCACCCAAGGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-217.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -227.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.3

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.......)))))((((((((.....)))))))).(((((......(((((......)))))...)))))..........(((((((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((.((((.((((((.((((.((((((((..((.((.((..(((((((.((((..((((((.((.......))))))))....))))))))....))).)))).))..))))...((((((..(....)..))))))...((((..(((((....))))).))))............)))).)))).)))))).)))).)))..)))).))))....)))))))))))))((((((((...))))))))((((((((.(((((((.((((((........))).))).))..)))))))))...)))).....)).)))))...)))).))))))....((((((((......(((....)))......))))))))....(((.((((......)))).))).((((..((((...(((((...((((.(...).)))).)))))...))))..).))).((((....)))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

((({{{((,{,..{,|||||((((((((.....)))))))).|||||},....(((((......))))).,.}}}}}.......,..(((((((((((((((((.,((((((((((((((({({((({.((((.((((,((((.(((({(,((((((,.,,,||}||,.{((((((.((((..((((((,{(,....,,})})))))....))))))))....))}.|}}|.}}..}}))...((((((..{....)..)))))){{{((((.,((({{....))))).)))}.}}}......,,}}}}.}}}}.)))))).)))).)))).)))).)))))).))))))))))))))((((((((...))))))))((((((((.(((((((.((((((........))).))).))..}))))))))...))))....,)).))))),..}))).)))))).,,,((((((((......(((....)))......)))))))).,,,{{(.((((......}))).))).{(((..((((.,.(((((...((((.{...).)))).)))))...))))..,.))).{{{{,,,,)}}})))........