Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:49
Sequence Length
5240 nt
GC Content
0.5613
GUUAUUUGGCUUGGCAGUCAGAGGAGGACAAGUUGCAGGAGAGAGAAUCAAAGAUUCAGGCUGCCUAGUGUGGCCACCGCCCCAUCAGCCCUAAGAUGAUCGCAGCCCCUUUCUGGCCACUGAAUAUGUGGGCACCCCAGACCUCUGUGGCAAGGCUGGGUGAGAGCUGUCUUUUGUGCACAGGUGCCCCUAGUCCCCCACCACUAGUGAGCAUUCACACACAGAGGUGAACAGCCCCCUUGUGGGCCUGGAGGCUCCUAGGCCAGGUAGAGAUGACCAGAGUAGGGAGCAGAGAAUCCCCAGUGCCUAGCACAGUGACUGGCACUGAAGCAUUUGUUGGAUGAAUGAAUGAGUGAUUGCCUGACCUCAGGCCCAGGGAGGAAGGCCUGGUGUGCAGGGCAGCUCCUGGGAGGCUUCAGGGAUGGGGAGAGGACAGAGAGGGACUGGGAGAGCCACAGGAAGGCAGCCUCAUCUGAUGACUGACUUGGGAGGGAAACAGAAUGUGGGCUGUGUUUCUGGGGAAACACCCCCCUGAUGCCCGGGCACCCAGGAACUUCCAGGUACCCCCGGAUCACCCCAGUGAGGACACUCCACAAUUCCCCAGGAGGCAUCACAGUGGGGCCGUUAAACCCAGGGACUUGGGAUUCAGACACUUCUGGGCUCCAGUCCACCCCUCACUGGCUGGACCAGUUGCCUCAGUUUCCCUAUGUGCACGGGGGACGGAUAGGACCACGUGCUGCACAGGUUUGCUGGGAAGGCCAUAUGAGAGGUGCCGGCUCAGCACAUCCUGUCUGCCAUUGUUACAAACAACAGCACGGGAGAGUCGGGGAGCAGAGUCGGCCAAACGCAAGACCCUGGGCUCUGGCUUCCCUGUGCUACUGACCUAUGGGGUGGCUUUGGACAAGGCCCAGCCUUUCUCCAGGCCUUAGUUUCCCCAUUUGUACAGUCAGGCCCUGCUAACUUGGACAGACUUUGGCCCUUCUCCAAGCCCCACAGAGACAUCAGAGACAUGUGCACACACGGCCCUGGGAUUGCCGACAGACACACAGGCACACAUAGGCACGUACACACAGGCAUACAGACACAGGCACAGACUCACACUCGGCCCCUCCCCACUCACACUCGCUCACACUCAUGCUCACACUCACACCAACCCCCCUCCCCCAAAUCUGCUGCGCACCAACGGUUGGUGCGAGCGGGGUUGAGAACGGGAGGAAAAAAGCCCACGACUCAGCCCGGGAAGAGGGGUGCGGUGGGGGAAGGGCGGGCGAGGGAAAUGACAGCCCGCGGUCCCCCUCGAGUCCCGGCUCAUGAAUAUUAAUACGGCGGUAAUUAAAAUGCAGGGACGCAGCAGGAUGGAUGCGGCUGCCUCCGGAGCGCGGGGGAGCGCGGAGUCUUUGCAGGCGGGUGAAGCCCGCUCCUCGCCGGCGAAAAGCGGGGCCGGGCUCCGGGGCCUGGGUCCGGGGCGGGCGGGAGUGGGGACAUUUUUCGUGGUCCCGAGCGUCCCGUCCCGGCGUCCCCGCCCCCGCCCCGCGGCCGCCUCUCCACGCCCUGCCCCGGGCCGCCCGCCAGGCCGCCGUUUCCCGGAGCCGGCCCCCUCCCGCCCUCGCGGCCGGCUGAUGUCAUCUGCACACAACUUUCCGCUUCCCGGCCCGUCUCGGGGCCCUGAGUCAUCGCCGCCCCCGGCCCCGACGCUGGCCUGCGGCGUCUGUUUGUGCAGAGCGAGGCCCCGCCGGCCGGGCUUGACGUCAGGCUGGCAGGGCCUGGAACGGCCCCGCAUCGCGGCCCCCUGGGGGCAGGACGACACCGCUGGGGGCCGAGGGCAGGGCACGCCUUCGGAAUCCGGCUUCGAAGCCGGCCGCCUGACCUGGGGCAAGUGCUUUCAACUCUCUGAACUUCGGUUCCUCAUCUGCCAGUUGGCAGACGCUCAGCAAAUCUUCCUAGACUCACGGGGCGAAUUGUACAGUUGGGUAAAUCGAGGCCCAGAGAUGGCAAAAGGACCGUCCAAGGUCGUACAGCCACCCGGAAUUACAAUUCUUUUCUGCCGGGUCACACGCUGUCAUCCACGUGUUACCUAAGAGAGCUUUCCAGCCUGUGCUAAGAAAACUGCCCCACAUCAUCUGCAGUAGGACGGGGGAGUUGGAGCCCUGGUCAGGCCACUCUGCUACUGACCACAGUUUUCUCAUCUCUAAAAAGGCGCAGUAACAAUAUAAUUACCGUAUGCAGUCCCCCAGGAUACAGGGUCAAAGGAGAGCACAACCAUCGCAGUUGGAAGCCCAUGGGGCAGCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUACAGACGUGUGUCACCAUGCCCUGUUAAUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUCGUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCCCCGAUCUCGGCUCACCGCAAGCUCCGCCUCGCGGGUUCAUGCCAUUCUCCGGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCAUCCGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCCCCUGACCUUGUGAUCCACCCAAGGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGUGCCCGGUCAAUUUUUAUAUUUUUUGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUGUCGAACUCCCGACCUCAGGUGAUUGUCGGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCAGCCGGUGGGCAGCCAGUUGUGUUCCGGGAGGAGGAGGACACCCUGGAAAGACAGUGGGGCCAGACACUGAACUGCCUUUGGAAGCAAGUAGGAGCAACAGCGAAGGUUUGCUGGCUCAGAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGCAGCUGGGACUGCAGACACGCACCACAGAGCCCAGCCUGAGUCAUUUUGAUUCUGUAACUGGCUUCCUCUCGGCGGGCAGGCUCACACCCUCCACCCCCAGCUGGAGAUGGAAGGAGGAUGCUCACCGCCCAUUCCUCAUGCAGGCCAUCGAUGGAAAUGUCAGACAGUGCGAGUCCACGCCUGAACACUUCUGGGGUCCGCUCUGGGACUGACACUGGCAGAUCCAUCGGUGAGCUCCCGCCUGCCACCUCUGGGCCUGCAUUGCGGUGAUAGGGCCAAGGGCCUGGGCCUUCAAUUCUCCAGACUUGCCAAAAUGCUCAGCGCAGGCCUCGUCGGCAACUGCAGACAAGCAGAGGCAGCACCUGGGCUCUGCCUGUGCCUGGCACAGUGAAGCGAGGGUGGGGGCAGGAAUGAGGGUCCUCUCCAUGCAAGGGGGGAAGAUAGAAGAACAAAAUUUCACCCUAAUGUAGUGUCUUUAGACCGUGCAAUGUUGUGCUCCUGUUAGUCUGAUAUCAGGGGCUUGCAGCCUGGCAAAGGAAAAAAAACAGGCUGAGGCACAUGAUAGAAGACAGGCAGGGAUGCCACAAUCAUAACCAUGGCAAAGACCAGGAUCAGAAAGGCCCACCAUCUCUGACCCCAAAUCCCUGGGCAGAUGGUUCCAGAACUCAGAAUUUUCCCAGUUGUAGAAAGAUGGGGCCAGGUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCAUUUUGGGAGUACAAGGUGGGCGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAAAAAAAAAAAAAUUAGCCGGGCGUGGCGAUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGCCAGGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGCGCCACUACACUCCAGUCCGGGCGACAGAGCAAGAGUCCAUUCCCCCACCACCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAUGAUGUGAUACAUAUCACAUAUUUCCUAACACCCCCAACCAAACACAUUUAUGCAUAUGCAUAAAGCAGACGAGGAAAGAUUCUAAAUAGGCUCUGAAUCUCAGUUUUCUCAUCUCUACAAUGGGGCAGUGAUGGCAUGCACCUCCCAGGGCUGUUCUGAGAAUCUGAUGCCUCCCAUUGCACUGGUGAGCCUGGCACAGGCACAGGUCCCACCCCAGGCCCUUUGAACUGGCUGUUCCUUUGGCCUGGAACAUUCCUCCCCAGAUACCUCCUGAGAGGGCUCCCUCACUUCCUUCAAGGCACUGCUCAAAUGCUACCUCUUCACAGAGGCUUUCCCUGACCACCCCGUCUCUUUCCUCUUCCUGCAUAGCCUCUGUCACCUGACAUUUUAUGUCAUAAAUUACUCAUUUAUUAAUUUCCUGCUCUCCCACAGUGGCACCCGAGCUCUGUGAGGGCAAGACUUUGUUCGGUUGUGGGCUAUGCCCCCAACCCCUCGGACAGUGCCUGCACAGGUGGACAUUUUUGUUGGAUGAAGGAUUUUCUGUUAAAUGUGUCUGGCACACACAGAAAAACAAAGCCCAGCAGAUGCCGUUCCAUUGUUUGCUGACUUUCAUUGAUUCUAUGAGAAGUCUGCAGUCUUUUGCAGCGUUGUUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2325.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2408.6
Frequency: 0.0000
Diversity: 1022.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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