Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC00963:5

Sequence Length

2119 nt

GC Content

0.5512

CCGGCCCGUCUCGGGGCCCUGAGUCAUCGCCGCCCCCGGCCCCGACGCUGGCCUGCGGCGUCUGUUUGUGCAGAGCGAGGCCCCGCCGGCCGGGCUUGACGUCAGGCUGGCAGGGCCUGGAACGGCCCCGCAUCGCGGCCCCCUGGGGGCAGGACGACACCGCUGGGGGCCGAGGGCAGGGCACGCCUUCGGAAUCCGGCUUCGAAGCCGGCCGCCUGACCUGGGGCAAGUGCUUUCAACUCUCUGAACUUCGGUUCCUCAUCUGCCAGUUGGCAGACGCUCAGCAAAUCUUCCUAGACUCACGGGGCGAAUUGUACAGUUGGGUAAAUCGAGGCCCAGAGAUGGCAAAAGGACCGUCCAAGGUCGUACAGCCACCCGGAAUUACAAUUCUUUUCUGCCGGGUCACACGCUGUCAUCCACGUGUUACCUAAGAGAGCUUUCCAGCCUGUGCUAAGAAAACUGCCCCACAUCAUCUGCAGUAGGACGGGGGAGUUGGAGCCCUGGUCAGGCCACUCUGCUACUGACCACAGUUUUCUCAUCUCUAAAAAGGCGCAGUAACAAUAUAAUUACCGUAUGCAGUCCCCCAGGAUACAGGGUCAAAGGAGAGCACAACCAUCGCAGUUGGAAGCCCAUGGGGCAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUACAGACGUGUGUCACCAUGCCCUGUUAAUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUCGUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCCCCGAUCUCGGCUCACCGCAAGCUCCGCCUCGCGGGUUCAUGCCAUUCUCCGGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCAUCCGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCCCCUGACCUUGUGAUCCACCCAAGGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGUGCCCGGUCAAUUUUUAUAUUUUUUGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUGUCGAACUCCCGACCUCAGGUGAUUGUCGGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCAGCCGGUGGGCAGCCAGUUGUGUUCCGGGAGGAGGAGGACACCCUGGAAAGACAGUGGGGCCAGACACUGAACUGCCUUUGGAAGCAAGUAGGAGCAACAGCGAAGGUUUGCUGGCUCAGAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGCAGCUGGGACUGCAGACACGCACCACAGAGCCCAGCCUGAGUCAUUUUGAUUCUGUAACUGGCUUCCUCUCGGCGGGCAGGCUCACACCCUCCACCCCCAGCUGGAGAUGGAAGGAGGAUGCUCACCGCCCAUUCCUCAUGCAGGCCAUCGAUGGAAAUGUCAGACAGUGCGAGUCCACGCCUGAACACUUCUGGGGUCCGCUCUGGGACUGACACUGGCAGAUCCAUCGAUGCCGUUCCAUUGUUUGCUGACUUUCAUUGAUUCUAUGAGAAGUCUGCAGUCUUUUGCAGCGUUGUUUUCCUAUGUAUAAUUGUCUCCUCCCACCCCACUCACCCCAGCUGCUUUCCACAUUCUCUCUCUUUGAUUUUCAGCAGUCUGCCCAUGAUGUGCCUAAAUAGGACUUUCUUUGCAUUCAUCUUGGCUGGGGCUCACUGAACUUUCUGAAUCUGUAGAUUAAUUUUCUUUUUUCAAUAAACCUUGGAAUAUUUUCAGCAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-793.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -828.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 618.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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