Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:55
Sequence Length
639 nt
GC Content
0.5352
GGCUUCGAAGCCGGCCGCCUGACCUGGGGCAAGUGCUUUCAACUCUCUGAACUUCGGUUCCUCAUCUGCCAGUUGGCAGACGCUCAGCAAAUCUUCCUAGACUCACGGGGCGAAUUGUACAGUUGGGUAAAUCGAGGCCCAGAGAUGGCAAAAGGACCGUCCAAGGUCGUACAGCCACCCGGAAUUACAAUUCUUUUCUGCCGGGUCACACGCUGUCAUCCACGUGUUACCUAAGAGAGCUUUCCAGCCUGUGCUAAGAAAACUGCCCCACAUCAUCUGCAGUAGGACGGGGGAGUUGGAGCCCUGGUCAGGCCACUCUGCUACUGACCACAGUUUUCUCAUCUCUAAAAAGGCGCAGUAACAAUAUAAUUACCGUAUGCAGUCCCCCAGGAUACAGGGUCAAAGGAGAGCACAACCAUCGCAGUUGGAAGCCCAUGGGGCAGCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGACGGAGUCUCACUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-214 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -224.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....))))((((((((((((.(((((....((((((...((((((..((((((((.((((((((((....)))))).(((..((((.((.((((........)))).)).))))..)))))))..))))))))..)))))).(((...(.((((......)))).)...)))((((((..................)))))).(((((.((.....))))))).......))))))..((((((((((.((......(((((............))))))).)))))....))))))))))))))))))..((((.((..(((((.(.((.((((.............(((..((((........)))))))............)))).)).)))))).)).)))).....((((.((........))..))))((((((((((..((((.((((((.(((...............)))))))))((((((.........((.(((.((((.((((.((((...........)))))).)).)))).))).)).))))))......(((..(((((.....)))))..))).))))..).)))))))))....))))...((((((...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((....))))((((((((,,,,.,||||..,.(((((({{{((((((..((((((((,((({((((((....)))))).(((..((((.((.((((........)))).)).))))..)))})))..))))))))..)))))}{(((...{.((((......)))).}...)))}..,((({,....,}}}},{{{{...{(((.(((((.((.....))))))).)))}.,))))||{{((({,(((((,((......(((((.,,.........}}}}),}.},))}||||}}|||||,,|||||||||..,,,,,|,.}|||||},.}}}}},,...,,,......|{{(({((((........}))).}}.})).||||,,,.))}}}),))}),,..)}))))}....,.......)))))}})).,.,|{((((((((((..((((.((((((.(((...............)))))))))(((((({(....,,,({.(((.((((.{{{{.{{{{...........})))}).)).)))).)}).)),)))))),,,,,.(((..(((((.....)))))..))).))))..}})))))))))).,.))))...((((((...))))))
Back