Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:58
Sequence Length
982 nt
GC Content
0.5346
GCUUUCAACUCUCUGAACUUCGGUUCCUCAUCUGCCAGUUGGCAGACGCUCAGCAAAUCUUCCUAGACUCACGGGGCGAAUUGUACAGUUGGGUAAAUCGAGGCCCAGAGAUGGCAAAAGGACCGUCCAAGGUCGUACAGCCACCCGGAAUUACAAUUCUUUUCUGCCGGGUCACACGCUGUCAUCCACGUGUUACCUAAGAGAGCUUUCCAGCCUGUGCUAAGAAAACUGCCCCACAUCAUCUGCAGUAGGACGGGGGAGUUGGAGCCCUGGUCAGGCCACUCUGCUACUGACCACAGUUUUCUCAUCUCUAAAAAGGCGCAGUAACAAUAUAAUUACCGUAUGCAGUCCCCCAGGAUACAGGGUCAAAGGAGAGCACAACCAUCGCAGUUGGAAGCCCAUGGGGCAGACCCAGACUUCACCCUCAGGUCACCCUCACCUGGACUUUGGGGUGCCCCACACCCCGCCCCAGGCCCUGGCCUCUGGAAUAUUUGGAAACUUGAACUGGGCCAGAGGCUUAAGCUCACAUCUGUCUGGAGCCUCAACUUUCUCCUCUGUAAAAUGGGCUAACACUGAAAGAACCUUGCAGAAUCUCAGCAACGUCACAGAGGACAUUGUUAGCACAGCCAGCGGGCUCCUGCUGGGCUGAGUUUGUGGGUAAUCCAAGCCUCGGCAGGUACAGUUCCUCCCUCAGCAGGGCCCAGGACACAGUGAGCAUACAAUAGACAUUAGCUGCUGUGGUGUCUUGAUUUCAAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-332.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -349.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 282.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...((((((..((((((((.((((((((((....)))))).(((..((((.((.((((........)))).)).))))..)))))))..))))))))..)))))).(((...(.((((......)))).)...)))((((((..................)))))).(((((.((.....))))))).......))))))..((((.(((((.((......(((((............))))))).)))))((((((.(((((((((((((((......))..))))))).(((((((.....((((...(((((((((((........))))....))).((((....)))).(((((((...((.(.((.((((.......))))((((.((((((((..((((.((........))..))))..)))))..))).))))((((((.....))))))))))).))))))))))).))))......)))))))......))))..(((((((.(((........).)).)))))))(((..(.((((((((...(((.(((....(((.(((...))).)))......)))..))).)))))))).)..)))....(((((((.((((.((((((((((((((((((.((....)))))).))))))(((.......)))...))))))))))))..((((((((((((................((((..(((.(.((((....))))))))..)))).(((.((((..........((((((((....((((.....).))).)))))))).(((..(((((.....)))))..)))((((((.............)))))))))).)))..).)))))))))))...)))))))(..(((((((((((....((....))....)))).)))))))..))).))))))))))..((.((((.....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,,,((((((..((((((((,((({((((((....)))))).(((..((((.((.((((........)))).)).))))..)))})))..))))))))..)))))}{(((...{.((((......)))).}...)))},,,(({{,....,,,,,,|{{{.,,||({.(((((.((.....))))))).})}}..))))||,{(((({(((((,((.....,(((((.,,.........}}}}}}}.}}))){{{{,|{((((..((((((({{......)}..)))))))..))}}}}.,..,|||....,|(((({(((,........}}}}.,,.|}}.{{{{,{,.}},},||||{|,...||}|}||....{......,))))|||||,..{(((({.({{(,{(,,......,}|,|||}..||..}||}))....,((((((.....)))))))}}))})||,,,|((((((((..{{.{{,{,...}},)}.})..))))))))}...|||...,.,,}||}})|||}},{{{..|.((((((((...{{(.(((.,..(((.,((...})|.)))......)))..}}).)))))))).}..})}.||,(((((((,((((.(((((((((((((({{{{,((....})))}).))))))(((.......)))...})))))))))))..((((((((((({................((((..(((.(.((((....))))})))..)))).{{{.{{{{..........((((((((.,.,|,{{.,,,.)},}).)))))))).(((..(((((.....)))))..)))((((({.,..,.,..}...)))))))))}.))).,)}))))))))))).,,)))))))||{{((((((((((....{{....))....)))).))))))},,))},{,||,||}},..,|,|{||,,,..))))},
Back