Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC00963:62

Sequence Length

1414 nt

GC Content

0.5764

ACUCCCUCUAUUGCCUCUCCAGACCCAGACUUCACCCUCAGGUCACCCUCACCUGGACUUUGGGGUGCCCCACACCCCGCCCCAGGCCCUGGCCUCUGGAAUAUUUGGAAACUUGAACUGGGCCAGAGGCUUAAGCUCACAUCUGUCUGGAGCCUCAACUUUCUCCUCUGUAAAAUGGGCUAACACUGAAAGAACCUUGCAGAAUCUCAGCAACGUCACAGAGGACAUUGUUAGCACAGCCAGCGGGCUCCUGCUGGGCUGAGUUUGUGGGUAAUCCAAGCCUCGGCAGGUACAGUUCCUCCCUCAGGUGAGUGUUCCACCCCCAAGUGAGCAUCCUGCUGCCCUUCCUGCAAAUCAGGCCCCUGGGACACUUAGUGCUGAGCCUUGGGGGUGGGGUAUUUGAUCGGGGUUCCUGACAAGUGGCUGGGUUGUCUGUUCCCUCUCUUCAGAGGGAGCCUCCAUGGGUGGCCUGGGCUCACAUCGGCUCCUCCAGUCCAGCAGAGCACCCCCCCCUGGCUGCCCAGCUUGUUGAGAGAACUUGCUGAGCAGGACAGUGAGCCCUUCCUGGUGGGGAACCGGAAUCAGGAGAAGACAGAGGGGAGGUGGCAGGCCCCAGGAUGGAGGGAGGGCAGCUGAGCUGCCUGCCCUCAUCCUCCCUGCCCUUCAGGUAUUAGGGCCCUUCCCAUGGCCCAGUAGGAACCCAGCGGCUCACCUGAGCCCGGACUAAGGAUGGGGCAUUUUACCCCAUAUGCAGAGAUGAGAAACAGAGGCCCAAGGAGGGAAGGGACUGAACACAGGGUGGAACAGCCCUGGGCUGCGCCUGUGUUUCCAUCCGCCUUCCUCCUGCCUGUGCUCGAGUCACGUGCUGGUGUGCAGGGAACAGGAAGACAGCCGCUGCCCUCACAGGCUCAGGGUCUAGCAGAGUCCACAGUGACCACAGGCGAAUAAACAAAGGCAGUGAGACAGAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGGUAGGAAACACACUGGAAACUGAUAACUCCAUGUGCUCAUCGCCAUGUGGUUUCUGCUGGUCUGGGGAGCCGGGGACAAAGAGCAGAAAACAUGGUUCCAGGUAGAGGGGGGUAGCACGCAUGAAGACCGUGAGGCAGAAAGCACACAAAACUGAAUUGGAGAGAAGGCCCAAAUGGCUAGAGCUCAGAACCCGAGGAGAGGAGAGGGGAGGAAAGGAGAGACCUCCAGAGCCUGGGGAUGAUAUGUAGAGAGCCCGGGAACCAGCGCUGGUUAGAGAGGGAAGGAAGCCUGCAGCCUUGCAUUUUAGAAAGAUCUGGCUGGCUGAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-579.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -603.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 393.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((....(((((((.(((((((...((((..(((((..((((((((((((....(((((((.....)))))))((..((((....))))..)).......(((.....((((((.(((.(((((((.(((........).)).)))))))(((..(.((((((((...(((.(((....(((.(((...))).)))......)))..))).)))))))).)..))).......(((((((....)))))))((((((((((.((....)))))).)))))).))).)))))).))).)))))))((((((((((((((((((.(((((...(.(((((..((((.....)))).....))).)))...))))).)..))))))))))))))))).....))))).)))))...)))))))))))....(((((((((....)))))))))((((.(((((...((((((((.(((.((((((((((((.(((....((((((((((((((((.((((((..(((.....)))..)))..((.((((..((((((.((((((((((....))...))))))))......(((((((((.((((((....((((((.((((.(((((((...))))))).)))))))))).)))))))))).(((.((((((((........)))))..)))..)))((((((((..((((..((((.((.....((((((.......))))))..((((.(((..((..((.((((...((((((((.((((..(((((((((((((..((....))..)))).)))))))))...))).).)))))))))))).)).))..))).).)))....)).).)))..)))).....)))))))))))))...))))))..)))).))..((.((((((.((((((((((((........((((.(((((.((((......(((....))))))).)))))....((((((((....((((.....).))).)))))))).(((..(((((.....)))))..))))))).((((((((..(((....))))))).))))..((((.((((..........))))))))....))))).))))))).))).))).))))).))))))).((...((((..........))))...))...))))))).)).(.((((.....)))).)((.....))........))).))))))).))..)))...)))....)))))))).))))).)))).)))))))(((((..........)))))....((((((................))))))(((((....)))))..)))))))(((...))).(((((..((....((((....)))))).)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((.,,.(((((((.{{((({(.,,{{,,,,((((({,,(((((((((((,...,((((((.....))))))|,{{{((((,..{({{{{{{{..,,.{{,{,...,,|||,||.,||}||||||,.{((,{{{...{|{|,{|||||||{((..{.((((((((...(((.(((....(((.,((...))}.)))......)))..))).)))))))).}..))}.,,.{{{(((((((....)))))))||||{|||,,{((,...,)))}|||}}}}}{||..,,,,,)}},},,}))))||(((((((((((((((({.(((((...(.(((((..((((.....)))).....))).))}...))))).}..))))))))))))))))},....))))),))}))}}.))))))))))}....(((((((((....)))))))))((({.{{{{{,,,||||((((.,.{,{{(((({(((({,(((,,,,((((((((((((({((((.((((..(((.....)))..)))).)))),.{.,{{{{{{,((((((((((....))...}))))))}....,.|,||||{{(.((((((....((((({{((((.(((((((...))))))).)))))))))).))))))}}}).{{(,{{.(((((........))))),}}},,.,}|{,{,(((({.,,,|}}|||},.{,..,,((((((.......))))))..{,,,.((({{(...((.((((...((((((((.((((..((((((((((((,..(((({...})))))}))))))))),..))).).)))))))))))).)).,}..}|}.{.||(((((.((((((.(((((((.((({{||{{{|||,||,,.|||{|,.,|||,.,}.}||.||.,.|,|||{,,,||||..........|||.|{{{{.{{({{{.{,{{{(....))}}))).}}}}}....((((((((....{{({.....)},}).)))))))).(((..(((((.....)))))..))))}))))).))))))).)))))).)))))},),),..((((.((((..........))))))))}}}}))|}}|))}))}}})))}))),)))))}))))))},,,...,|||,.......,}))}))}))}.,,)))}}}}.}}.|.|,,,.....)|}}.}|{.....)).,.,....})).})))}}|.}..{(((.....)))}.}}})))}).))))).)))).))))))){||{{...,,,,...}))))....((((((................))))))(((((....)))))..))))))),|...,||,.(((((..((....({{,....})}))).))))).,.