Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:69
Sequence Length
620 nt
GC Content
0.5210
AUUCUCAGGGGCUCCCGAGUGUGGGGAGGGCGGCUCAGCAGGAGCUGCUGCUUCCCAGAAAGUUGAUUAUUUUUAACCCAGGAAGAAGAAAGGAAGGAGGCGAGGGAGAAGGACUCAGAGAAAAGAGGAGAGGAAAAGAGAGGAGAGGAGAGGAAAGAAACGGAGUCUCACUCUGUCACCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUACAGACGUGUGUCACCAUGCCCUGUUAAUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUCGUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCCCCGAUCUCGGCUCACCGCAAGCUCCGCCUCGCGGGUUCAUGCCAUUCUCCGGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCAUCCGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCCCCUGACCUUGUGAUCCACCCAAGGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -228.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((.(((((.......)))))((((((((.....)))))))).(((((......(((((......)))))...)))))..........(((((((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((.((((.((((((.((((.((((((((..((.((.((..(((((((.((((..((((((.((.......))))))))....))))))))....))).)))).))..))))...((((((..(....)..))))))...((((..(((((....))))).))))............)))).)))).)))))).)))).)))..)))).))))....)))))))))))))((((((((...))))))))((((((((.(((((((.((((((........))).))).))..)))))))))...)))).....)).)))))...)))).))))))....((((((((......(((....)))......))))))))....(((.((((......)))).))).((((..((((...(((((...((((.(...).)))).)))))...))))..).))).((((....)))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{..((({{{{{(,{,,.{{|||||((((((((.....)))))))).|||||},.,..(((((......))))).{,|||||,,,,,,.,,.(((((((((({(((({(,.{((((((({(((({({({(((,.((((,((((,((((,(((({(,(((((({.,,}||}||}.{((((((.((((..((((((,{(,....,.})})))))....))))))))....))}.|,,|.}}..}))),.,|||{{|,,|.,..}..}})}||{{{((((.,((({{....))))).)))}.}}},,..,,,,,}}}.}}}}.)))))).}))).)))).)))).)))))).)))))))))))))}((((((((...))))))))((((((((.(((((((.((((((........))).))).))..}))))))))...))))....|)).}}))),,,}))).)))))).||,((((((((......(((....)))......)))))))).,,.{{{.((((......}))).))).{(({,.((((.,.(((((...((((.{...).)))).)))))...))))..,.))).{(((....)))))))..,,....
Back