Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC00963:7
Sequence Length
3912 nt
GC Content
0.5534
CCGACGCUGGCCUGCGGCGUCUGUUUGUGCAGAGCGAGGCCCCGCCGGCCGGGCUUGACGUCAGGCUGGCAGGGCCUGGAACGGCCCCGCAUCGCGGCCCCCUGGGGGCAGGACGACACCGCUGGGGGCCGAGGGCAGGGCACGCCUUCGGAAUCCGGCUUCGAAGCCGGCCGCCUGACCUGGGGCAAGUGCUUUCAACUCUCUGAACUUCGGUUCCUCAUCUGCCAGUUGGCAGACGCUCAGCAAAUCUUCCUAGACUCACGGGGCGAAUUGUACAGUUGGGUAAAUCGAGGCCCAGAGAUGGCAAAAGGACCGUCCAAGGUCGUACAGCCACCCGGAAUUACAAUUCUUUUCUGCCGGGUCACACGCUGUCAUCCACGUGUUACCUAAGAGAGCUUUCCAGCCUGUGCUAAGAAAACUGCCCCACAUCAUCUGCAGUAGGACGGGGGAGUUGGAGCCCUGGUCAGGCCACUCUGCUACUGACCACAGUUUUCUCAUCUCUAAAAAGGCGCAGUAACAAUAUAAUUACCGUAUGCAGUCCCCCAGGAUACAGGGUCAAAGGAGAGCACAACCAUCGCAGUUGGAAGCCCAUGGGGCAGCCCAGUGCAGAUGCAUCUGACUUACGAAACUUCAGUGACACCUGCUCUGUGCCAGACACUGAAGAUGGAGCAGUGAACAGCACUGACCCAGCCUGUCCUCCUGUUGCCUGCAGGCCAGAAGCAAGGUCUCGCUGUGUUACCCUGGCUGGAGUGCAGUGGCUACUUACAGGCAUGAUCAUAGCAUACUGCAGCCUCGAACUCCUGGACUAGAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGCAGCUGGGACUGCAGACACGCACCACAGAGCCCAGCCUGAGUCAUUUUGAUUCUGUAACUGGCUUCCUCUCGGCGGGCAGGCUCACACCCUCCACCCCCAGCUGGAGAUGGAAGGAGGAUGCUCACCGCCCAUUCCUCAUGCAGGCCAUCGAUGGAAAUGUCAGACAGUGCGAGUCCACGCCUGAACACUUCUGGGGUCCGCUCUGGGACUGACACUGGCAGAUCCAUCGGUGAGCUCCCGCCUGCCACCUCUGGGCCUGCAUUGCGGUGAUAGGGCCAAGGGCCUGGGCCUUCAAUUCUCCAGACUUGCCAAAAUGCUCAGCGCAGGCCUCGUCGGCAACUGCAGACAAGCAGAGGCAGCACCUGGGCUCUGCCUGUGCCUGGCACAGUGAAGCGAGGGUGGGGGCAGGAAUGAGGGUCCUCUCCAUGCAAGGGGGGAAGAUAGAAGAACAAAAUUUCACCCUAAUGUAGUGUCUUUAGACCGUGCAAUGUUGUGCUCCUGUUAGUCUGAUAUCAGGGGCUUGCAGCCUGGCAAAGGAAAAAAAACAGGCUGAGGCACAUGAUAGAAGACAGGCAGGGAUGCCACAAUCAUAACCAUGGCAAAGACCAGGAUCAGAAAGGCCCACCAUCUCUGACCCCAAAUCCCUGGGCAGAUGGUUCCAGAACUCAGAAUUUUCCCAGUUGUAGAAAGAUGGGGCCAGGUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCAUUUUGGGAGUACAAGGUGGGCGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAAAAAAAAAAAAAUUAGCCGGGCGUGGCGAUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGCCAGGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGCGCCACUACACUCCAGUCCGGGCGACAGAGCAAGAGUCCAUUCCCCCACCACCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAUGAUGUGAUACAUAUCACAUAUUUCCUAACACCCCCAACCAAACACAUUUAUGCAUAUGCAUAAAGCAGACGAGGAAAGAUUCUAAAUAGGCUCUGAAUCUCAGUUUUCUCAUCUCUACAAUGGGGCAGUGAUGGCAUGCACCUCCCAGGGCUGUUCUGAGAAUCUGAUGCCUCCCAUUGCACUGGUGAGCCUGGCACAGGCACAGGUCCCACCCCAGGCCCUUUGAACUGGCUGUUCCUUUGGCCUGGAACAUUCCUCCCCAGAUACCUCCUGAGAGGGCUCCCUCACUUCCUUCAAGGCACUGCUCAAAUGCUACCUCUUCACAGAGGCUUUCCCUGACCACCCCGUCUCUUUCCUCUUCCUGCAUAGCCUCUGUCACCUGACAUUUUAUGUCAUAAAUUACUCAUUUAUUAAUUUCCUGCUCUCCCACAGUGGCACCCGAGCUCUGUGAGGGCAAGACUUUGUUCGGUUGUGGGCUAUGCCCCCAACCCCUCGGACAGUGCCUGCACAGGUGGACAUUUUUGUUGGAUGAAGGAUUUUCUGUUAAAUGUGUCUGGCACACACAGAAAAACAAAGCCCAGCAGGUACGAUGGUGAUUAUUAUUGUUACUGGUGGCGCUCUAUUAUUGUUAUUAGUGUCUGUUGAAAAAGACCCUGAGCUAUACCAGCCCUUGGUUCUCCAGCCUGUGAAAUGGGCAUCCUGGGCACUGAGGCACUAGCCUUGGGAAGCUGAUAGGGGGUCCCUGCAGGAGAGACAAAGAACACUGCCCACCCCCCCGGGGGAGCCUGCGCCCCUCACCGGAAAGAGAAGCAGGGGGGAGCAGAGGGAGCUUGCAGCCCCACACGCAGGGCUGCCAGAAGGCCAUACAUAAUUCAUUGCCAAAUGGGGCUGCGGGCGGCUCUCCGCGGCGUGCGCUGGGGGCUCACUCUGCGCCUGGCACUUCGCUGACUGCGCCUCACACGUUGCCUCAUUGCAUCUUCAUGGAUUUGCAGGGUGUGACCCUUCCCCCUGUUUUACCCAGGGGGAUCCUGAGGCUCAGAGGAUGGGGCCACCGUGCUAGUCACACAGCCUCUCUGUGGCCAAGCUGGGCCUCGGGCCAGCAGAUUCGGCCCCCAGCGGCCCCCAUUCACUGCCUCUCUGCUGAGGGAAAAGACGGGCCUGGGGAGCGGGUGGGAGGCACAAAGGAGACCCCGCUCUGAGACAGGCUGCAGAAGAGGGAGCUGGGUCUCAGCAGGGCUGGGGAAGGCUCUGGCCCCAGCCCUCCGCCCAACCCCCUGCCCUCCUCUCCUGGAGGAGAUGCUCCCCAAAUUAGCCAUCAUGAGCGCUGGCUCUGGGGGUUGGGCGUUGGGGAGCAGUUUGCUCAGCUGUAAAAUGGGAAUAACAGAAGCCGUCCCUGGGACUAUGAGAUCAAGGUGCUCAAGAAAAGUGGUGUCUGCUGAGGGGAAAAGCCAGUCCCAAAAGGUUGCAUACUCUCAUUCUGUUUAUUUGUUUUUGUUUUUGAGACAGGGUCUCGCCCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCGCAAUAUGGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCCAUCUCAGACCCUCAAGGAGCUGGGGCUACAGGCACGUGCCACCGUGUCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGAGCUCAGGUGAUCCGCCUGCCUUGGCCUGCGAUAAAAUUGCACAGAAGUAAAUACACACACGUGAGGAUACGGAAAACCGGGGAAACCUGAGCAAGAGCAGUCAGACCCCGGCUGUGAUGGCGCCCAGUAGUUCUGCGAGAUGUUACCAUUGGGGAAACUGAGUGAAGGCGGGUACCUGGGAUCCCUCUGUUUUCUUUUUUGUUGUUGUUGUUAUUUUGAGAUGAAGUUUCCCUCUUGUUGCCCAGGCUGGGUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACACGCGUGAGCCACUGUGCCCAGCCUCUCUGUUUUAUUUCUUCUUUUUUUUUUUUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1730.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1791.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 707.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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