Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC01010:3
Sequence Length
1508 nt
GC Content
0.5033
UUUCAUACUGCUGUUGAUGAUGUGAAUUUUGGAAAUAUUCUCCCCUAUUGGGUCUUUCUCCAUGACAGAUGAUGUCCUUUGGCUUCGGUUUUUUGCCUAAGAACUGUAAGUGGUGCUUGCUAGCCCUACUAAGAAUCCUGCCAUUGUUGCAAAUUUCAGAAAAAAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCACACGCCUCACACUGUGACACAGCGGGAGAGCCCAGAGCGACAGCUGUUGGAAUGACUGCACUCUUCCUGCUCAAGUCUGACCUUUCCAAGCCUUUGUCCUAUGUCUGGAGACUUCUUGGAAGCUGGAGCACACAAAUAGCUACAGCAAACUUGAGGAAUGGGCAUGAAUAGACUGGCUUCGGGGAACCUGCCAGCUUGGCCGUGUGGCCAAGGUAAUAGGCAAGCCAAGGCAGAGCUAGAGCUCAGAGCUGGAGGGGAAAUUAAAGCAGCAAAUGUAGAAACAUUAAGCCUGAAGAGGCGACGACGUUGAAUUCUAAAAUGCAGGCCAAAGCUCAGACUGCAAGCUGUCUGGCUGCUCCGGGUGUGCCCAGAAGUCAAAGUCCAGCAGGGGCAAAGGUGGAGGUGUGGUCCUGCACGUGGGGUGUUGGGGGGAUGUGGAAGAGGAGGUGCUUUAAGAUCCAGAGAUUCCAGCUGCCCUGGUGCACCCUUGGAAGAAUAAAAGGCUAGGAACUGGACAAGUCAGGCUCGAGUCCAAGCUGCCUGAGGAAUCGGGGAAAGAAUGGAGCUCAGAGUGGGAGGUCAGGGCAGUAUUUAAAAAUCCAGGAUAGCAGCAAAGCUGGCGGUGGCCCCUGACUCUGGUAAGGGCAGCCUGCAGCACCAUGCCAAGGGGGGCCUGACUGAUCAUGCCCUGCAUUUGCAAACAAGGAUUAGUAGGGUAUGAGUAGGAUUCUGCUGGUGCCUGGGAAGGCAGUGCCAUCUACAACUUUACAAAGUUUUAACAAAGGCCUGAAGGACACAACCUUCCCCAAAGUCCUGACGUCGCUGUUUGCUGGCAACAAAUAGAGUCAAAAGAAGAGAGGCACAGAAUGUGCCAGGGGUGUGCUGCGUACAGCCCCGAUGACCACAAGGCCUUCUUGGGUCAAGUUCUGCCAUCUCUGGUUAAGAUGGGCUCACCCUCUAGGACCCUGAUUGAGUCCUCGGACCACCAAGAGUGCCCCACCAAGAGCCUCCCUCUUCUGGUGACUCGUGCCUGCUUCCCGUGGAGAGCUCCAGAAGGGAGGAAACUGUGAGGAGGUGGAGAACGUGGCAGGGAUCCUAACUUUCUUACUGAAGGAAGUUCUUCACAAGUACCCAUCUGCCUUCAGGGAAGAAAACAUAACUCAUUUUGGUCUUUCAAAUUCAGUUCUCAAAACCAAAUCCUGUUGUCAGCAAUCUGUGUCCCAACGCCUUCUUCAGCAACAGCAUUUUCCCUGUGGAAUUAGUUUCCAAUGUUCUUUCUUAAAUAAACCACUGAAGAUUAAAAGGAAUCCAGAUACCCACCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-522.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -548.9
Frequency: 0.0000
Diversity: 374.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........(((((((((((.((..(((((.....((((.((((.(((((...(((((((((((((.((((((((((((((((.(((.....))).)))...((((.((((((((.(((..((((((((((((((((((..(((((((....(((((........)))))(((((....)))))..(((((.(.((((...)))).).))).))(((((((....))).))))((..(((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((.((.((((((((((((.((.(.((((((((..((.((((((...(((...(((((...(((((((...(((((((((...((....)).)))))(((((((....)))))))...........((....)).((((....))))...((((...............)))).(((((....)))))..((((....)))).............))))..))))...)))...)))))..))).)))))).))..)))))))).)...)).)))))))....))))))))))))..(.(((.(((......))).))).)((((((((.((((.(..(((((.....((..((...))..)).....)))))..).)))).).)))))))..........))))))).))))..))....)))))))).(((((((..((.(((((....)))))...))..)))).))).))))))))))..)).)))))..))..............)))))))......(((((((((((..((.(((((.((((........)).)).))))))))))))))..)))).(((((((((((...(.(......).)...)))))))))))))))))))))..)))))...)))..))))))))))).))))..........(((((....)))))..(((((......))))).))))))....)))))))))))..((.((((.(.....((((((..(((((((.((((((...)))))).(((((((((...))))).))))..(((((.((((.....))))))))).(((((((..(((.(((((..((.(((((((...((.((....)))).))))))))).)))))...)))..)).......)))))....)))))))..))))))))))).))....))))))))).))))).)))).)))).(((.((((((((((.(.((.((..((((((.....(((((.....)))))..))))))..)).)).))))))).)))))))((((((...((..........)).)))))).................))))))).)))))))))))(((((.((.((.......(((((((..((((........))))((((.....)))).......................)))))))......)).)).))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
........,,,((((({((({{.({,.{((((,....,{{{,(((,.,{|||...,(({{{{{(((((.((((((((((((((({.(((,,,,.}}}.}}),..{(((.((((((({,(((..((((((((((((((((((,,{((((((....{{{{{........|||}}(((((,,,.}}}}}..({(({.{.((({...}))).|,})).)){{{,(((....))).||||({..(((((.((((((((((((.((((((((,,{(((,,(((((((((((.((.((((((((((((.((.{.((((((((..((.((((((...(((..,{((((...((((({(...((({(((((...((....)),}}}}}(((((((....))))))).,....||}..{|,...)).((((....))))...((((...............)))).(((((....)))))..((((....))))......}}}....)))}..))))...)))...)))))..))).)))))).))..)))))))).}...)).)))))))....))))))))))))))}}|||,||(,..,,,|||{|||.,((((((((.((((.{..(((((..,..{{..||...}}.,)).....)))))..}.)))).).))))))},..........,})))},)),,,})}},..)))))))).(((((((..((.(((((....)))))...))..)))).))).))))))))))..,).)))))..},.....}}},,.,,.))}}}},.,,)},{(({(((((((..{{.(((((.((((........)).)).)))))}))))))))..}))}.(((((((((((.,,(.{......),)...)))))))))))))))))))))..)))))...)))..))))))))))).)))},{{{....,}}||,,....,}}}}..(((((......))))).))))))....))))))))))),.((,(((({(.....((((((..(((((((.((((({...}))))).(((((((((...))))).))))..(((((.((((,...,))))))))).{{((((({,.{{.||||,.,{{.(((((({...{{.((,,,.|,,,.})}))))),,}},}},..,}}},}}.......,)))),,..)))))))..))))))|}}}}.}|,,,,|}}|||}}|,,}}||,,||||}}}..{(({((((((((((,{.,(.{{..,{{{,|,,..{{(((({{.,.,|||}}}}}))))},},.}}.)))}))),)))))))|||||,...,,.{{{{...(((((,...})}}}...}}}}.......}}}}},,.}))))))))))|,{{({{{,{,.,,,,..||{|||{,,||||,,......}}||(({(.....}))),..,,{,,,,.............,})))))......))}},,}}))}...,.....
Back