Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC01010:5
Sequence Length
1474 nt
GC Content
0.4993
AAAAAACUGAGAAUACUAUAGCUGAUUAACUUACUGUUUAGUUCUCUUAAAAAUAUCUACCUUCUUAUCAUUAUAAUUCUGGAAUGAAAAUCAGGAGGACUGCCUAGUACUGCCAAUUCUGACAGUGAUCUGGCUGGAGUGCAGUGGUGCACACGCCUCACACUGUGACACAGCGGGAGAGCCCAGAGCGACAGCUGUUGGAAUGACUGCACUCUUCCUGCUCAAGUCUGACCUUUCCAAGCCUUUGUCCUAUGUCUGGAGACUUCUUGGAAGCUGGAGCACACAAAUAGCUACAGCAAACUUGAGGAAUGGGCAUGAAUAGACUGGCUUCGGGGAACCUGCCAGCUUGGCCGUGUGGCCAAGGUAAUAGGCAAGCCAAGGCAGAGCUAGAGCUCAGAGCUGGAGGGGAAAUUAAAGCAGCAAAUGUAGAAACAUUAAGCCUGAAGAGGCGACGACGUUGAAUUCUAAAAUGCAGGCCAAAGCUCAGACUGCAAGCUGUCUGGCUGCUCCGGGUGUGCCCAGAAGUCAAAGUCCAGCAGGGGCAAAGGUGGAGGUGUGGUCCUGCACGUGGGGUGUUGGGGGGAUGUGGAAGAGGAGGUGCUUUAAGAUCCAGAGAUUCCAGCUGCCCUGGUGCACCCUUGGAAGAAUAAAAGGCUAGGAACUGGACAAGUCAGGCUCGAGUCCAAGCUGCCUGAGGAAUCGGGGAAAGAAUGGAGCUCAGAGUGGGAGGUCAGGGCAGUAUUUAAAAAUCCAGGAUAGCAGCAAAGCUGGCGGUGGCCCCUGACUCUGGUAAGGGCAGCCUGCAGCACCAUGCCAAGGGGGGCCUGACUGAUCAUGCCCUGCAUUUGCAAACAAGGAUUAGUAGGGUAUGAGUAGGAUUCUGCUGGUGCCUGGGAAGGCAGUGCCAUCUACAACUUUACAAAGUUUUAACAAAGGCCUGAAGGACACAACCUUCCCCAAAGUCCUGACGUCGCUGUUUGCUGGCAACAAAUAGAGUCAAAAGAAGAGAGGCACAGAAUGUGCCAGGGGUGUGCUGCGUACAGCCCCGAUGACCACAAGGCCUUCUUGGGUCAAGUUCUGCCAUCUCUGGUUAAGAUGGGCUCACCCUCUAGGACCCUGAUUGAGUCCUCGGACCACCAAGAGUGCCCCACCAAGAGCCUCCCUCUUCUGGUGACUCGUGCCUGCUUCCCGUGGAGAGCUCCAGAAGGGAGGAAACUGUGAGGAGGUGGAGAACGUGGCAGGGAUCCUAACUUUCUUACUGAAGGAAGUUCUUCACAAGUACCCAUCUGCCUUCAGGGAAGAAAACAUAACUCAUUUUGGUCUUUCAAAUUCAGUUCUCAAAACCAAAUCCUGUUGUCAGCAAUCUGUGUCCCAACGCCUUCUUCAGCAACAGCAUUUUCCCUGUGGAAUUAGUUUCCAAUGUUCUUUCUUAAAUAAACCACUGAAGAUUAAAAGGAAUCCAGAUACCCACCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-505.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -530.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 310.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((...((((.(((.....)))))))...))))))...............................((((((.......((((((..((((((.(((.((((..((((((...((..(((.((((...((((((((.((....))..).)))))))...)))).)))..))(((((((....))).))))((..(((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((.((.((((((((((((.((.(.((((((((..((.((((((...(((...(((((...(((((((...(((((((((...((....)).)))))(((((((....)))))))...........((....)).((((....))))...((((...............)))).(((((....)))))..((((....)))).............))))..))))...)))...)))))..))).)))))).))..)))))))).)...)).)))))))....))))))))))))..(.(((.(((......))).))).)((((((((.((((.(..(((((.....((..((...))..)).....)))))..).)))).).)))))))..........))))))).))))..))....)))))))).(((((((..((.(((((....)))))...))..)))).))).))))))))))..)).)))))..)).......)))))).))))....)))))))))(((((((..((.(((((.((((........)).)).))))))))))))))..(((((((......(((....)))......))))))).((((((.(((((....))))).))))))(((((((..(((((.((.....((((.............))))....)).)).)))..))))))).....)))))).(.(((.(.((((((((((((....((((((..(((((((.((((((...)))))).(((((((((...))))).))))..(((((.((((.....))))))))).(((((((..(((.(((((..((.(((((((...((.((....)))).))))))))).)))))...)))..)).......)))))....)))))))..))))))(((....((((((.(((((.((...(((.(((((....))(((((((((((((...(......)...)))..))))))))))((((((....))))))......))).))))))))))))))))....)))((((...(((((....)))))...))))...............)))))))))))).).))).)......((((((((((..((((........))))((((.....)))).......................))))))).....)))..))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((({{,,,({((.{{{.....}}})))).,,))}})),,.....{((((.((((((..(((({.,,....||.}))))...,.))))))((((((.(((.((((,.((((((...((..(((.((((..{((((((({,({....)),.|.}))))),...)))).)))..))((({(((....))).)))){{,.{((((.{{((((((((((.((((((((,,{(((,,(((((((((((.((.((((((((((((.((.{.((((((((..((.((((((...(((..,{((((...((((({(...((({(((((...((....)),}}}}}(((((((....))))))).,....||}..{|,...)).((((....))))...((((...............)))).(((((....)))))..((((....))))......}}}....)))}..))))...)))...)))))..))).)))))).))..)))))))).}...)).)))))))....))))))))))))))}}|||,||(,..,,,|||{|||.,((((((((.((((.{..(((((..,..{{..||...}}.,)).....)))))..}.)))).).))))))},..........,})))},)),,,})}},..)))))))).(((((((..((.(((((....)))))...))..)))).))).))))))))))..}),))))),,},.......)))))).}|}),,..)))))))))(((((((..{{.(((((.((((........)).)).)))))}})))))))...,{,.(((((((((((.,,(.{......).)...))))))))))).,,((({{{(((((.{({,{(((((((({(.(((...,{.(((((....))))).,,.....)))}}{{(((,,....}}}}}......,},,},..(.(((.{.((((((((((((....((((((..(((((((.((((({...}))))).(((((((((...))))).))))..(((((.((((,...,))))))))).{{((((({,.{{.||||,.,{{.(((((({...{{.((,,,.|,,,.})}))))),,}},}},..,}}},}}.......,)))),,..)))))))..))))))(((....((((((.(((((.((..,(((.((({{....||(((((((({{(((...(......}...)))..|||||||}}},{||||,,,,)))))),...,.))).))))))))))))))))....))},{{{...(((((,...}}}}}...}))}......,,,,,....)))))))))))).}.))).).....))))))}}}}))}.))))}...,,,,..{((((.....))))}..|,{{,{{...............))))).....,))))))}))))}........
Back