Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC01541:2
Sequence Length
3105 nt
GC Content
0.3643
ACAGAAAGAGCCAGGAUCCCAGACUGUGCUGAAGCUUCAUGAGACCUCUCCUCGUCUGUGCACGAAAGAGGAGCCGGACACAGAGUGUCCAGCCGACUCUGGAGCCCAGGCUGUUGCUUCCCGGUCUGGUGGUGAGUCCUCCAUUGUCUGAUGUGGGUAAGUCCAAGACCAAGGAGCCAGCAGAUUCAGAGUCCAGGGAGGGCUGUUCCUGAUUUGCAGAUGGCGCCUUCUCUUUAUGUCUUCACAAGAUUGUGAAGCCUGUAGCUUGGAAGAUACAGGACAUAGGUGAAAGUGUUUGUACCAUUCAUUUAAAGGCAUAAAUGUCCAAUGGGUCAUAAAGGUCAAAGCUAAUAGACAAAAAAAGCUUCCAGCAUGGAUGAUGAGCAAAUUAGAUGCCUCUCUGCUCAGCAUGAGGUUUUUUCAGCUGCAAAAGUAAAAUGAAUCAACCAUGGAAUUACCCCAAUGCACUAAUAGCUACCGCUGUAGUGGUAGAUCGUUAUAUAUCUGGGCAAUUAAAUUUUAAAUGCUAACUGUGAGACCAAGUCAGCAAAUUCUAAUUGAGACACGUUCUACAAAACACCUGACCACUACUCCUGAAACAGUCAAGGUCUUCAGAAAUAAAGAAGGUUUAAAAAAAUUAUUACAGUCAAGAUACACGGCAACUAAAUGUGAUGUGGUAUACCGUAUGGGAUACAGAAACUGAAAAAGGACAUUAGGGCCAUCUUGUGAUACAUGCACUGUCACAGGAAAAGUUUCCAGGAAAAGUCAAGCCAGGGCUUCACAGAAGAUCAAAAGAAAGAGACAAGGAGAAGCUAAGUGUAUUAGUCAGGAUUCUCUAAGGGACAGAACUAAUAGAAUAUAUAUACACACACAAACACACACACACACACAUAUAUAUACAUAUAAAUAAAAGGGAGUUUAUUAAGGAGUAUUAACUCACACAAUCACAAGGUCCCACAACAGGCCGGGCCAUCUGUAAGCUGAGGAACAAGGAAGCCAGUCUGAAUCCCAAAGAUGACAAACUUGGAGUUCAAUGUUCAAGGGCAGGAAGCAUCCAGCACAGGAGAUAGAUGUAGGCUGGGAGGCUAAGCCAGUCAAGACUUUUCACGUUUUUCUGCCUGUUUCAUAUCCUAGCUGCAAUGGCAGCUGAUUAGAUGGUGCCCACCCAGAUUAAGGGUGGGUCUGCCUUUCCCAGCACACUGACUCAAAUGUUUAUCUCCUUUGGCAACACCCUCACAGACACACUCAGGAUUAAUAUUUUGCUUCCUUCCAUCCAAUCAAGUUGACACUCAGUAUUAACCAUCACACUAAGCUUGUUAUUUUAUAGAAAUGCUUGAAAACCAGAGAUAAAUGCAGCUACAAAUGAACGAUGACUCUGCGUUUUCCUUGUAUAUAUAAAGAUCAACAAUAACACUUAGGUCAUGAAACCCACCUACUUUACAGAUCAUUAUGGAAAUAAUACACUGCUUCAGCAAUGGAGAAACAAUCAUCCAUAUUUAUGCAAGAACUAAAUUCAAGUUUGAAAGCUUGCUUUGAGCUUGAAGAUAUAAAACAUGAUUCUGUGACAGUAAACAAUGUAUAACAAAUCUUACAGAAAUUUAUGUGAUUACUAAAAAAAAAUCAAUUCAUCAAUUCAAUAAACUGAGUACCGUAUUACUUUUCUAUUGCUUCUUUACCAAAUAAAUACAAGCUUUGCAGUUUAAAACAACAGAAAUUUAAUUUUUUAUAGUUCUGAGGGUCAGUAACCUAAAACUGAUCUUAUGAAAUAAAGUUAAAUCUUGGGGAUAUGGGUGUGGACAGGGCUGGUUUCUUCUGGGGCUCUGAUGGUAAAAUUUGCUUCCUUGCCUUUUCUCCUUCUAGGGAGCCUGCAUUCCCUGCCUCCUAGUGGCUUCCUCCCAUCACUCGAACCUCUGUUUCCAGCCUCAGGAUUCCUAAUGUGACUCUGACGUUUCAUCUCCUGUUUAUGAGGACGCUUCUGAUUGCUAAGAUACAUACGGUGACACUAUGGAAGUUAACUUGAAGAUUAAAACCCUGAAAAAUAGAAAGAAUCUUCUAUGGUAUAUCACAGAGAUUACAAGGGCCUGAAUUAGAGUGGUGACAUUUUCAUCCCUUGAUAAUGGAUUAAAAACAAUUGAAUGAAGCUUUGGGGUGAACUUACAGGACUUUAUGGCAAACUUCAUAUGGGAGACUUACAUGAAGGGAGGAAGAAAUGCGUAUGUGUACAAAAUCAUGUGGAUAGAUGUGCAUUUGUGGGUAUCUGUGAAUACAAAUACACAAUUUUCAGACAGAAGUAGUAUAAGAAAAGGAAAUCAAACAAAGUCAAACAUUUUAAGUGUAGCUCUUGGUGCACUUUAAAAAAUUAUUAAAUUGAAGCUGUAGUUUAUUCUCAUCAUUGUCAUCCUAUAUUAGUGAUUUUCUUUAGCUUUUGAAAUUAAAUUCAUAAUAUUACAAUUCUGAAUUCCUAUGUAUGUAUAUGUUAAGAAUCCUUUAAUGGGACUGACUUUCAUAUGUGUGUGGCUGCAUUCUGAAAUAGUUGUCUAGUUGAUACAUAAAGCAGUGAGUGCUAUUUGUAAGAUAUAUUUAUAUUUAAAGUCUUCAUACAGUUAUUAACUAGCUCCAAUAUUACUGAAAUGAUUUCUCCAAAUAUCCUAUAUUUAAUUAUCAUGCUGGCAAAUUUAUUAUAACUUUGGUUUGAAAAAAUAUAUUAUGAUACAUAUCCACUGACUAAUGCCACCUAUCUGCUUUCCUGAAUUCAAAGUUUAUGAUUAUUUCCAUAAAUGUAUUUAUCAGUAUAAUCAAAAAUAAAAAUAACAUAAAUAAAAUUUCUGUGAGCUUUACACAUCUAAUGUGCAAUGAUUAUAAAUCUGGUCUUAUACACAUGGUAAAAAACAUUUAAGUCACAAAAGUAUACUUCAGGUUUAAGUAUAAAUCUGAAAUUAAAUUCUCAGAUUUAAGUAUAAUUUUUAAAAGCUUUGGUAAUUGUGUCCCUACUGUUAAAUUUAUUGUAUAGUUUUCACUAUAUCAUCUGACCUUUUAAUGUUUCUAGAAACUUGUGUGAGGUCUCAUACUUCAUGGCUAAUAAAGUAUUUAUUUUUCUAUUCUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-740.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -807.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 782.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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