Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02153:22
Sequence Length
1593 nt
GC Content
0.4156
ACUCCCAGAUGAGAACACAGGCAGGCUGACUCUUGAGUCCAGCCUUGUGGAACCCAGAGAAGAGGGCCCAGGUAAGCCAUGGCUAGACUCCUGACUGACAGAAAUUGUGACAUCACACAUGUGUUAUUUUAAGCUACUAAGUUGGUGGUAAUUUGUUGUGCAACAAUAGAAUACUCAUAUAGCUUAGCUGAAUCAUGAUUAACCACUGGAAGAAGAAGGAAGCCAAAGUAUCUGAUGCACUGGAGAAUGAAAACCCGUUCAAAAUCAGAAGUAUAGAGAAGUUUUCUGUAAAAUGGAAAUGAGUAUCAUGAAGUUUUAAAUGAACAGUGUAAAACAGAAGACAUCAGCAUUCAUUAGGUCCCAGACCUCUUUGAGAAUCUGAUGAAAUUCUGGACAACCUCUCCUCCCACAAACAAGAUGUACUAGAAUACCUACACAUAAAAUGUUGCAUUCAAUUUUGGAAUGUGAAGAGAUCAUUUGAAGCCGAUCCAGAGGCCUCUAAGGACUUGACUGGUGCAGUAUUGGUGGCUGCUGGGUCAGAUGAGCUCCCUGCUAUUCCAAGAAACAAUACAUGUUUGCAGCCACUAAGAUUUGAGGACUUUUGUUAUUACUGCCUAUCCUGACAGACUCAGGUGCUACAACUAUUUAAGGGCAUAAGUAUAAUAAAUUAAUAUCUAGUUUUAUGUUUUCAGAUGUCUUAAAACUAUUUAAGGGGAUCCACGCAAAAUGUUGUUCCCUUAAAAGAGGGCACAUCUCUCUCACGUGGAGAAAUACUGGUAAGAGGAAAAGACUUUCAAGUCAACCAACUUGAUGUGGUGUGCAGGUGCUGCAAUUUACUUCAGACAUUGCAUCUAUAAAAGAAAGAUAAGGUCUCGGCUGGCAAGAUGGCCUAAGAGGAACAGCUCCAGUCUGCAGCUCCCAGCAAGAUUGAUGCAGAAGUGACCGGAUCUCACUCUGGCACCUAGACUGGAGGGUACUGGCAUGAACUCCUGGGCUCAGAUGUCCUCCCACCUCCACCUUCUGAGUAGCCGGAAUUACAGGAAUGAACCAUCAUGCUCAGAUUUCAAGCUCCCUGAAGAUGAAGGCUGAAUCCUACACCUCGCUUGUAUCCUCCAUGGCUCAUUGAACAAGUGCUAGCUAGCUACAUGGAGACUGCUCAAUAAAUAUUGAAUAACUCACGAGGGACUCAAUAAAUAACGAUUGCUUAAUUGAUUAGCUCCGUCAAUAAAUCUUGCUUUGAACAGAGGUACAGCCAUUGAAGAUACUCAAAAGGCAAUCUCGGUCACUGUGCCUCUGGAUAGGGGAAAGCUCCAUGAAUGUAAGAUCUGGUGGGAGAAGGCAAGUUAUUUAACCUCUCUAAGCCCCGGGAGCUUCAUCUGUAAAAUGGGAAAAUACUGUAGUGCUUCCGUGUCAUUGUCACUGUGACAAUGUAAUGAGGAUGAUGCACAGAAGGCAUUUAUCACACUGCCUAGUCCAUUAUAAAUUCUUAAUAAACAUUAAUUGAUAUUAGCUACUCAUAGAUCUUAAGAACUGGAUUGAAAGAAACACCAUGAGAAAACUUUCAAUCUGUAGCAAUAUUACCCAAUAGCUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((.........(((((((((....))).))))))(((((......(((.(((((...((((((.....(((((....((((..((..(((....((((....))))..((.((((.((....(..((((((((((((((.((((((((...)))))))).))).))).))))))))..)......)).)))))))))..))....)))))))))...)))))).(((((((..(((((......))))).....((((((...........))))))((((((....((((...))))...))))))......)))))))...(((((..((((((.((((...(((((...)))))......))))))))))...))))).....))))).))))))))(((((((.((.........(((.((.((.....((((((..((.((((((((((((..(((.((((((((......(((((.((((.(((((.(((.....))).)....)))).)))).))))))))))))).)))..))).))))))))).........))..)))))).......)).)))))))))))))).....((((...(((..(((.((.((((((((....(((((.((((((((((..(((((......))).))..)))))))))).))))).((((((....))))))(((((((.(((.....(((((((((((......((((.(((((.((((.....))))....(((((..((((......(((((((((......))))((((((((((..(((((........)))))...)))))))))).......)))))......)))).)))))..)))))))))))).))))))))..((((((((........)).))))))........)))...)))))))....)))))))))).)))..)))....))))....((((((((((.(((((((((((((((....(((((((((((((.((......((((.(.(.((.((((..((((............))))..)))).)).).).))))...))..))).(((..((((((((((((((.....))))......)))..)))))))..)))(((((....)))))...))))).)))))...((((........))))....((((((.......))))))..(((((((......(((((((((((..(((((.(((..((....))..))))))))..)))))))))))....((((....))))......)))))))..))))))))..))))..............))).)).)))))))).)))))))).....((((......((((.((..((((((..((((((((...))))))))..))).)))..))..)))).(((((..........))))).((..((((........))))..))......(((((((.(((((..................((((((((((................)))))))))))))))))))))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,.{{{{{|||.....,{{{(((((((((....)))}})))))(((((......(((.(((((...((((({.,,..(((((....((((..((..(((....((((....}})},,,|,|{{{,,,..,{(,.{{((((((((((((.((((((((...)))))))).))).))).)))))))),}}....,,}}.,,,,,.)))..))....)))))))))..,)))))).(((((((..(((((......)))))....,((....((((((({...))))))))...|,,..{{{,...||||...,,}},..,,,,.)))))))...(((((..((((((.{((({..(((((...)))))...,}})}}}))))))...))))).....))))).)))))))),,,,.,({((..{{(.....||,.|,}}.....((((((..({.{((((((((({{..(((.((((((({.....,(((((.((((.((((,.(({.,.,.}},,)}}}.)))).)))).))))))))))))).)))..,)).))))))))).,,,.....)),,))))))...,,,.,,.||||||||,}}}}}.,,,.((((..,(((..(((.((.((((((((....,((((.((((((((((..,,{{{......,,,.}}..)))))))))).})))),((((({....})))))(((((((.(((.....{{(((((((((,.....{(((.(((((.,({((.((.((({....{{,,,..|||,......||}|{{{{|...,,.}}}}}}(((((.(((((({({(((.{......},))),)}))))))))}}}..............)))).))}))..)))))))))))).))))))})..((((((((........)),,)))))..,},,..}))...)))))))....)))))))))).)))..))).,..)))){{{,((((((((((.(((((((((((((((....(((((((((((((.((......((((.(.(.((.((((..((((............))))..)))).)).).}.))))...,}},))).(((..((((((((((((((.....))))..,}}.}}}..)))))))..)))(((((....)))))...))))).)))))...,,,,.......,}},|,,..{{{{{{.,,,...)))}}}..(((((((.{(...(((((((((((..(((({,(((.,(,....)}..))))))))..)))))))))))....((((....)))).,.}}.)))))))..))))))))..))))..........,...))).))))))))))).)))))}}}.....{(({......{{{{.(({{{(((((..((((((({...})))))))..))).)}|,|{|||}},,.{((({........,.))))).||,,|||{.......,}}||..........(((((((.(((((....,{.{{....}}.,,((((((((((................))))))))))))))))))))))}}},...,,,...
Back