Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02190:5

Sequence Length

568 nt

GC Content

0.4736

ACUUGGCUGAAGAUACUAAAGAGAACUAGAUGUUAUCUAGUGUUAUCCUGCUGAUCCCAAUUUCCUAUAGUUCUGGCACCAGAAAAUCCUGAAUGAUAGGUUUUUCUGAAGCUGCUGACAUCGGGUCAGCCCUCAACACCAUCACCUUUGGCCAUGUUCAGGAAGUACUCAAAGGUAACACUGGCAGCCAAGAGCAGGCCAAUCAAUGUCUGGCCACCACCCUAAUCCCACCUGGACAGUCACACCCCACCUCCCUAUGUGUGUUCGCACAGUGGGGGUGAUAUCAUGUGGGUCUGGCCUGUCCUGAGCAGAACCUGGUGUUGGGUUGUCAGAAACCCAGUGACCCAUCACGUUCACUCUUCAGAUCAUGGCUCAAAAGUCUGCAGAGCAGAGACAAGAGAUUGACAAAGAGGUGUUGAUGAGUGAGAUGUUACUGUUCUGCUCUGGAGAAGAUACUGUCAGAUAAUGUCCCGCAUUUCCAUCAGCUGGCAUGCAUGCCUUUGGACUCGGACAGGGUUCUUUGGAUUGUAGCUGAAUUUUCAAUGUUUAGUCAAUAUGGAUCUGAUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-181 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -188.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 167.49

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((..(((((((........))).))))..(((((((((.((((((((.(((.((.((....(((...(((..(((((((.((((.....)))).)))))))..)))))))).)).))))))))(((.(((((((.......)))...)))).)))..........)))))))))))))))))))).((((((((.........(((...))).......(((((.(((...(((((.((((((.......(((((....)))))))))))))))).))).)))))..))))))))...(((..((((.((((((((((((......))))))).....))))).)))).))).(((((((.((((.......(((.((((((((((.......(((((((......))))))).(((((....))))).)))))))))).))).......))))....(((.((.((..........)).)))))(((..((...((((((.....))))))...))..))).(((((((.......))))))).......)))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((..{((,(({......,,}}}.}})}..(((((((((.((((((((,((,.{{.{{....{({...(((..(((((((.((((.....)))).)))))))..)))|||||,.,.}}))))))(((.(((((((.......)))...)))).)))..........}))))))))))))))))))).{({(((((.........|||,,.,,,..,....(((((.(((...(((((.((((((.......(((((....)))))))))))))))).))).)))))..)))))))|{{.((({{((((.{((({(((((((......)))))))..|,,|||||.}}||,|||,(({{{((,,{{({,.....((({({{{|||||,.,..,,,{{{|{{,....,.))))))),{(({{....))))))))))))))}),)}}.......||||{{,,((({,..||}},....,,,||,|||,{(((..((...((((((.....))))))...))..))))|||||{{.......})}}})},,...,,}))))))...