Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02328:16

Sequence Length

739 nt

GC Content

0.4384

ACUUUAACAAAUCUUGCAGCCGCACACUCUUUGGGUCCGCCCGUUUCUCUAAUCAAGUUGUAACACUCGCUGCUGUGGUCCACAGCUUCAUUCCUUGAAGCCCGUGAGACACGAACGCUUCCAUUGAGAAAAACCUUCCAUCAGAAGAAGACUUCUCGUCUCAGUGGGACUGCUGAGUUGAAUGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGAUUAAAGAAUGAAGAAAGGAUCAAAUUGAGACAUCCAGGGGGGAAGAGUUCCCUGGCAAAACUCCAAUCUGCCUGAGCACUGAGGUGGAGCCACAGAAGUCCGGGUCAUUUGCACCUGGGAGGAGCCUGGCCCCUCCUCUUCCUGUGUGGAAUCUGGGAUUUAAUCUGUGAGGAGGGAAGGCCAAGGGCAGGAAGCACAGGCUCUCACUUCACUAAGAGUCUCUGUUUCCCCUUUUUUUCCUUUAUGCCUAAUUAAUAAAUCCCAUUUUUCUCACUCUUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-218 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -234.21

Frequency: 0.0000

Diversity: 194.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((....((((.(((.((......((((.(((((.((..(((((((......((((...((((((((....)))..(((.(((((((......(((((((((..(((.((..((.(((((((((((.............(((((....)))))..))))))))))).)).)).)))..)))).)))))......))))))).))).)))))))))..(((((((.((((((((((........))))........)))))).))))))).(((.((((......))))..))).................(((..(((((((.(((((..((((.......))))))))).)))))))..))).)))))))..)).).))))))))(((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))))).)))))))))..((((((.((((.......(((....((((((((......)))))))).....))).....(((....)))..((((.((.((((......((((((((....).))))))).......)))).)).)))).))))(((.((((..(((((((((....((.(((...(((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).))))))))))))....)))))...))).))...)))))))))..)))).)))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{((,...,((((.(((.((......((((((((((.((..(((((((..,{,,{{{.,,..,{|.,{{.,,,|||{{(((||((((((.....}|||||,{|||.|||,||...{{(((((((((((.....,,{,..,,{{{{|}}}.}}}}}.,))))))))))}.,},,|{|||{{||||{||,,,....,,||||||,..{{{({.,,{({.({(((((((.((((((((((........}}}},...,,.,)))))).)))))}}}))).}})})))}}}))),,.)))}))}}}}..,......,|||..{{{{(({,(((({..((((.......))))})))).}))))))..)))})))))))..)).),}))))))}{((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))))).)))))}}}}..((((((.{({,,,,...|||{...,((((((((......}))))))).....}}},,.|{((({{..,....,|||}||}||||..,...,(((((({....}.))))))|{{{.{,.,,)).))})))),}})){{{.((((..(((((((((....{{.(((((((((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).)))))))))))}}))))))),...))).}}...)))))))))..)))).)))))))))..