Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02328:36

Sequence Length

1348 nt

GC Content

0.3487

AGCAACCCUUCUGGGUCCCCUUCCACCACGCAGAAGCUUUACUUUCGCUUUCACUUUACUUUUGCUUUCACUUUAACAAAUCUUGCAGCCGCACACUCUUUGGGUCCGCCCGUUUCUCUAAUCAAGUUGUAACACUCGCUGCUGUGGUCCACAGCUUCAUUCCUUGAAGCCCGUGAGACACGAACGCUUCCAUUGAGAAAAACCUUCCAUCAGAAGAAGACUUCUCGUCUCAGUGGGACUGCUGAGUUGAAUGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGCAUGUUUCUGAUCAGCAUGAAAACUGCGCAGGAGCUUUUCUGUCUUGCAGAGCUAGUUAAUGAGAUUGUUGCUGCCUUCAGAUUCUAUAAAGGACUUCUCCAAUAUUGGGUGAGAUUAAAGUCAAAAUCAAGAGAAUUUAUAUUUCAGUUGAAUCUAUGUAAGUCUGUUAAAAAAGUAAUGGGCUCAGGGUCAAACAUCAGUAAUUGACCCUCACUCUACAGAUUAUUAAUUGUAUGACUGUAUUUCUCAGUAUCCUCAUCUAUAAAACCAGGUUAGCAAAAACUGCCUUCCUACUUCAAAAGGCACAAAUAAAAACUAAACUAAAAGCCAUACAAAACAAAGUGGAUAGCUCAUUUGCUUUACUUGGAAUGACAAUUCAACAUAGUAUUUUAAAUUCCUGUCUUUUAAAACAGUGAUUUCACACAUAUUGGCUCAUUAAAUUCUUCGUAUUAUCAAGAGUUGCUUAAUACAUUUGAGAACACAAAACAAUGGCCUUUUCUGUGCCUUUUUUAGGUGGUAAUUAUUCUUUAGUAAAGUCGGGUUGUUUUAAUUGAAAAUGAAUUUAGGUUUUUAAUCAGGAUUAGCACAAGUCGAUGUGUUCUCAGUUGUUGAAAGUUAAACUAGUAUUGCUAUAUUUCAAUGAUUGCUAGAAUAAAGAAAUAAAAAAAAAAUAGACAUGUUGAGUAAAGCUUUAUGAGUUAUAUAAAUGCAUAAUUAUAUUUGCAUAGGUAAACAAUACAUUUUUUUUCUAUUUUUGCUAAGUAAUAAGUUAGUUAAUAUAUUAUGUAAGAAUGAAAAUGAUUCAAAUAUUUGCCUGUUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-316.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -343.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 349.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((....))))...........((.((((((((((((((..((((..(((((...((((((((..(..(..((..((((((((..((((.......(((....))).........(((((((.((.......)).))).))))(((.(((((((......(((((((((..(((.((..((.(((((((((((.............(((((....)))))..))))))))))).)).)).)))..)))).)))))......))))))).)))..))))..))))))))....))..)..)..))))))))....))))).))))..((((.(((((((..(((((..(((((..((.((((((((...((((((...(((((...))))))))))).((((.......))))((((((((......(((((.((((((..((((...(((....((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).)))))))))))))((((((((((....))))))...)))).(((((((((((((.......(((....))).((((....)))).....(((((((.(.(((((((((..((.((((...((.(((((((((((...(((((((...(((.(((((((((......))))))))).((((((((((....))..)))))))).....(((((.((((.......))))))))).........................((((((.((((((....((..(((.((((.....(((......................)))..........)))))))..))...))))))..))))))....))))))))))..))))...)))))))))...))))...))..))))))))).)))))))))))))))(((((((.(......))))))))((((...(((.((((((((((......((.((((................)))).)).((((.....))))...(((((.((((.((((((.....((((........)))).....)))))).)))).))))))))))))))).)))...))))...)))))).............))))).))).))..))))))))))..)))))...)).))))..)))))))))))).)).)).((((((........)))))).)))(((((((((........((.(((((.((((((((...((((((.(((....))).))))))))))))))))))).))........)))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.({{((((....))))...........,,.({((((((((((((..{{{{..(((((...((((((((,.(,,{..,,..((((((((..((((......,(((....)))|,,...,......||,.,...,,{.{{{....)))},(((.(((((((......(((((((((..(((.{{..,(,(((((((((((.....,,,,....{{{{|}}}.}}},}..))))))))))).,),)).)))..)))).)))))......))))))).)))..))))..))))))))....||,,}.,}..}}}))))}....))))}.}}}}.,((({,(({((((,,,,{{{,.{{{((,.((.(((({{{{.,.,,,{{{..,(((((...)))))}}}},,.((((.......}}}}{(((((((......(((((.((((((..((((...(((,...{(((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).))))))))))))}{{{{((((((....})))))...||||.{({(({{{{{{((...,,.,||||....||,,{{{...,})}|,.,,,((((((,,{.(((((((((..{{.,{{{...({.(((((((.,,|.,.{{{((({...|||.{((((((({......))))))))).(((((((({(....)}..)))))))).....(((((.{,,,...,}}})|}||||,,.....}}}}................((((((.(((({{...,((,,({{.{{{,...,,|||,.....................}}}.,........}}))))}..)}...})))))..))))))....,,,)))))))..,},},..})))))))},..}}}}...))..))))))))).})))))))}}}}}},(((((((.(......})))))))((((...(((.((((((((((,.....,.{(((......}.|||,.....}}}}|},..,,,.....,,,},,.{((((.((((.(((((({{,,,({{,.....}}})))}.,...}))))).)))).))))))))))))))).)))...))))...}}}}}}.,,},.,..,...))))),})).))..))))),}}}}....,))}}.}}.})))..)))))))))))}.}).}},{{...,,,,,|...,,,,,,.))){((((((((........{,.(((((.((((((((...((((((.(({....))).))))))))))))))))))).}}........)))))))))....