Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02328:43
Sequence Length
738 nt
GC Content
0.4390
ACUUUAACAAAUCUUGCAGCCGCACACUCUUUGGGUCCGCCCGUUUCUCUAAUCAAGUUGUAACACUCGCUGCUGUGGUCCACAGCUUCAUUCCUUGAAGCCCGUGAGACACGAACGCUUCCAUUGAGAAAAACCUUCCAUCAGAAGAAGACUUCUCGUCUCAGUGGGACUGCUGAGUUGAAUGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGAUUAAAGAAUGAAGAAAGGAUCAAAUUGAGACAUCCAGGGGGGAAGAGUUCCCUGGCAAAACUCCAAUCUGCCUGAGCACUGAGGUGGAGCCACAGAAGUCCGGGUCAUUUGCACCUGGGAGGAGCCUGGCCCCUCCUCUUCCUGUGUGGAAUCUGGGAUUUAAUCUGUGAGGAGGGAAGGCCAAGGGCAGGAAGCACAGGCUCUCACUUCACUAAGAGUCUCUGUUUCCCCUUUUUUUCCUUUAUGCCUAAUUAAUAAAUCCCAUUUUUCUCACUCUUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....((((.(((.((......((((.(((((.((..(((((((......((((...((((((((....)))..(((.(((((((......(((((((((..(((.((..((.(((((((((((.............(((((....)))))..))))))))))).)).)).)))..)))).)))))......))))))).))).)))))))))..(((((((.((((((((((........))))........)))))).))))))).(((.((((......))))..))).................(((..(((((((.(((((..((((.......))))))))).)))))))..))).)))))))..)).).))))))))(((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))))).)))))))))..((((((.((((.......(((....((((((((......)))))))).....))).....(((....)))..((((.((.((((......((((((((....).))))))).......)))).)).)))).))))(((.((((..(((((((((....((.(((...(((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).))))))))))))....)))))...))).))...)))))))))..)))).))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{((,...,((((.(((.((......((((((((((.((..(((((((..,{,,{{{.,,..,{|.,{{.,,,|||{{(((||((((((.....}|||||,{|||.|||,||...{{(((((((((((.....,,{,..,,{{{{|}}}.}}}}}.,))))))))))}.,},,|{|||{{||||{||,,,....,,||||||,..{{{({.,,{({.({(((((((.((((((((((........}}}},...,,.,)))))).)))))}}}))).}})})))}}}))),,.)))}))}}}}..,......,|||..{{{{(({,(((({..((((.......))))})))).}))))))..)))})))))))..)).),}))))))}{((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))))).)))))}}}}..((((((.{({,,,,...|||{...,((((((((......}))))))).....}}},,.|{((({{..,....,|||}||}||||..,...,(((((({....}.))))))|{{{.{,.,,)).))})))),}})){{{.((((..(((((((((....{{.(((((((((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).)))))))))))}}))))))),...))).}}...)))))))))..)))).))))))))).
Back