Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02328:51
Sequence Length
686 nt
GC Content
0.4198
CUUUGGGUCCGCCCGUUUCUCUAAUCAAGUUGUAACACUCGCUGCUGUGGUCCACAGCUUCAUUCCUUGAAGCCCGUGAGACACGAACGCUUCCAUUGAGAAAAACCUUCCAUCAGAAGAAGACUUCUCGUCUCAGUGGGACUGCUGAGUUGAAUGAGACGAGGUUUCACCAUGUUACCCAAGCUGAUCUCGAACUCCUGGGUUCAUGCGAUCCACCUGACUCAGCCUCACAAAGUGGUAGGACUACAGAAAAUGAACAGGACUAUUCUUCCUCAAACAAAGAGAUCGUGUGAUGAAGACUCACCAGAGCUGUUCUCUAUAAGCUUGAAGAGCAAUGGUAUCAGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGGUAAUUAGAAUUUGUAAUUUGGUCUUAAUUAAACUGCAGACUACCCAAAGGCCUUGAUCAGUGGCCUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-184.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.5
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.(((((((((.((((..(((((((.............(((((((((((.((((((.....)))))).((((...)))).....(((((((((((.............(((((....)))))..)))))))))))..((((((((..........((((....(((((..(((((.(..(........)..)))))).)))).)....))))))))))))..(((...))))).))))))))).....((((((......(((((.(((.((.........)).))).)))))(((....)))))))))......))))))))))).)))))(((((((.(((((.......))))))))))))....(((.(((((((((.((((((((((........))))........)))))).)))))..)))).))).(((((((((((((((((...............(((((...)))))(((((..((((.......)))))))))..(((((((.....)))))))...............(((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..))))))))))))).)))))...(((..((((((.((((((....)))))).))))))))).))))))))........)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,(((,{{{{(((((.((((..((((((({{{..........(((((((((,,.((((((.....)))))).((((.,.}}}}.....(((((((((((.....,{{{....||,,|}}}.,}}},.,))))))))))}..((((((((,..,{{{,{,{(({,,|,,((((..{((({.{..{,...,,..},..))))).))}).},...},,})))))))).,{{{...))))}.))))))))).....((((((..,,..(((((.(((.((.........)).))).))))),{{...,)}}))))))..}}},))))))))))).)))))(((((((.(((((.......))))))))))))....{({.({(((((((.((((((((((........}}}},...,,.,)))))).)))))},}})).}}}.{{{({{(({((((((((,.,,,......,..,((((({{{||||,(((({..((((.......))))})))).}||||||,,.}}})))}}},.,.{{|...,,,,..,((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..))))))))))))},}))})...,{{..{(((((.((((((....)))))).)))))),,},))))||||,.......}})))))...
Back