Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02328:61
Sequence Length
741 nt
GC Content
0.4116
CUGUCACUCUUUAAGCAAAAUAAACAGAUUUUUGAGCAUCAUCUCUUUUUUGGAUCAUCAUUUUGCAAGUGGAGAUUGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGCAUGUUUCUGAUCAGCAUGAAAACUGCGCAGGAGCUUUUCUGUCUUGCAGAGCUAGUUAAUGAGAUUGUUGCUGCCUUCAGAUUCUAUAAAGGACUUCUCCAAUAUUGGAUUAAAGAAUGAAGAAAGGAUCAAAUUGAGACAUCCAGGGGGGAAGAGUUCCCUGGCAAAACUCCAAUCUGCCUGAGCACUGAGGUGGAGCCACAGAAGUCCGGGUCAUUUGCACCUGGGAGGAGCCUGGCCCCUCCUCUUCCUGUGUGGAAUCUGGGAUUUAAUCUGUGAGGAGGGAAGGCCAAGGGCAGGAAGCACAGGCUCUCACUUCACUAAGAGUCUCUGUUUCCCCUUUUUUUCCUUUAUGCCUAAUUAAUAAAUCCCAUUUUUCUCACUCUUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-220.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((..((((........((((.....((((((.((((((..((((.(.........).)))).)))))).)))))).....))))..)))).)).)))).......(((((((.((((((((((........))))........)))))).))))))).(((.((((......))))..)))......................(((((((((((((..((((.......))))((((((((......(((((.((((((..((((...(((....((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).)))))))))))))(((((((((((....((((....(((((((.((((.....))))))).))))...)))).........(((((((((((....))).........(((........)))....(((....((((((((......)))))))).....)))...(((((((........))))))).....))))))))(((((....).))))((((((.((...)).)))))).)))))))))))....(((((((((....((.(((...(((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).))))))))))))....)))))...))).))...))))))))).)))))))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,.,,,{,,..,{((,.......((((.....((((((.((((((..((((.(.........).)))).)))))).)))))).....))))..||}}.||.||||,{{,,{,{{(((((,{((({{((((...,{,,.}}}}|,,,{{.,}}}}}}.))))))}}})),,}}}}},...))))}}}},......................(((((((((((((..((({.......}}}}((((((((......(((((.((((((..((((...(((,...{(((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).))))))))))))}{((({(((((({,,{(((|{,,,(||{{{,.{{((,,,..||||}||.||}}.{{({(((((,{((..(((,,,,|||,.,,,,)))}}...},,,},}}..,,},||..,}}}},...,||||||{|,,,,,,)))))))),,...|||{,.{{{(({{.......,)}}))))|,{{,,||,,|(((((({....}.))))))(((({(....,,.,)))))),})))}))))),,..{((((((((....{{.(((((((((((..(((((..(((((((.(((((((..........))))))).)))))))))))}}))))))),...))).,}...))))))))).)))))))).)))))...
Back