Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02328:62
Sequence Length
599 nt
GC Content
0.4207
GAAAAAUCAAUUAAAAUGGGAAAUGGGAUGAGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGACUUGCAUCAUUUAUAUUUUUAAUUCAUCGAGGAUGAGAAAAUUGAUUAACACAAAAUCUUUUCAUGUCUUUUCUGAUGAGAGACUAGCUGAAUCCAAGAAGAGAAGCCCUUGAAGAGUGUAUUCUAUUCUAGACAAGCAUUCACACAUUGGCUUCUUUGGUGCCAGCAUGUUUCUGAUCAGCAUGAAAACUGCGCAGGAGCUUUUCUGUCUUGCAGAGCUAGUUAAUGAGAUUGUUGCUGCCUUCAGAUUCUAUAAAGGACUUCUCCAAUAUUGGAUUAAAGAAUGAAGAAAGGAUCAAAUUGAGACAUCCAGGGGGGAAGAGUUCCCUGGCAAAACUCCAAUCUGCCUGAGCACUGAGGUGGAGCCACAGAAGUCCGGGUCAUUUGCACCUGGGAGGAGCCUGGCCCCUCCUCUUCCUGUGUGGAAUCUGGGAUUUAAUCUGUGAGGAGGGAAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-172.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -184
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((((..((((((....(((((((((.......)))))...(((((.((((....(((((((.((((((((((........))))........)))))).)))))))))))...))))).....))))...)))))).))))))....(((((...)))))...))))))))...........((((((((......(((((.((((((..((((...(((....((((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).))))))))))))).......(((((((((((.(((((..((.....(((((..((((.((.((.(.(((.(((((.(((..(((....)))..))).)))))...))).).)).)).))))..)))))....))))))).))))))))))).((((....((((..(((((((........)))))))..(((((((((((.((...(((((((..((((((((........))))))))...)))))))..)).)))))...)))))).)))).....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,,,,,......{({(,{{{{{({{{,,{(((((,,.,,,,|}}||,{{,{(((,..,||}|,{|||||{.{{({{{{{||..,,},..))}},...,,..)))))).)))))}},,||{,|||,||{{{{{|,,{{,.|||,||..|||||{..{(((((...)))))},,}}}}||||.......,,,,{(((((((,.....(((((.((((((..((((...(((,...{(((((((..((..((((((..((((...))))...))))))...))..)))))))))))...))))..)))))).))))))))))))},{{{,((((({({{{{{|,|{{{||||{{,.,|{{{{{..||||,||,||,},{((,(((((,{((..(({....|||..,,,,)))}}...}}},)})}.,}|}}}}..},)))..,,)))))))}}))),)))))))||||....((((..(((((((........)))))))..(((((((((((,((,..{((((((..{(((((((........))))))}}}}.))))))),,)).)))))...)))))).)))),.,,,)))}..
Back