Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02328:63
Sequence Length
522 nt
GC Content
0.3678
CUAUUCAUCUAAUUCUUCUUCCUUGAGAAAGAACUGUAUUUGACCCAGCAUUUUGAAAAGUUGUACCAAUAUUUGUAUACAGCUUUCAUAUUUUUUUUUUCUCUAAUAGGUGCUUUUUUUUCUGAAGCUUUGGUAGUGUAACUGUAAGAGUCCUGGAAUUGGAAAAGCAAAUCCAGAAGUUGAGUUCCAUGACUUUUUUGCUGUUUGCCUUUGGAAUUUUUACUGAACACUACAAUGACUGCAUAAAAAGAAAAAUUGAUAGCAGAGUUGGAAACUAGCAAAAGAUGACAUCUCUAAGCCUGAAAGCCAGAAGGAAUGUUGGGAAUAUAUUGUUUAGAGGAUAACUUUGCAGAAAGGUCAGCAAACAUGCAAGCUACAACAUGAGAAGAAAUCUGUUCCAGAGCUCAGAGUGGGUGGGAAGGACAAAGUGGGAGCUGCCAGGGCAGAAGGGAAGGCUGGUGAAUAGUCUAUAAUGGAGAUUCUGGCUACAAUUAAAUCACUUGAAGACAUUUUUAUUAACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-117.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -129.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 107.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((...........(((.((((((((((((.........))).....(((((.((((((.(((...)))..)))))))))))......)))))))))....))).((((((((((((...(((((((((((...(((......((((((((.(((......))).))))...((((((((...((((((((((((.(((..((((((((.......((.((((...((((..((((.((..((......))..)))))).)))).......((...((((...))))....))(((.....)))......)))).)).........))))))))..)))...))))))))))))(((....))).)))).))))...(((.....))).((((...(((((...))))).))))))))..)))....))))))))))))))))))))))).)))))))))....(((((((((((((.....................))).))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((........{{.,,,.(((((((({{{(.........}}}.....(({(((((((((.({{...,))..)))))))))))......}))))))))....))}.((((((((((((...(((((((((((...(((......{({(((((.(((......))).))))}..((((((({...((((((((((((.(((..((((((((.....,.((.{{({...((((..((((.,,..,{......))..},)))).)))).....,.||...{{{|...}}}}||..,{(({....,|,,..}}..}))).)).........))))))))..)))...))))))))))))(({....))).}))).)}})...{,,.....|||.{(((,..{(({{...))))),))}}))))..)))....))))))))))))))))))))))).)))))))))....(((((((((((((...................,.))).))))))))))....
Back