Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02350:10
Sequence Length
2885 nt
GC Content
0.4232
GGACACAGGAGCAGCGGGGAUGCCGGGUGCGCUCCGAGGGUGUGGCCCCCGGGCUGUGCGGGGCUCAGAGCUGCUUGCUGGGCGCGGUGCCCGACAAAGCUCCAUUUCUGGCCUUUGGUCUCUUUCUCGGAAAGCAGGCCUCAGUGGCCUCAGUUUCUUCCCAGAACCUGCAAUGCCCCACCAAGGUGACAAGAAGUGCAAGGAGUCGGUUUUCACUGCCAACCAAAGAGGUGACCCCCGCAAAGCAACCAUGUUGGGACAGUCCAUUUGCUGCGUUUUGAUUAUUUGCUAAGAGCAAAUACCUUUUCUGUUUGGGUUUUGCUUUUAGAAAAAAAAUGUGGCAGAUGGUGGUGGCUUUCCCCGUCAUUGAAAGAAGAAAGGUAGUAACUCUACUGGUGCACUCCUCUGAGUUGUGCUAACAAAGAAGAAUGCUGAAAGAAAAGGGAAAUGAACACCAUUUUCAGGCAGCUUCUCCAAGUUUUUUUGACAGUGUUAUAAUUUUCCUUUAGCGACUGUUGAAGCAAAUAUCUGUAUUUAUGUUCAGAUUAAACCGAGAGAGCAAAGACUGCUAAAGCCAGUAAUUUCUGGGCUGCAAAUGCAGGAUAGCUCCAGUGAAUUUCAGAUUCUUAAAGGUUUUUGCUGUAGCGAAUUCAUGACACAAAGCAUUUGGAGGGAAACCUAUUAGAGAAGAAACACAUCCUAAAUGAGAAUUACUGAGGACGGGAGGCUCUUGUCAUUUAUUGGAUUAGUUAUAGCACUUUACACAAGCCUGUAAUAUUUGUUCUGCUGCUGUGGUGUGACUGGUAAAAUGAAAAGGUAUGUCAAGGGAGUGCUUGACUGACGUUCUUAUUUCUUCCGUCUUCUUAUAUUGCUGGGAGGAUUCUACCACUGCAGGGCUAGAAAUUAAUAUCACACUCAUUUGAUAGGAAGAGCAAAAGCAAGGUUAUGAGUCAGAGACAUUUUGGUCCCAGAACAAUAACUCUAUUGAUUGAGUCAAAUAUGUUUAACUCCAACAGCAAGACCUUCCAUCUGCGUGAAAUAAUCAUGUCCGUUAAUUGUAAACAGGAGCAUCUUUGAAAGCUGAGCUAGAGGCGGAGCAACUGGUAAACCAGAUGUCCCAAAUUUCUAGGUUUGUACAUUGUAAUUGUUCUAGACUUGUGUGUGGAUAUUGGUAAAAUGACAUAGUCAGAUAUCUCACAGAUUUUGUGAGAUAUGUCCAAAGUUCCCAAGUUAAUUUAUUACUAAAGUUAGAAUUUCACUUACUGUGAGAUUGGAAUGCCAGCCAGCUACUGAACCUUAUGUGUGCCUAGGGGCCAUUUUGAGACAAUUUGCUGAAUAUUAAAAGUACAACCAAUAAUGUUUCUCUCCACAUCCACAAUAGCGCUUAGAGGAAGCAUCUGGGAUUGAGCCAUCUCACAUCUGUCUAAUCACAUUCAUUCAAAUGUGAUGGGCCCAACUGGCCUACGUACAUGGCUGCAUAUCACCAUGGGUGGAAAUUAAAUCAGAAUUUGGCUCAGGAGAGAGAUGAAGAGAAAAUGCACGUAGAUAAUUGGCUCAGAUAACAUUCUGUUUCUGGAAGUCACAAAGAGUGGAAAUUGGAAUAUGUAAAUUAAAGAAAAACAGGUAAGAAUUCACAUGAACCCCAACCACACACCCUGUGUAUGUUCUCAUUCUCAUUCUCUCUAUGGUGCCUGUGAGCAGUUGGAGUUUGAAUUUUUCAGUCAGUAAGGUUUGCUGUUUAUUCGAGGGCUGCUCCUAAAAAAUAAUCAGGUCUAGUCAAGAAUAUAGAAAAGUGAAAUUAUGCAUAUUUUCCUGGGGAAUAUAAUAGAUGUUCUCAUAGUCUUACAAUGUAAAAAAAAUGAAGGUAAGACUCUAGCUCCCUUUCUUCUAUCUUUCUGGCCUCAUUUUAGGCUAAUAUUUUCUUUUGCAACCAUAUACCAAAUUAUUACAUAUGGAAGCUGUGAAACUGAAGGUUCUGUAAAACUUUAAAGCCAGAGAACUUAUGACUCCUCCAUAUAGGAAGAGAAAUGGGAGAAUAUUAGGCUGUUUUUAAUACUGGGCAUCUGGUAUUUUUCAGUCCUUAAGAUCAAGUCCGCAAUGGAAGAAGAGCAUUCAUCUGGUACAGGUUGAUGAUUGUGUAAGCCCAAGGAGUGAUGUCAACACUGGGGUUCACCUGAGAACAUGGACAUGGUUGAUGAGGGUUUAGGAGAUGCUCAUACGAAGUCUUCAUAUGUUCCCUGGAUCCCAGCUCUGCCUUCCCACCAGAGAGGAUGUAAUUCAGCCGAGAUGCCCAGAGUCAGCUCUCUGCUCAUAUCUGUUCCGCACUGAAGCCAAUCAUCUGAGAAACCUAAGAAGUGUUUAAUGUAGUUAGGAAAGUGAGGGAUGAAGACCAUAAAUUCCUUUUCAUGUAGCAGAGUAUAUAUGUGAUACUCAUUCUGUGGUAUUUGGGGCAUAAACAAGAGUCGAUGAAGGAAUGUGAAAGUACUCGAAAUCCUGACUUUUAUCUCUAUAAAAAUGGCAUAGGGAUGAAACACACUUGGUUGUUAUGACUGUACUCUUUUCAGAUUUACUACUUGCCUUUCUACUGAUUUUUCUGUGCCACAGGUCUUGACUCCUGUAGGCUAAAUUUCUCAGCCUCUUCUGCUCACUGAUAUAUGGGAAGGUUUGGCCAAAGGUGGGUGACUGGUGGGGAGAAGGAUGAGGGAAUUCAGGGGAUUGCUGAGCCCAUUCUCUAGACAGUGCUGCUGGCACUGGCUCUGUCUUCUCCGUUUCCAUCUCGCAUCAGACGGUUCUUCCCUCUAUGGGCCUAGUCCUACCUAGACACUUUCCAGUUGGAUUCCAGUUCUGGGGAUGCUCCCUCCUGCAGGGAUCUAAGUCCUUCCCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-837 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -889.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 889.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((((.((((((..((((((((((((((.(((.(((...))).))).).))))))...(((((..(((.(((((.....))))).)))))))).......((((...((((((((((...))))).))))).....))))(((((((((((...((..((...(((((((((((.(((((.......(((..((.((((((.......))).(((.....))))))))..)))..(((.((((((((((((((.((((((((((((((((.....(((.(((((((((((..((..........))..))))))))))).))))))))))))))))))).((((((((((((..................(((((.....)))))(((((..((((((((((...((((.....(.((((.((((...(((((((..........)).)))))...)))))))).)..((((((((((((((((((...........)))).)))))))))).))))(((((.((....)).)))))......(((((((((((((.((((....((((......)))).((((....))))........((((((.(((((..(((((..((((((((.((.((((................))...)).))))))))))....)))))...............))))).)))))).(((.((((((.((((((......(((((...((((.((((..(((((......)))))...((((((((..((((.(((((((((.(((((((((.((.((..((((((......))))))..)).)).)))))(((((((((((((((......)))))))))((((((.......)).))))......(((((........)))))))))))((....))....)))).))))....))))).))))..))))))))..((((........))))......)))))))))))))..)))))))))))).)))((((((.....))))))(((((.......))).))))))))))))...((.((.(((((((.((.(((.((((....)))).))).))...))))))).)).))(((.......)))((((.((....)).))))(((((((....((((...)))).((((((((((.....))))))))))(((((((((((((.(((((((((.......)))))))((((((((.....))))))))((........)).(((((..........))).)))).))))..)))))).)))....((((..........))))..)))))))....)))))))...........)))))))))))))).))))).))))..))))))))......)))))).((((((((......))))))))(((((.....))))).)).)))))).)))...))))).)))............(((((..((((((((((((((((..((((((((.(((((((........(((((((((.((((...))))))))..)))))......((((...((((..(((((.((((.................)))).)))))....))))))))......))))))).))))).)))...)))))))...((.((.(((((((((..((((((.((..........((((((...))))))..(((((...(((((..(((...........)))..)))))..)))))..((((((((........))).)))))...((((((((.....))))))))..((((((((..................)))))))).(((((....(((((((((.((((((((((......))))).....((((....((..((((((.............))))))..))...))))....(((((((..................))))))).....((((......))))))))).))))))))).....))))).........(((((((((((((........(((((..(.((((..(((.....((.......(((.(((((...........))))).))).....))...))).)))).).....((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((((...)))).))))))).).))))....))))))).))))))))))(((((.........))))))))))........))).))))))))))..)))))))))))))))))...)).))...))).))))))...)))))...(((..((((.((((..(((.....(((((..((.((........)).))..)))))...)))..))))((((((.......)))))).))))..)))...)))))))).....))..))...)))))))).)))..)))))))..))))....((((((....))))))..((((((((((............(((.((..((((((.........)))..)))..))..)))............))))))))))(((((........)))))(((((.........))))))).)))))).))).....(((((((((((((....((((((((...(((.((((((((.((((.((((.....(((((..((.(((((............((((((...))))))))))).))..))))).......)))).))))......)))))))).)))...)))))..)))..)))))).))))))).(((((((((.((...(((((...)))))...)).))))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{.(((((((((,((((..,|{{{{{{((({({,.||||}}}})})}}|{({,,(((((({,.,.(((((..(((.(((((,...,))))).))})))))...,,,,((((,,.||||,{{(((,.,|||||,|||||.....))))}.,|}|{,{|||.}|}}||||||..}|||(((,,.{|||,..,|,,,|({,,((,((((((,...,.,|}|.{((...,.)|}}}}||||}}}..(((.(((((({{((((((.((((((((((((((((.....{(,.(((((((((((..((..........))..))))))))))).})})))))))))))))))).(((((((({{((,,,,..............(((((.....)))))(((((..((((((((({.,|((({.....(,((((.((((...(((((((..........)).)))))...)))))))).,..({{{{{{{((((((((((.........,,}}}}.,))))))))).}},,(((((.{{....}}.))))}.....({..(.(((({{{(((,,{,,,,{{{{...,,,))|}||{((....))}}{,,.|||||,|,{||||.,.}}|}}}},.,||||||||||.|.,}}..,,.|||}},,...}},,.{{{(({{{{{|,|.{{{{,{{.,.....,.||||,,.||{,{,|,,,.{{((({((((((.{{{{{|,.,,{,(({{({{{(((({({({{.,,,{,..,,,.}}}}}...,{{{{{{|,.|{||||,|||||||}||,{|{{{{.((.((..((((((......))))))..)).)).))))}||||||||||||{{{......))))))))}{||{||,}.,..})),)))),.....{((({........})))}}}}}},((....))..,{||||,}}}|,,,,{|}},.|})),.)}))}}}}|,{{{{,,,,,...))))..,,.,})))),}})))}}|}))))))))))}}.,}}{{{(((.....)))))|{{{,{...,.,..}},))}||,}},,,}...|{,{{,((((({{.((.(((.((((....)))).))).))...}}}}}||,}|.||{{,...,...}}}||||}||,{{,||{||||(((((({....((((...)))).((((((((((,...,)))))))))){{{{{{{({{(({.,,{((((({.......})))))}{(((((((.....)))))))}((....}},,||{{{,{{.......|,.|||.|||,.}})),,))}})).)}),...{{{(..........)))}..)))))))..}}}}},})))),,..,,,,.}})))))))))))).))))).)))}..))))))))......)))))).((((((((......))))))))(((((.....))))),)}.)))))).)))...||{{{...))))}........(((((..((((((((({(((((((,(({(((((.(((((({........(((((((((.((({...})))))))..}))))......((((...((((..(((((.((((.................)))).)))))....))))))))......})))))).))))).}}}}},,))))))}.,((.((.(((((((((..(((({{{({....,}|},.((((({...})))))..(((((...(((((..(((...........)))..)))))..)))))..{{{{(({(........}}}.))))),,.((((((((.....))))))))..((((((((..................)))))))).{{{((,,,,((((((({{.{{{{((((((......)))))}....{(((....((..((((((.............))))))..))...)))}....(((((((.,...........,..,.))))))}.....(({(.,....})))})))).)})))))}}.....)}}}}.........(((((((((((((........(((((....{{,,..(((.....||,.,,,..(((,(({((,{,,..,,{,.|}}}}.}}}.....|},..))}.))}}.},....((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((({...}))).))))))).).)))}...,))))))}.)))))))))){||{|.,,....,,)))))})))),.......))).))))))))))..,))))))))))))))))...)).))}..))),})))))...))))),,.{{{..{((({((((,.{{({{{.,(((,,.,((,(({,......||.,,..}}}}|,,{|||,,|}||((((((......,}}}}}}.|}}},,))),},,}}||{{{,...,{(((((,..{{((((,{.(((,,{{{{|||.,,|||||,,{(((((((((((.........)))))))))))}..},..,))}}}},.})),})}))),..},)).}}}.....,,,,))))}},.,|||},}}}.}}}|||(((((........))))),|||,.......},)))))},.)))))).)))....,||||||{{{{{{{....,(({((({,.,(((,(((((((((({,({(((({..,.(((((..((.((({{...........{((((((...)))))))}))).)).,)))))..,})).})}}.}}}},,..}})))}))))}),},..}))))..}))}}})))))}))))}}}.{((((((((.((...(((({...}))))...)).))))))))})))),,,,...
Back