Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02350:19

Sequence Length

775 nt

GC Content

0.4194

GCUCCAUUUCUGGCCUUUGGUCUCUUUCUCGGAAAGCAGGCCUCAGUGGCCUCAGUUUCUUCCCAGAACCUGCAAUGCCCCACCAAGGUGACAAGAAGUGCAAGGAGUCGGUUUUCACUGCCAACCAAAGAGGUGACCCCCGCAAAGCAACCAUGUUGGGACAGUCCAUUUGCUGCGUUUUGAUUAUUUGCUAAGAGCAAAUACCUUUUCUGUUUGGGUUUUGCUUUUAGAAAAAAAAUGUGGCAGAUGGUGGUGGCUUUCCCCGUCAUUGAAAGAAGAAAGGUAGUAACUCUACUGGUGCACUCCUCUGAGUUGUGCUAACAAAGAAGAAUGCUGAAAGAAAAGGGAAAUGAACACCAUUUUCAGGCAGCUUCUCCAAGUUUUUUUGACAGUGUUAUAAUUUUCCUUUAGCGACUGUUGAAGCAAAUAUCUGUAUUUAUGUUCAGAUUAAACCGAGAGAGCAAAGACUGCUAAAGCCAGUAAUUUCUGGGCUGCAAAUGCAGGAUAGCUCCAGUGAAUUUCAGAUUCUUAAAGGUUUUUGCUGUAGCGAAUUCAUGACACAAAGCAUUUGGAGGGAAACCUAUUAGAGAAGAAACACAUCCUAAAUGAGAAUUACUGAGGACGGGAGGCUCUUGUCAUUUAUUGGAUUAGUUAUAGCACUUUACACAAGCCUGUAAUAUUUGUUCUGCUGCUGUGGUGUGACUGGUAAAAUGAAAAGGUAUGUCAAGGGAGUGCUUGACUGACGUUCUUAUUUCUUCCGUCUUCUUAUAUUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-215 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -230.7

Frequency: 0.0000

Diversity: 202.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((..((((...((((((((((...))))).))))).....))))...(((((((((((((...(((..((.((((.((.(((.........(((..((.((((((.......))).(((.....))))))))..))).....))).)).)))).))..((((((((((((((((.....(((.(((((((((((..((..........))..))))))))))).))))))))))))))))))).((.((....))))(((((.(((.........((((.....))))((((((((((....))).))))))).....(.((((.((((...(((((((..........)).)))))...)))))))).)..((((((((((((((((((...........)))).)))))))))).))))(((((.((....)).))))).....((..(.((((((((((..(((..((((......)))).((((....))))............(((((...))))))))..)))))))))).)..))..)))))))).....))))))))(((....)))......)))))))).......))))).))......((((((((((((.........((((((..((((((((((.(((........(((..(((..........))).)))))).))))))))))..))))))((.((..((((((......))))))..)).))......))))))))))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{,,,{{{,..((((.,.((((((((((..,|}}}}.}||||.....))))...((((((((.,,|,.,|||{,.,,,{{((,{{.{|||........|{|..{(.((((((,,,...,}}}.{{{.....)})))}|},.}}}..,,.}}}.)),)))).,,..((((((((((((((((.....{(,.(((((((((((..((..........))..))))))))))).})})))))))))))))))),|{|||||{||}|,{(({,,{{,........{((((.....))))|(((((((((....)))}}))))),.....{.((((.((((...(((((((,.........)).)))))...)))))))).,..{({{((((((((((((((...........)))).}))))))))).}}},(((((.{{....}}.))))).....((..(.((((((((((..{{{,||{|{.,{,,,|||||{(((....}},||..,,},))}}.|||||.,.},}}}}}}..)))))))))).)..))..})}))))).,,,,}},}}))}|}}},,}))}.,,,}.)))))})).......,}}})}}|,,....((((((((((((,....,|,.{(({{{..((((((((((.(((....,,..(((..{{{......,,..,)}.)}}))).))))))))))..))))),{(.((..((((((......))))))..)).)}......}))))))))))).......,,.