Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02350:20

Sequence Length

1310 nt

GC Content

0.4450

CCAGCCAGCUACUGAACCUUAUGUGUGCCUAGGGGCCAUUUUGAGACAAUUUGCUGAAUAUUAAAAGUACAACCAAUAAUGUUUCUCUCCACAUCCACAAUAGCGCUUAGAGGAAGCAUCUGGGAUUGAGCCAUCUCACAUCUGUCUAAUCACAUUCAUUCAAAUGUGAUGGGCCCAACUGGCCUACGUACAUGGCUGCAUAUCACCAUGGGUGGAAAUUAAAUCAGAAUUUGGCUCAGGAGAGAGAUGAAGAGAAAAUGCACGUAGAUAAUUGGCUCAGAUAACAUUCUGUUUCUGGAAGUCACAAAGAGUGGAAAUUGGAAUAUGUAAAUUAAAGAAAAACAGUCCUUAAGAUCAAGUCCGCAAUGGAAGAAGAGCAUUCAUCUGGUACAGGUUGAUGAUUGUGUAAGCCCAAGGAGUGAUGUCAACACUGGGGUUCACCUGAGAACAUGGACAUGGUUGAUGAGGGUUUAGGAGAUGCUCAUACGAAGUCUUCAUAUGUUCCCUGGAUCCCAGCUCUGCCUUCCCACCAGAGAGGAUGUAAUUCAGCCGAGAUGCCCAGAGUCAGCUCUCUGCUCAUAUCUGUUCCGCACUGAAGCCAAUCAUCUGAGAAACCUAAGAAGUGUUUAAUGUAGUUAGGAAAGUGAGGGAUGAAGACCAUAAAUUCCUUUUCAUGUAGCAGAGUAUAUAUGUGAUACUCAUUCUGUGGUAUUUGGGGCAUAAACAAGAGUCGAUGAAGGAAUGUGAAAGUACUCGAAAUCCUGACUUUUAUCUCUAUAAAAAUGGCAUAGGGAUGAAACACACUUGGUUGUUAUGACUGUACUCUUUUCAGAUUUACUACUUGCCUUUCUACUGAUUUUUCUGUGCCACAGGUCUUGACUCCUGUAGGCUAAAUUUCUCAGCCUCUUCUGCUCACUGAUAUAUGGGAAGGUUUGGCCAAAGGUGGGUGACUGGUGGGGAGAAGGAUGAGGGAAUUCAGGGGAUUGCUGAGCCCAUUCUCUAGACAGUGCUGCUGGCACUGGCUCUGUCUUCUCCGUUUCCAUCUCGCAUCAGACGGUUCUUCCCUCUAUGGGCCUAGUCCUACCUAGACACUUUCCAGUUGGAUUCCAGUUCUGGGGAUGCUCCCUCCUGCAGGGAUCUAAGUCCUUCCCAUUGUCUUCGGCUCCUGGGCUCAGCUAGAACCAUCUUUUCCCAUUGUCCCUGUGGUGCUAGGGCUUUCAGUGGUUAUUAACGUCUGUGUUGUAUCAUCUUGCCUGAAUUUCAGCUCUCUGUAACCAGUUCCCCAAAUAAAAUUCCCCCCAUUUACCUAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-373.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -396.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 340.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((............((((((.(((...(((((......(((((...((((..........))))...(((...(((((((.(((....................)))))))))).)))(((((((....)))).)))))))).((((((((......)))))))).)))))....))).))))))..)))))).((((((...(((((((((.........((((((((((((((((.(((((..(.((((((..((.(((((.....(((.((((......)))).((((((...((((.....))))...))))))...((((((((((((...((((((.....((((((((((.....))..(((..((((((.((((((..((((.((((((....((..((...))..))..))))...((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((((...)))).))))))).).))))....))))))).)))))))))).)).))))....))))))..))))))..)))..((.(((((((((((((..((((..(((.............)))..).)))......(((.((....)).)))..((((..(((.....(((((..((.((........)).))..)))))...)))..))))((((((.......)))))))))))).))))))).)).(((..((....))..))).((((...(((......)))...))))...((((((((((((.........))))))))))))...)))))))).....))))))..)))))...))))))).....)))..)))))))..)))))).).......)))))..))))))..)))))))))).........))))))))).))))))(((((..((..(.........((((.((((((((.((((((((((((((((((...(((((..((.(((((............((((((...))))))))))).))..))))))))))).....(((.(((((((((((........(((((((((.....((.(((((......(.(((((((((.((...(((((...)))))...)).))))))))).).........)))))..))...)))))))))...))))))........((((((.(((((......)))))....))))))........))))))))....)))))))((.(((...)))))))))).).))))))).))))......)..)).)))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((({..{((...((.((((((.((..((((((.....(((((.({{{(({(..........})},..........,((((((((((..{{((.{,...{.{{{{.,,,.)))),}.))))}}(((((((.,|,,..||||,,,.((((((((......)))))))){((((.....))))),||..{{{({.||.....}}}}}}},|}}|,........,}}},..))))))}))))))))}}..(.((((((..((.(((((.....(((.((((.,,,..}})),||||||...((((.....)))}...,}}}}}...((((((({((((...((((((.....((((((((((,...,)),.(((..((((((.((((((..((((.(({{{(,,..,,.,((...}}.,},..}})}.,.((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((({...}))).))))))).).)))}...,))))))}.)))))))))).}).))))....))))))..))))))..))).{((.(((((((((((((.({..((((((({({....,{(((.{((({...,....{.{({.{{...,||.}}}.},}}},..,.}}}}..))||,},|{((|{{...........,}))))),.}))).)))))))..........,,.}).)))))).))))))).)),}........,{{{{.....((((...(((......)))...))))}}}||((((((((((.........))))))))))}....,)))))))...,.))))))..))))),..))))))).....)))..)))))))..)))))).)((((((((........))))).)))}})))))))))))))))...)).))}..,.)}}.)),..))}})))).....((((((((.(((.((((({..(((((((((((....{((,,..(({(((((({..,,..{{{((((({,...||||||||,,|{||{{,,,||{,,,......,|,,..|||}||,,|,.{{{....,|||,{{((......|,||||{....,,|}{((((((((.((...(((({...)))))...)).))))))))},},,....}},)))))..))...,)))))))))}.}},,)).....}}}}}.}}}))){{,{{{{{{.||||{{{{||||||,...{{{{|...,}))}).}}})}},...}}}}}...,)))))),,}),,)))},,............,)))))))).))))))))