Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02350:3

Sequence Length

1606 nt

GC Content

0.4608

GGCGCACUUUCCCCGCCUGCAUCUGAGGCGUGGCGCAGCUGGGAGCAAAGCACAGCUCCAUUUCUGGCCUUUGGUCUCUUUCUCGGAAAGCAGGCCUCAGUGGCCUCAGUUUCUUCCCAGAACCUGCAAUGCCCCACCAAGGUGACAAGAAGUGCAAGGAGUCGGUUUUCACUGCCAACCAAAGAGGUGACCCCCGCAAAGCAACCAUGUUGGGACAGUCCAUUUGCUGCGUUUUGAUUAUUUGCUAAGAGCAAAUACCUUUUCUGUUUGGGUUUUGCUUUUAGAAAAAAAAUGUGGCAGAUGGUGGUGGCUUUCCCCGUCAUUGAAAGAAGAAAGGAGCAUCUUUGAAAGCUGAGCUAGAGGCGGAGCAACUGGUAAACCAGAUGUCCCAAAUUUCUAGCGCUUAGAGGAAGCAUCUGGGAUUGAGCCAUCUCACAUCUGUCUAAUCACAUUCAUUCAAAUGUGAUGGGCCCAACUGGCCUACGUACAUGGCUGCAUAUCACCAUGGGUGGAAAUUAAAUCAGAAUUUGGCUCAGGAGAGAGAUGAAGAGAAAAUGCACGUAGAUAAUUGGCUCAGAUAACAUUCUGUUUCUGGAAGUCACAAAGAGUGGAAAUUGGAAUAUGUAAAUUAAAGAAAAACAGUCCUUAAGAUCAAGUCCGCAAUGGAAGAAGAGCAUUCAUCUGGUACAGGUUGAUGAUUGUGUAAGCCCAAGGAGUGAUGUCAACACUGGGGUUCACCUGAGAACAUGGACAUGGUUGAUGAGGGUUUAGGAGAUGCUCAUACGAAGUCUUCAUAUGUUCCCUGGAUCCCAGCUCUGCCUUCCCACCAGAGAGGAUGUAAUUCAGCCGAGAUGCCCAGAGUCAGCUCUCUGCUCAUAUCUGUUCCGCACUGAAGCCAAUCAUCUGAGAAACCUAAGAAGUGUUUAAUGUAGUUAGGAAAGUGAGGGAUGAAGACCAUAAAUUCCUUUUCAUGUAGCAGAGUAUAUAUGUGAUACUCAUUCUGUGGUAUUUGGGGCAUAAACAAGAGUCGAUGAAGGAAUGUGAAAGUACUCGAAAUCCUGACUUUUAUCUCUAUAAAAAUGGCAUAGGGAUGAAACACACUUGGUUGUUAUGACUGUACUCUUUUCAGAUUUACUACUUGCCUUUCUACUGAUUUUUCUGUGCCACAGGUCUUGACUCCUGUAGGCUAAAUUUCUCAGCCUCUUCUGCUCACUGAUAUAUGGGAAGGUUUGGCCAAAGGUGGGUGACUGGUGGGGAGAAGGAUGAGGGAAUUCAGGGGAUUGCUGAGCCCAUUCUCUAGACAGUGCUGCUGGCACUGGCUCUGUCUUCUCCGUUUCCAUCUCGCAUCAGACGGUUCUUCCCUCUAUGGGCCUAGUCCUACCUAGACACUUUCCAGUUGGAUUCCAGUUCUGGGGAUGCUCCCUCCUGCAGGGAUCUAAGUCCUUCCCAUUGUCUUCGGCUCCUGGGCUCAGCUAGAACCAUCUUUUCCCAUUGUCCCUGUGGUGCUAGGGCUUUCAGUGGUUAUUAACGUCUGUGUUGUAUCAUCUUGCCUGAAUUUCAGCUCUCUGUAACCAGUUCCCCAAAUAAAAUUCCCCCCAUUUACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-502.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -529.51

Frequency: 0.0000

Diversity: 371.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..(((((((((((((.......))))).(((.(((...(((((........)))))....))))))...((((((((((...))))).)))))((((((((..(((.((((....)))).)))....)).(((((..(((((.......(((..((.((((((.......))).(((.....))))))))..)))..(((.((((((((((((((.((((((((((((((((.....(((.(((((((((((..((..........))..))))))))))).))))))))))))))))))).((((((((((((.................(((.((.(((((..((((...((((((((.((.(((.((((....)))).))).))...)))))))))))).))))).)).)))))))..))))))))......)))))).((((((((......))))))))(((((.....))))).)).)))))).)))...)))))...))))).........(((((...((((.....(((((((..(.((((((..((.(((((.....(((.((((......)))).((((((...((((.....))))...))))))...((((((((((((...((((((.....((((((((((.....))..(((..((((((.((((((..((((.((((((....((..((...))..))..))))...((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((((...)))).))))))).).))))....))))))).)))))))))).)).))))....))))))..))))))..)))..((.(((((((((((((..((((..(((.............)))..).)))......(((.((....)).)))..((((..(((.....(((((..((.((........)).))..)))))...)))..))))((((((.......)))))))))))).))))))).)).(((..((....))..))).((((...(((......)))...))))...((((((((((((.........))))))))))))...)))))))).....))))))..)))))...))))))).....)))..)))))))..)))))).)((((((((........))))).)))...)))))))))))..)))))..)))))).....))))))))...))).....((((.((((((((.((((((((((((((((((...(((((..((.(((((............((((((...))))))))))).))..))))))))))).....(((.(((((((((((........(((((((((.....((.(((((......(.(((((((((.((...(((((...)))))...)).))))))))).).........)))))..))...)))))))))...))))))........((((((.(((((......)))))....))))))........))))))))....)))))))((.(((...)))))))))).).))))))).))))........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((..(((((((((((((.......))))).(((,(((..,(((((........)))))....))))})...{{{{{{{(((,.,|||||,|||||.,,,,|||},,{|,|{{|,,,.)))).))),...}}}(((((..(((((.......(((..((.(((({(.......}}}.{{{...,,)}))))))..))}..(((.(((((({(((((((.((((((((((((((((.....{(,.(((((((((((..((..........))..))))))))))).})})))))))))))))))).((((((((((((...,.............{((.((.(((((..((((...((((((((.((.(((.((((....)))).))).))...)))))))))))).))))).)).)))))))..))))))))......)))))).((((((((......))))))))(((((.....))))).}}.)))))).)))...})))).},)}))).......,,{(({{,,{((({(((((({({({({.(.((((((..((.(((((.....(((,((((.,,,..}})),||||||...{(((.....)))}...,}}}},...((((((({((((...((((((.....((((((((((,...,)),.(((..((((((.((((((..((((.(({{{(,,..,,.,((...}}.,},..}})}.,.((((((((((...(.((((((((((.(.((..(((((.((({...}))).))))))).).)))}...,))))))}.)))))))))).}).))))....))))))..))))))..))).{((.(((((((((((((.({..((((((({({....,{(((.{((({...,....{.{({.{{...,||.}}}.},}}},..,.}}}}..))||,},|{((|{{...........,}))))),.}))).)))))))..........,,.}).)))))).))))))).)),}........,{{{{.....((((...(((......)))...))))}}}||((((((((((.........))))))))))}....,)))))))...,.))))))..))))),..))))))).....)))..)))))))..)))))).}{{{{{{{|,,,,..,,))))}.))),,,,}}}})}}.}},,)))))}}))))))}....))))))))...))).....(((({((,(((,({((((,.(((((((((((....{(({,..(({((((({{..,,..{{{((((({,...||}|||||,,|{||{,,,,}|{,}},,....,|,,.,||||||,,{{.,{,....,|||{((((.....,|.||{{{....,,||{((((((((.((...(((({...)))))...)).))))))))),},,....,,,)))))..))...,)))))))))}.}},,)).....}}}||,|||}||{{{,{,{{{.||||{{{{||||||,...,{{{|,,,,}))}}.,}})}},,,.||||}...,)))))),,}),})))},,.,,,,........}}}}}}}}.}})))),